More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06300 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06300  methylphosphotriester-DNA alkyltransferase  100 
 
 		 302 aa  618  1e-176  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003322  hypothetical protein  46.23 
 
 		 310 aa  276  2e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.757084  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0009  helix-turn-helix domain-containing protein  43.71 
 
 		 306 aa  260  3e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000070115 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0910  HTH-type transcription regulator, AraC-family  43.56 
 
 		 298 aa  240  2e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.576456  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2797  transcription activator effector binding  28.28 
 
 		 279 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.338998 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6275  AraC family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 279 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1790  transcriptional regulator, AraC family  30.1 
 
 		 282 aa  125  9e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.191731  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0261  AraC family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 281 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7157  transcriptional regulator, AraC family  27.36 
 
 		 277 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4053  AraC family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 277 aa  113  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1170  transcriptional regulator, AraC family  27.96 
 
 		 300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1216  AraC family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3142  AraC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2210  transcriptional regulator, AraC family  28.62 
 
 		 291 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0278  transcriptional regulator, AraC family  24 
 
 		 290 aa  110  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4171  transcriptional regulator, AraC family  27.96 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1271  transcriptional regulator, AraC family  27.63 
 
 		 300 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4724  AraC family transcriptional regulator  24.67 
 
 		 290 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440387  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5086  AraC family transcriptional regulator  24.67 
 
 		 290 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1036  AraC family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 300 aa  109  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1014  AraC family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 300 aa  109  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.210728  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1114  AraC family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 300 aa  109  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1021  AraC family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 300 aa  109  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2556  AraC family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 290 aa  109  7.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000235949  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1784  AraC family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 280 aa  108  8.000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000275244  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4973  transcriptional regulator, AraC family  24.33 
 
 		 290 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2678  transcriptional regulator, AraC family  27.48 
 
 		 284 aa  108  8.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4947  transcriptional regulator, AraC family  24.67 
 
 		 290 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4986  AraC family transcriptional regulator  24.33 
 
 		 290 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1013  AraC family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.126228  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1194  transcriptional regulator, AraC family  26.97 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3174  AraC family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.626893  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0019  transcriptional regulator, AraC family  28.81 
 
 		 314 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2938  AraC family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 279 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487848  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3715  transcriptional regulator, AraC family  25.08 
 
 		 279 aa  106  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.424878 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4582  AraC family transcriptional regulator  24 
 
 		 290 aa  106  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.763033  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1952  AraC family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 271 aa  105  6e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0598764  normal  0.641899 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3417  transcriptional regulator, AraC family  25.59 
 
 		 279 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.27768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0771  AraC family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 288 aa  104  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.472166 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4566  AraC family transcriptional regulator  23.67 
 
 		 290 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0424  transcriptional regulator, AraC family  27.67 
 
 		 281 aa  103  5e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3846  transcriptional regulator, AraC family  26.07 
 
 		 287 aa  102  5e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4672  AraC family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 290 aa  102  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3161  AraC family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 277 aa  102  8e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3503  transcription activator, effector binding  28.52 
 
 		 294 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00111619  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3264  transcriptional regulator, AraC family  26.06 
 
 		 287 aa  100  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1922  transcriptional regulator, AraC family  27.42 
 
 		 291 aa  99.8  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.890213  normal  0.89853 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4957  transcriptional regulator, AraC family  23.67 
 
 		 290 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3053  transcriptional regulator, AraC family  29.19 
 
 		 296 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2323  transcriptional regulator, AraC family  27.15 
 
 		 289 aa  99  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.614848  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2107  AraC family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 313 aa  98.2  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.342925  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0011  transcriptional regulator, AraC family  28.24 
 
 		 285 aa  97.4  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871788  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1890  AraC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 120 aa  98.2  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.520011  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2167  transcriptional regulator, AraC family  27.74 
 
 		 283 aa  96.3  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273156  normal  0.0865176 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3086  transcriptional regulator, AraC family  28.33 
 
 		 296 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.164604  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3088  AraC family transcriptional regulator  29 
 
 		 296 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.530109  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0971  AraC family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 136 aa  94.4  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000205729  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3138  AraC family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 281 aa  93.6  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1474  transcriptional regulator, AraC family  28.9 
 
 		 286 aa  93.2  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2466  transcriptional regulator, AraC family  40.38 
 
 		 313 aa  92.8  6e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1224  AraC family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 288 aa  92.8  6e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0494811  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1523  AraC family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 152 aa  92.8  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00364512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0946  transcriptional regulator, AraC family  26.48 
 
 		 286 aa  92.8  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.584518  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3673  transcriptional regulator, AraC family  24.76 
 
 		 295 aa  91.7  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0140  AraC family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 293 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.877598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2836  AraC family transcriptional regulator  28 
 
 		 296 aa  90.5  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00254989  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3069  transcriptional regulator, AraC family  27.67 
 
 		 296 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000611  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  24.26 
 
 		 289 aa  90.1  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0208776  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2843  AraC family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 296 aa  90.1  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.538425  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3057  AraC family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 296 aa  90.1  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.118978  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2759  AraC family transcriptional regulator  26.3 
 
 		 292 aa  90.1  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0693  transposon Tn10 TetD protein  41.41 
 
 		 113 aa  89.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.808673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0634  transposon Tn10 TetD protein  41.41 
 
 		 113 aa  89.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3867  transcriptional regulator, AraC family  35.34 
 
 		 295 aa  89.4  6e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000535009  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2755  transcriptional regulator, AraC family  40.4 
 
 		 300 aa  89.7  6e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04272  DNA-binding transcriptional activator  30.9 
 
 		 289 aa  89.4  7e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3601  transcriptional regulator, AraC family  30.9 
 
 		 289 aa  89.4  7e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04237  hypothetical protein  30.9 
 
 		 289 aa  89.4  7e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4943  right origin-binding protein  30.9 
 
 		 289 aa  89.4  7e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4994  right origin-binding protein  30.9 
 
 		 289 aa  89.4  7e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5910  right origin-binding protein  30.9 
 
 		 289 aa  89.4  7e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1956  transcriptional regulator, AraC family  26.74 
 
 		 283 aa  89.4  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0993473  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4946  right origin-binding protein  30.9 
 
 		 289 aa  89.4  7e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.96055 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3660  AraC family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 289 aa  89.4  7e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4632  right origin-binding protein  30.9 
 
 		 289 aa  89.4  7e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5265  transcriptional regulator, AraC family  24.84 
 
 		 281 aa  89  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1217  transcription activator, effector binding  43.14 
 
 		 288 aa  89.4  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1931  AraC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 118 aa  89  9e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0129269  hitchhiker  0.0018191 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4996  right origin-binding protein  30.64 
 
 		 289 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4944  right origin-binding protein  30.64 
 
 		 289 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4837  right origin-binding protein  30.64 
 
 		 289 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2816  AraC family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 296 aa  88.6  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2776  AraC family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 296 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4998  right origin-binding protein  30.64 
 
 		 289 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4910  right origin-binding protein  30.64 
 
 		 289 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2929  AraC family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 293 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0126  AraC family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 293 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.436666  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0371  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 288 aa  89  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0526  transcriptional regulator, AraC family  37.96 
 
 		 129 aa  87.8  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000198595  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1472  AraC family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 294 aa  87.8  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.102681  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>