More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06386 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE1195  prolyl endopeptidase  48.68 
 
 
685 aa  645    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00494828  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0086  prolyl endopeptidase  67.68 
 
 
723 aa  1018    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2323  Prolyl oligopeptidase  53.05 
 
 
685 aa  726    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4245  Prolyl oligopeptidase  51.1 
 
 
688 aa  688    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5257  Prolyl oligopeptidase  52.03 
 
 
701 aa  680    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4307  Prolyl oligopeptidase  51.1 
 
 
688 aa  689    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.17426  normal  0.0613524 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0810  peptidase S9A prolyl oligopeptidase domain protein beta-propeller  68.24 
 
 
708 aa  986    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0462  prolyl oligopeptidase  50.73 
 
 
689 aa  703    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.14887 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2458  Prolyl oligopeptidase  64.22 
 
 
713 aa  922    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.768929  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02385  Prolyl endopeptidase  67.55 
 
 
719 aa  1000    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001226  serine protease of the peptidase family S9A  65.44 
 
 
677 aa  942    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3925  Prolyl oligopeptidase  49.13 
 
 
695 aa  659    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.999576  normal  0.0353969 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1313  prolyl oligopeptidase  67.21 
 
 
700 aa  966    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2782  prolyl oligopeptidase  66.9 
 
 
724 aa  1025    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.119974  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3157  prolyl oligopeptidase  48.27 
 
 
703 aa  685    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.385606  hitchhiker  0.000562539 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001383  prolyl endopeptidase  82.59 
 
 
719 aa  1248    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4608  Prolyl oligopeptidase  50.72 
 
 
703 aa  669    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.638407  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06386  peptidase  100 
 
 
730 aa  1503    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4948  prolyl oligopeptidase  51.68 
 
 
689 aa  698    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05093  protease  63.97 
 
 
679 aa  926    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0746  Prolyl oligopeptidase  52.96 
 
 
688 aa  710    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6402  Prolyl oligopeptidase  46.51 
 
 
745 aa  621  1e-176  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2091  prolyl oligopeptidase  44.37 
 
 
718 aa  617  1e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000105582  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0382  Prolyl oligopeptidase  47.3 
 
 
685 aa  612  1e-173  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.450015  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1522  prolyl oligopeptidase  46.77 
 
 
696 aa  610  1e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.2073  normal  0.773785 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2736  prolyl oligopeptidase  47.37 
 
 
714 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.304191  hitchhiker  0.00018874 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2753  prolyl endopeptidase  44.34 
 
 
727 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2569  prolyl oligopeptidase  46.31 
 
 
718 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000045371  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2543  Prolyl oligopeptidase  44.04 
 
 
727 aa  598  1e-169  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000249468  hitchhiker  0.000000327157 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1602  prolyl oligopeptidase  43.77 
 
 
729 aa  598  1e-169  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000159045  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2373  prolyl oligopeptidase  44.06 
 
 
727 aa  598  1e-169  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000160004  normal  0.331023 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2445  prolyl oligopeptidase  43.92 
 
 
727 aa  597  1e-169  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000119752  normal  0.316847 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2536  prolyl oligopeptidase  43.71 
 
 
726 aa  595  1e-169  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000370848  normal  0.321881 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1737  prolyl oligopeptidase  43.91 
 
 
727 aa  597  1e-169  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000036721  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1780  prolyl oligopeptidase  43.91 
 
 
727 aa  596  1e-169  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000219198  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1741  prolyl oligopeptidase  43.91 
 
 
727 aa  596  1e-169  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000789532  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2893  Prolyl oligopeptidase  45.24 
 
 
682 aa  591  1e-167  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.114884 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1978  prolyl oligopeptidase  45.19 
 
 
719 aa  583  1.0000000000000001e-165  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.370537 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1852  prolyl oligopeptidase  45.58 
 
 
718 aa  578  1e-164  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0419328  normal  0.988399 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01001  Prolyl endopeptidase  44.85 
 
 
719 aa  582  1e-164  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1324  prolyl oligopeptidase  43.91 
 
 
710 aa  572  1.0000000000000001e-162  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.198944 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2525  prolyl oligopeptidase  45.56 
 
 
711 aa  572  1.0000000000000001e-162  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440403  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2524  prolyl oligopeptidase  40 
 
 
714 aa  523  1e-147  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.260792  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0129  Prolyl oligopeptidase  36.99 
 
 
726 aa  496  1e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1967  Prolyl oligopeptidase  38.62 
 
 
670 aa  493  9.999999999999999e-139  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00433613  normal  0.203518 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0615  prolyl oligopeptidase  37.59 
 
 
719 aa  482  1e-134  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4142  prolyl oligopeptidase  38.72 
 
 
707 aa  478  1e-133  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.199893 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  36.26 
 
