258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06280 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06280  hypothetical protein  100 
 
 
247 aa  494  1e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001440  AzlC family protein  82.55 
 
 
236 aa  398  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1188  putative branched-chain amino acid transport protein  77.39 
 
 
237 aa  350  2e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0235  AzlC family protein  70.71 
 
 
239 aa  325  4.0000000000000003e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1561  AzlC family protein  59.09 
 
 
273 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2782  AzlC family protein  58.68 
 
 
285 aa  289  3e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.568271  normal  0.166375 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1567  AzlC family protein  59.17 
 
 
273 aa  289  3e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1459  AzlC family protein  58.26 
 
 
293 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.878975  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1598  AzlC family protein  57.92 
 
 
273 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185514  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2694  AzlC family protein  56.28 
 
 
255 aa  278  6e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2528  AzlC family protein  55.87 
 
 
255 aa  276  2e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3237  AzlC family protein  56.38 
 
 
286 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000344272  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3139  AzlC family protein  55.6 
 
 
238 aa  263  2e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.707917  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2595  AzlC family protein  60.66 
 
 
231 aa  259  4e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1760  AzlC family protein  58.45 
 
 
230 aa  258  7e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2538  AzlC family protein  55.91 
 
 
245 aa  251  6e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3248  hypothetical protein  50.22 
 
 
247 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.351031  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38160  hypothetical protein  49.35 
 
 
252 aa  240  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013657 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3299  AzlC-like  53.21 
 
 
232 aa  227  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1897  AzlC family protein  52.75 
 
 
233 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1991  AzlC family protein  51.38 
 
 
230 aa  218  7e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.823633  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2385  AzlC family protein  50.92 
 
 
230 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3310  AzlC family protein  50.92 
 
 
230 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.294738  normal  0.172837 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2854  putative branched-chain amino acid transport protein AzlC  46.3 
 
 
242 aa  195  5.000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.608526  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3800  AzlC family protein  42.36 
 
 
244 aa  188  8e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1356  AzlC family protein  42.73 
 
 
246 aa  188  8e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3612  AzlC family protein  41.48 
 
 
244 aa  187  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.271764  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2443  branched-chain amino acid exporter, LIV- E family  43.18 
 
 
246 aa  185  6e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.324306 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2107  AzlC family protein  36.32 
 
 
244 aa  150  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413868 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3295  AzlC family protein  35.02 
 
 
258 aa  149  6e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1691  AzlC family protein  37.37 
 
 
249 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0039071  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2539  branched-chain amino acid transport protein AzlC  32.49 
 
 
250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0525733  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0804  AzlC family protein  36.87 
 
 
255 aa  129  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0112465  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1048  branched chain amino acid efflux pump LivE  32.37 
 
 
253 aa  125  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0218893  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2936  AzlC family protein  32.03 
 
 
253 aa  124  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000187359  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2207  AzlC family protein  39.11 
 
 
292 aa  122  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0109045  normal  0.696476 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4209  branched chain amino acid efflux pump, AzlCD (extrudes azaleucine)  37.37 
 
 
255 aa  122  7e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000558659  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0617  AzlC-like  38.55 
 
 
280 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152652  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0976  AzlC family protein  39.11 
 
 
257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000153015  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0972  AzlC family protein  39.11 
 
 
257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00116086  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1096  AzlC family protein  38.55 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000023066  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1055  AzlC family protein  38.55 
 
 
250 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0170281  normal  0.980601 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3606  AzlC family protein  32.29 
 
 
228 aa  111  9e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0007  AzlC family protein  29.33 
 
 
246 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2851  AzlC-like protein  33.62 
 
 
243 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.537039  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4071  AzlC family protein  35.45 
 
 
247 aa  105  7e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0434  AzlC-like protein  29.69 
 
 
265 aa  105  9e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72937  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0389  AzlC family protein  29.39 
 
 
242 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0404  AzlC family protein  28.51 
 
 
242 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.54377 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0495  AzlC-like  29.53 
 
