More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06113 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06113  histidine kinase  100 
 
 		 446 aa  924    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.25 
 
 		 449 aa  380  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00670789  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3412  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.56 
 
 		 471 aa  370  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0795  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 		 444 aa  364  2e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3919  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.44 
 
 		 448 aa  348  2e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.370556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1732  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.96 
 
 		 445 aa  204  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.268392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4220  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.11 
 
 		 472 aa  197  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345357  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4065  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.09 
 
 		 463 aa  186  9e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.860107  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1652  sensor histidine kinase  27.87 
 
 		 458 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.736934  normal  0.804947 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1214  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 		 463 aa  183  6e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1254  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.68 
 
 		 457 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.877162  hitchhiker  0.000367617 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37040  sensory histidine protein kinase, two component  30.72 
 
 		 443 aa  177  5e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.550956  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52240  two-component sensor  27.8 
 
 		 445 aa  173  5e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.332832 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0567  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 		 442 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0584  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 		 448 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0578  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.21 
 
 		 448 aa  170  6e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.317662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4580  sensor protein PfeS  28.89 
 
 		 446 aa  169  8e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193076  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4461  histidine kinase  31.58 
 
 		 452 aa  168  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0533  sensor protein PfeS  29.53 
 
 		 442 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29360  two-component sensor PfeS  27.19 
 
 		 446 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124674  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 		 419 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.335551  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2387  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 		 420 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2573  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 421 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.236887 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1314  sensor histidine kinase CpxA  32.06 
 
 		 449 aa  160  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.20791e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1425  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 		 449 aa  160  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00554351  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1009  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 		 455 aa  160  6e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3963  two-component sensor PfeS  26.1 
 
 		 446 aa  159  8e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2007  putative two-component system sensor kinase  25.66 
 
 		 471 aa  159  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0750477  hitchhiker  0.00355536 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0772  histidine kinase  32.09 
 
 		 456 aa  159  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000128087  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2752  sensor histidine kinase CpxA  31.71 
 
 		 449 aa  159  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3274  histidine kinase  34.02 
 
 		 465 aa  158  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000371883  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31140  sensory histidine protein kinase  33.44 
 
 		 412 aa  156  7e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0370261  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3194  histidine kinase  36.36 
 
 		 480 aa  155  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2596  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.34 
 
 		 457 aa  154  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.338905 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0675  Signal transduction histidine kinase  25.54 
 
 		 459 aa  153  5e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000458656  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3770  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 		 449 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00735278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0715  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.46 
 
 		 445 aa  153  7e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1604  sensor histidine kinase  23.54 
 
 		 455 aa  152  8e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0251  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 		 449 aa  153  8e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00216243  hitchhiker  0.000495811 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3451  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.18 
 
 		 442 aa  152  8.999999999999999e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000191939 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1392  sensor histidine kinase  23.76 
 
 		 455 aa  152  1e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0252  ATPase domain-containing protein  31.7 
 
 		 449 aa  151  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00902295  hitchhiker  0.0000000026524 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3934  histidine kinase  31.7 
 
 		 458 aa  150  5e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000220344  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4478  sensor protein CpxA  31.77 
 
 		 449 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3792  sensor histidine kinase  32.85 
 
 		 416 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00122531 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0705  sensor histidine kinase  31.77 
 
 		 381 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.529031 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0051  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 		 389 aa  147  5e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1866  putative two-component system sensor kinase  25.17 
 
 		 468 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0255  histidine kinase  30.94 
 
 		 458 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.126812  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1749  sensor protein CpxA  29.73 
 
 		 472 aa  145  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0671148  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 		 458 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00578995  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 		 454 aa  143  5e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.340802  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6516  histidine kinase  29.55 
 
 		 429 aa  143  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0252048 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 		 454 aa  143  7e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.018475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2624  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 		 435 aa  142  9e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000009971 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0253  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.97 
 
 		 458 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0323249  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3137  histidine kinase  30.14 
 
 		 469 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00554367  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0366  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.41 
 
 		 449 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00215301  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1625  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.3 
 
 		 570 aa  140  6e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3433  sensor protein CpxA  27.74 
 
 		 453 aa  139  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0911326  normal  0.239328 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.11 
 
 		 429 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 		 466 aa  136  8e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.445983  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06762  histidine kinase  24.28 
 
 		 457 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3186  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 		 469 aa  135  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000850  probable two-component system sensor kinase  24.5 
 
 		 457 aa  133  7.999999999999999e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0135797  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00536  putative sensor histidine kinase protein  27.65 
 
 		 453 aa  133  7.999999999999999e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2868  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.96 
 
 		 439 aa  132  9e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7490  Signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 		 423 aa  132  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3462  ATP-binding region, ATPase-like protein  28.92 
 
 		 471 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.015081  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3571  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 		 455 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.382959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1920  putative two-component sensor  31.87 
 
 		 445 aa  131  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00937  sensor histidine kinase  22.2 
 
 		 458 aa  130  4.0000000000000003e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000560614  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0988  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.6 
 
 		 467 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00659588  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22730  putative two-component sensor  31.5 
 
 		 445 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.172157  normal  0.0503129 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0881  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 		 453 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.236572 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4561  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.91 
 
 		 440 aa  129  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102367  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.74 
 
 		 455 aa  127  5e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000416507  hitchhiker  0.00000000404182 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0194  two-component system sensor protein, histidine kinase  24.57 
 
 		 461 aa  126  6e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0627121  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2278  sensor histidine kinase  29.58 
 
 		 465 aa  125  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1417  ATPase domain-containing protein  28.34 
 
 		 470 aa  125  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.110308 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3071  histidine kinase  27.86 
 
 		 369 aa  125  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000550678 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.62 
 
 		 359 aa  124  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_003296  RS03089  two-component transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  28.06 
 
 		 365 aa  123  7e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.435396 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0804  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.92 
 
 		 358 aa  123  7e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3794  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.23 
 
 		 446 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000335712 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4011  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 		 446 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.704889  hitchhiker  0.0000182562 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28 
 
 		 369 aa  120  7e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.779976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2302  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.71 
 
 		 450 aa  120  7e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0020202  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1481  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  27.46 
 
 		 446 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0335199  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0280  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.62 
 
 		 459 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000534801  unclonable  0.0000000336351 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3591  sensor histidine kinase  26.99 
 
 		 449 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.148051  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8577  histidine kinase  27.03 
 
 		 415 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.558489  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1803  sensor histidine kinase  26.32 
 
 		 450 aa  118  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43373  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.17 
 
 		 446 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0126885  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15590  periplasmic sensory histidine protein kinase  28.12 
 
 		 446 aa  117  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506473  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.04 
 
 		 472 aa  117  5e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.911629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4567  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.93 
 
 		 395 aa  117  6e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.82 
 
 		 446 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000501512  normal  0.872654 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.44 
 
 		 425 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  25.52 
 
 		 423 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>