 
1283 aa  439  9.999999999999999e-123  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1339  Prolyl oligopeptidase  35.29 
 
 
703 aa  435  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.234666  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7338  Prolyl oligopeptidase  35.84 
 
 
690 aa  427  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2940  Prolyl oligopeptidase  34.92 
 
 
713 aa  412  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000682776  hitchhiker  0.000230055 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2543  prolyl oligopeptidase  36.27 
 
 
690 aa  412  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.768819  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6440  Prolyl oligopeptidase  34.93 
 
 
666 aa  408  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.575381  normal  0.082879 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3951  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  34.92 
 
 
740 aa  397  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.26671  normal  0.109471 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1536  Prolyl oligopeptidase  33.91 
 
 
692 aa  398  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469574  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2212  prolyl oligopeptidase  35.95 
 
 
702 aa  395  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3423  Prolyl oligopeptidase  34.18 
 
 
697 aa  393  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1137  Prolyl oligopeptidase  33.95 
 
 
705 aa  389  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3530  Prolyl oligopeptidase  34.48 
 
 
717 aa  385  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.345733  normal  0.681062 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7340  Prolyl oligopeptidase  34.29 
 
 
709 aa  377  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021168 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2982  Prolyl oligopeptidase  34.38 
 
 
704 aa  376  1e-103  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.35677  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1604  prolyl oligopeptidase  34.05 
 
 
723 aa  374  1e-102  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.115584  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1364  Prolyl oligopeptidase  33.15 
 
 
742 aa  347  6e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.199496  hitchhiker  0.000136214 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1856  prolyl oligopeptidase  30.54 
 
 
686 aa  301  4e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.149667  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1041  Prolyl oligopeptidase  30.19 
 
 
704 aa  291  4e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.726536  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1444  Prolyl oligopeptidase  28.67 
 
 
734 aa  287  5e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1498  Prolyl oligopeptidase  27.9 
 
 
730 aa  281  3e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0781  prolyl oligopeptidase  28.88 
 
 
733 aa  274  3e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.515058  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1786  oligopeptidase B  28.88 
 
 
688 aa  266  7e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1010  oligopeptidase B  27.93 
 
 
732 aa  263  1e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.371768  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5032  prolyl oligopeptidase  29.67 
 
 
718 aa  262  2e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1129  Prolyl oligopeptidase  29.68 
 
 
614 aa  257  5e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.107697  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1781  oligopeptidase B  28.47 
 
 
678 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2995  oligopeptidase B  30.49 
 
 
715 aa  254  3e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0563376 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2328  oligopeptidase B  27.83 
 
 
697 aa  253  7e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0142443 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47360  putative oligopeptidase  28.7 
 
 
683 aa  253  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2371  prolyl oligopeptidase  27.26 
 
 
690 aa  252  2e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1757  prolyl oligopeptidase  29.77 
 
 
696 aa  250  8e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0107679 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3621  Oligopeptidase B  29.37 
 
 
696 aa  247  4.9999999999999997e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1579  oligopeptidase B  27.23 
 
 
682 aa  247  6e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.767471  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0029  Oligopeptidase B  26.5 
 
 
685 aa  245  1.9999999999999999e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0862  oligopeptidase B  26.19 
 
 
700 aa  244  6e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127463  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4087  putative oligopeptidase  28.32 
 
 
683 aa  243  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6532  Oligopeptidase B  27.26 
 
 
721 aa  241  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0448855  normal  0.250213 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1399  oligopeptidase B  27.47 
 
 
684 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.357658  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3635  prolyl oligopeptidase  29.51 
 
 
697 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3588  prolyl oligopeptidase  28.71 
 
 
695 aa  241  4e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.331687  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4277  Prolyl oligopeptidase  26.21 
 
 
705 aa  238  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3959  oligopeptidase B  27.61 
 
 
708 aa  239  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3890  oligopeptidase B  26.91 
 
 
680 aa  238  3e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2232  prolyl oligopeptidase  40.98 
 
 
696 aa  238  4e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000449493 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2691  oligopeptidase B  27.48 
 
 
701 aa  236  1.0000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2098  prolyl oligopeptidase  29.99 
 
 
701 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0491197  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0551  Oligopeptidase B  27.26 
 
 
678 aa  236  1.0000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2047  prolyl oligopeptidase family protein  29.22 
 
 
697 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0421  peptidase, S9A/B/C family protein  26.9 
 
 
696 aa  235  3e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0147538  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1306  oligopeptidase B  26.98 
 
 
680 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.159223  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03460  oligopeptidase B  26.2 
 
 
703 aa  234  5e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0568  protease II  26.61 
 
 
702 aa  233  9e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31333  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4583  oligopeptidase B  26.7 
 
 
680 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>