More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06133 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06133  hypothetical protein  100 
 
 		 316 aa  619  1e-176  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000330  iron(III) ABC transporter permease protein  86.39 
 
 		 316 aa  550  1e-155  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000947678  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0999  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  72.78 
 
 		 316 aa  418  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000308675  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0360  transport system permease protein  48.47 
 
 		 323 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.166825  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2368  transport system permease protein  43.79 
 
 		 335 aa  235  8e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0419043 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0019  transport system permease protein  44.06 
 
 		 344 aa  228  7e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34420  ABC-type enterochelin transport system, permease component  43.23 
 
 		 331 aa  221  9.999999999999999e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0758  transport system permease protein  40.63 
 
 		 318 aa  216  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0775  transport system permease protein  40.63 
 
 		 318 aa  216  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.800341  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0401  iron compound ABC transporter, permease protein  38.54 
 
 		 317 aa  214  9.999999999999999e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3785  transport system permease protein  46.32 
 
 		 345 aa  213  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1542  enterochelin ABC transporter, permease protein  41.48 
 
 		 312 aa  212  7.999999999999999e-54  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.644944  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3799  transport system permease protein  41.81 
 
 		 317 aa  211  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1352  enterochelin ABC transporter, permease protein  41.35 
 
 		 312 aa  211  2e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0634  iron compound ABC transporter, permease protein  40.47 
 
 		 317 aa  208  8e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0677  iron compound ABC transporter, permease protein  40.13 
 
 		 317 aa  204  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2625  transport system permease protein  37.85 
 
 		 316 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.544933  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1930  transport system permease protein  39.03 
 
 		 336 aa  203  3e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.276463  normal  0.0688299 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1009  iron compound ABC transporter, permease protein  39.8 
 
 		 324 aa  203  4e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0108445  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0732  transport system permease protein  40.06 
 
 		 322 aa  202  4e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0398177  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4398  transport system permease protein  41.22 
 
 		 316 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.210595 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4266  hypothetical protein  39.86 
 
 		 314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1007  transport system permease protein  37.2 
 
 		 332 aa  193  4e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2402  transport system permease protein  38.22 
 
 		 333 aa  192  8e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0334561  hitchhiker  0.00465255 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4145  iron chelate ABC transporter permease  37.9 
 
 		 335 aa  187  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.116139  normal  0.0126806 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0069  transport system permease protein  37.9 
 
 		 335 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0659  transport system permease protein  36.62 
 
 		 369 aa  187  2e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4093  iron chelate ABC transporter, permease protein  37.58 
 
 		 335 aa  186  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.842143  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1909  transport system permease protein  40 
 
 		 355 aa  182  6e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.318272  normal  0.0548852 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1027  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  36.4 
 
 		 322 aa  179  7e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00946746  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0298  transport system permease protein  37.76 
 
 		 319 aa  178  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3221  ABC ferric siderophore transporter, inner membrane subunit  37.05 
 
 		 314 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3960  transport system permease protein  37.05 
 
 		 314 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1628  transport system permease protein  32.56 
 
 		 316 aa  167  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5026  transport system permease protein  38.41 
 
 		 326 aa  167  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.337084  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1113  iron chelate ABC transporter, permease protein  35.99 
 
 		 316 aa  166  4e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02107  hypothetical protein  31.76 
 
 		 317 aa  166  5e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2593  ferric siderophore ABC transporter, permease protein  35.9 
 
 		 313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.510431  normal  0.118224 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1765  transport system permease protein  38.83 
 
 		 335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0506654  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1395  transport system permease protein  37.58 
 
 		 346 aa  162  6e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.587032  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2037  transport system permease protein  38.98 
 
 		 335 aa  161  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3704  transport system permease protein  34.4 
 
 		 350 aa  157  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.287102  normal  0.653673 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2665  transport system permease protein  38.52 
 
 		 344 aa  156  4e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3668  transport system permease protein  35.02 
 
 		 301 aa  153  4e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3342  transport system permease protein  34.38 
 
 		 316 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00135825  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0636  transport system permease protein  32.04 
 
 		 333 aa  150  3e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0103144  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3469  transport system permease protein  33.97 
 
 		 316 aa  149  4e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0102454 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5232  iron compound ABC transporter, permease protein  32.86 
 
 		 354 aa  149  9e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4813  iron compound ABC transporter, permease  32.86 
 