 
257 aa  99.8  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294752  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0092  AzlC family protein  29.8 
 
 
228 aa  99.4  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0513  hypothetical protein  29.13 
 
 
242 aa  97.8  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2457  AzlC family protein  28.02 
 
 
235 aa  95.1  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201604  normal  0.404255 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1850  AzlC family protein  30.09 
 
 
241 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1599  AzlC family protein  30.53 
 
 
241 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.732241  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1562  branched-chain amino acid transport protein  30.53 
 
 
241 aa  93.6  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0739  branched chain amino acid efflux pump, large (AzlC) subunit  28.39 
 
 
235 aa  93.6  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1722  AzlC family protein  30.53 
 
 
241 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2393  AzlC family protein  28.39 
 
 
235 aa  93.6  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1551  branched-chain amino acid transport protein  30.53 
 
 
241 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4125  AzlC-like  30.21 
 
 
233 aa  92.8  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1772  AzlC family protein  30.53 
 
 
241 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1795  AzlC family protein  30.09 
 
 
241 aa  92.4  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3971  AzlC family protein  25.73 
 
 
244 aa  92  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312774  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3602  AzlC family protein  29.2 
 
 
241 aa  92  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1741  AzlC family protein  29.2 
 
 
241 aa  92  9e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1381  AzlC family protein  30.33 
 
 
234 aa  91.7  9e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.690005  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0311  AzlC family protein  32.2 
 
 
238 aa  90.5  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0661  AzlC family protein  31.02 
 
 
239 aa  89.7  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0710886  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0922  AzlC-like protein  28.95 
 
 
229 aa  90.1  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.376984  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1598  AzlC family protein  28.32 
 
 
242 aa  90.1  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.829588  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3078  AzlC family protein  29.69 
 
 
234 aa  88.6  8e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1470  AzlC family protein  29.61 
 
 
247 aa  87  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.555433  normal  0.0212209 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1048  AzlC family protein  34.52 
 
 
239 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1241  AzlC-like  29.31 
 
 
240 aa  87  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0768  AzlC family protein  30.05 
 
 
234 aa  87  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.390341  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0256  AzlC family protein  30.29 
 
 
233 aa  86.7  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0306834  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1603  AzlC family protein  31.86 
 
 
238 aa  85.5  7e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315939  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1426  AzlC-like protein  31.37 
 
 
244 aa  85.1  8e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000261082  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0944  AzlC family protein  29.65 
 
 
235 aa  85.1  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.77629e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1025  AzlC family protein  32.16 
 
 
238 aa  85.1  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0979622  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2568  AzlC family protein  28.74 
 
 
233 aa  84  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1955  AzlC-like protein  32.29 
 
 
242 aa  83.2  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.552602  normal  0.748996 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4092  AzlC family protein  32.07 
 
 
242 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1477  AzlC family protein  31.47 
 
 
238 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01830  AzlC family protein  31.05 
 
 
236 aa  81.3  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.79674  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3053  AzlC family protein  29.41 
 
 
240 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2930  AzlC family protein  31.12 
 
 
245 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.862263 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02537  predicted transporter  31.6 
 
 
245 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1002  AzlC family protein  31.6 
 
 
245 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02502  hypothetical protein  31.6 
 
 
245 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1025  AzlC family protein  31.6 
 
 
245 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0836238 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3194  transporter, branched chain amino acid exporter (LIV-E) family  31.6 
 
 
245 aa  80.1  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2818  branched chain amino acid ABC transporter  31.6 
 
 
245 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2965  branched chain amino acid ABC transporter  31.6 
 
 
245 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0732  AzlC family protein  34.15 
 
 
217 aa  79  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.100734  normal  0.28736 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3327  AzlC family protein  31.28 
 
 
246 aa  78.6  0.00000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0893  AzlC family protein  32.28 
 
 
250 aa  78.6  0.00000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.188368  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0158  AzlC family protein  32.62 
 
 
307 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00265817  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4248  AzlC family protein  29.38 
 
 
237 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>