More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06446 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  100 
 
 
959 aa  1933    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06445  bifunctional hemolysin-adenylate cyclase  93.49 
 
 
860 aa  694    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06448  hemolysin A  38.06 
 
 
1112 aa  434  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  29.13 
 
 
1814 aa  261  3e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  32.27 
 
 
1499 aa  251  4e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  30.39 
 
 
1480 aa  241  5e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2204  peptidase M23  30.35 
 
 
999 aa  237  8e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1963  hypothetical protein  29.02 
 
 
1306 aa  187  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1250  hypothetical protein  45.93 
 
 
541 aa  175  3.9999999999999995e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1000  Hemolysin-type calcium-binding region  43.3 
 
 
844 aa  171  4e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.862975  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  44.2 
 
 
4798 aa  169  2e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1592  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  39.68 
 
 
1789 aa  165  3e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0991  hypothetical protein  43.3 
 
 
679 aa  165  4.0000000000000004e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1648  hemolysin-type calcium binding protein  37.41 
 
 
940 aa  164  8.000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  37.9 
 
 
1156 aa  162  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1512  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  41.14 
 
 
2107 aa  160  2e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.821841  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  38.96 
 
 
2954 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  38.93 
 
 
855 aa  153  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  38.19 
 
 
3598 aa  152  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  33.26 
 
 
1534 aa  151  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0102  putative calcium binding hemolysin protein  31.14 
 
 
1217 aa  146  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  36.18 
 
 
3619 aa  143  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  33.1 
 
 
1532 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  35.75 
 
 
946 aa  139  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  33.79 
 
 
2667 aa  137  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0299  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  35.08 
 
 
1607 aa  134  6e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6773  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  33.7 
 
 
1925 aa  134  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395302  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  34.69 
 
 
2911 aa  134  6e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0994  hypothetical protein  50.38 
 
 
585 aa  133  2.0000000000000002e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  35.15 
 
 
1363 aa  133  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  33.25 
 
 
595 aa  133  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  34.31 
 
 
1279 aa  132  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0997  hypothetical protein  48.98 
 
 
582 aa  128  4.0000000000000003e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1186  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  41.04 
 
 
618 aa  128  6e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  33.17 
 
 
1400 aa  124  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  36.08 
 
 
3619 aa  124  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  35.47 
 
 
2775 aa  124  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  32.74 
 
 
4334 aa  123  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  30.57 
 
 
3608 aa  123  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.01 
 
 
1795 aa  122  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  35.31 
 
 
1895 aa  120  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  32.13 
 
 
4687 aa  120  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  33 
 
 
526 aa  119  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1504  cadherin  28.36 
 
 
1421 aa  119  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0750801  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  48.24 
 
 
260 aa  119  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1754  large exoprotein involved in heme utilization or adhesion  38.69 
 
 
1809 aa  119  3.9999999999999997e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0481615 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1191  ApxIVA Var3  35.58 
 
 
428 aa  118  6.9999999999999995e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.171556  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3629  hemolysin-type calcium-binding region  30.92 
 
 
589 aa  117  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.170344 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1441  Ig family protein  26.52 
 
 
2245 aa  117  1.0000000000000001e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.195412  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.29 
 
 
3427 aa  117  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  47.98 
 
 
686 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1194  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  34.3 
 
 
928 aa  115  5e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.62 
 
 
1236 aa  115  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  35.03 
 
 
1424 aa  114  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  29.65 
 
 
1079 aa  114  8.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1113  hemolysin-type calcium-binding region; RTX toxin  31.78 
 
 
437 aa  113  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  31.54 
 
 
2105 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  32.91 
 
 
4800 aa  113  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  34.3 
 
 
980 aa  112  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  46.39 
 
 
460 aa  112  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  30.82 
 
 
556 aa  112  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  30.3 
 
 
795 aa  112  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  31.3 
 
 
965 aa  111  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2775  hemolysin-type calcium-binding region  30.84 
 
 
437 aa  111  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256809  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  34.58 
 
 
387 aa  110  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  33.84 
 
 
1164 aa  110  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  34.18 
 
 
491 aa  109  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  45.33 
 
 
2885 aa  108  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2501  Cadherin  33.99 
 
 
942 aa  108  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.390828  normal  0.873412 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  31.09 
 
 
3954 aa  108  5e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  44.58 
 
 
2668 aa  108  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2690  hemolysin-type calcium-binding region  29.37 
 
 
767 aa  108  7e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.969151  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0104  putative hemolysin-type calcium-binding protein  27.22 
 
 
960 aa  106  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2962  hypothetical protein  37.35 
 
 
326 aa  107  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0055172  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  42.6 
 
 
709 aa  106  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  43.86 
 
 
1963 aa  106  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  30.82 
 
 
1145 aa  105  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8151  CHRD domain containing protein  45.78 
 
 
460 aa  104  8e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159577  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  29.35 
 
 
1855 aa  104  9e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  34.23 
 
 
518 aa  103  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2206  Cadherin  28.11 
 
 
928 aa  103  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.802036  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  35 
 
 
833 aa  103  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.21 
 
 
1016 aa  103  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1114  hemolysin-type calcium-binding toxin  55 
 
 
280 aa  103  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.437868  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  30.67 
 
 
9867 aa  103  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  43.58 
 
 
421 aa  102  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1623  hypothetical protein  32.01 
 
 
613 aa  102  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.54291  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.67 
 
 
588 aa  102  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  31.28 
 
 
2689 aa  102  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.22 
 
 
2678 aa  102  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  33.73 
 
 
2145 aa  102  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4004  hemolysin-type calcium-binding region  31.9 
 
 
424 aa  101  7e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2776  hemolysin-type calcium-binding toxin  54.17 
 
 
280 aa  100  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.784877 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  29.11 
 
 
3209 aa  100  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.8 
 
 
1415 aa  100  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  30.31 
 
 
1544 aa  99.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  41.45 
 
 
950 aa  100  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2577  hemolysin-type calcium-binding region  35.5 
 
 
1383 aa  99.8  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0100249  normal  0.0162919 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  41.21 
 
 
813 aa  99.4  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  34.85 
 
 
615 aa  99  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>