 		 354 aa  148  9e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.436223  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4951  iron compound ABC transporter permease  32.86 
 
 		 354 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.489666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4793  iron compound ABC transporter, permease  32.86 
 
 		 354 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000230814  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5328  iron compound ABC transporter permease protein  32.86 
 
 		 354 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5195  iron compound ABC transporter, permease protein  32.86 
 
 		 354 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0009  iron compound ABC transporter, permease protein  32.5 
 
 		 354 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30520  ABC-type enterochelin transport system, permease component  33.95 
 
 		 415 aa  146  6e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5245  iron compound ABC transporter, permease protein  32.5 
 
 		 354 aa  145  9e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2914  transport system permease protein  31.9 
 
 		 354 aa  144  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000603005  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5224  iron compound ABC transporter, permease protein  32.87 
 
 		 354 aa  142  7e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2661  transport system permease protein  33.21 
 
 		 352 aa  136  5e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16580  ABC-type enterochelin transport system, permease component  31.27 
 
 		 362 aa  128  1.0000000000000001e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4916  transport system permease protein  33.08 
 
 		 354 aa  126  5e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25330  ABC-type enterochelin transport system, permease component  31.66 
 
 		 366 aa  126  5e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04600  ABC-type enterochelin transport system, permease component  32.43 
 
 		 356 aa  125  7e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.299561 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  26.78 
 
 		 358 aa  94.4  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24720  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  26.14 
 
 		 362 aa  93.6  4e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  26.3 
 
 		 354 aa  91.7  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5079  iron compound ABC transporter, permease  28.96 
 
 		 338 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5505  iron compound ABC transporter, permease protein  28.96 
 
 		 338 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1720  hypothetical protein  28.47 
 
 		 350 aa  91.7  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5511  iron compound ABC transporter, permease protein  28.96 
 
 		 338 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5231  iron compound ABC transporter permease  28.96 
 
 		 338 aa  90.9  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5062  iron compound ABC transporter, permease  28.96 
 
 		 338 aa  90.9  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5474  iron compound ABC transporter, permease protein  28.96 
 
 		 338 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5630  iron compound ABC transporter permease protein  28.96 
 
 		 338 aa  90.9  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5560  iron compound ABC transporter, permease protein  28.96 
 
 		 338 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5446  iron compound ABC transporter, permease protein  28.86 
 
 		 338 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1464  iron compound ABC transporter, permease protein  26.15 
 
 		 340 aa  89.7  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000166085 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3481  iron compound ABC transporter, permease  25.27 
 
 		 340 aa  89.4  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3835  iron compound ABC transporter, permease protein  25.8 
 
 		 340 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3581  iron compound ABC transporter permease  25.27 
 
 		 340 aa  88.6  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3747  iron compound ABC transporter, permease protein  25.27 
 
 		 340 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000151165 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3493  iron compound ABC transporter, permease  25.27 
 
 		 340 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3865  iron compound ABC transporter permease protein  25.27 
 
 		 340 aa  88.6  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0278  transport system permease protein  27.68 
 
 		 360 aa  88.6  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0561654  normal  0.124671 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3785  iron compound ABC transporter, permease protein  25.27 
 
 		 340 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0901363  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3903  transport system permease protein  28.04 
 
 		 338 aa  87.8  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3504  transport system permease protein  25.8 
 
 		 340 aa  87.8  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3769  iron compound ABC transporter, permease protein  24.91 
 
 		 340 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2407  transport system permease protein  25.27 
 
 		 340 aa  87.4  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00125347  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1000  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  27.49 
 
 		 312 aa  86.7  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000321439  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5175  transport system permease protein  28.96 
 
 		 338 aa  86.7  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0583  transport system permease protein  26.14 
 
 		 331 aa  83.2  0.000000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.777741  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000331  iron(III) ABC transporter permease protein  27.15 
 
 		 289 aa  83.2  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000524649  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  27.62 
 
 		 334 aa  82.8  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  27.62 
 
 		 334 aa  82.8  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  27.62 
 
 		 334 aa  82.8  0.000000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1629  transport system permease protein  27.03 
 
 		 313 aa  82.4  0.000000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.287852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1298  transport system permease protein  25.6 
 
 		 362 aa  82.4  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0650  hemin transport system permease protein HmuU  28.37 
 
 		 327 aa  82  0.00000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.150325  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0415  transport system permease protein  24.83 
 
 		 357 aa  82  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.920967 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>