More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06098 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  79.76 
 
 		 412 aa  661    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000297  oxalate/formate antiporter  96.1 
 
 		 412 aa  789    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000377663  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  83.66 
 
 		 410 aa  692    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06098  hypothetical protein  100 
 
 		 410 aa  809    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05082  hypothetical protein  41.18 
 
 		 404 aa  327  3e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  43.43 
 
 		 425 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  40.46 
 
 		 415 aa  301  2e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3154  major facilitator superfamily MFS_1  41.1 
 
 		 421 aa  286  5e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328617  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1705  major facilitator transporter  41.95 
 
 		 442 aa  286  5e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3046  major facilitator superfamily MFS_1  40.85 
 
 		 421 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.548752  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2958  major facilitator transporter  40.6 
 
 		 421 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175452  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3142  major facilitator superfamily MFS_1  35.75 
 
 		 434 aa  258  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2490  oxalate/formate antiporter, putative  37.59 
 
 		 455 aa  256  7e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2465  major facilitator transporter  37.08 
 
 		 454 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2629  major facilitator superfamily MFS_1  37.53 
 
 		 465 aa  239  8e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  32 
 
 		 416 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0515  major facilitator transporter  34.04 
 
 		 418 aa  168  2e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  33.67 
 
 		 412 aa  165  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1179  major facilitator superfamily MFS_1  32.78 
 
 		 408 aa  164  3e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0434  major facilitator transporter  33.99 
 
 		 391 aa  162  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000443521  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  31 
 
 		 418 aa  158  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3406  major facilitator transporter  29.61 
 
 		 408 aa  157  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.913918  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  26.59 
 
 		 402 aa  153  7e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  26.59 
 
 		 402 aa  153  7e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0177  oxalate/formate antiporter  27.88 
 
 		 400 aa  152  8e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1720  major facilitator transporter  32.75 
 
 		 419 aa  152  8.999999999999999e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.127263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3733  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 397 aa  152  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2607  putative oxalate:formate antiporter  25.78 
 
 		 402 aa  151  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000121238 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2456  oxalate/formate antiporter (permease)  26.19 
 
 		 402 aa  150  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001991  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  28.12 
 
 		 402 aa  150  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2394  major facilitator superfamily MFS_1  32.72 
 
 		 414 aa  150  3e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000021703  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2746  putative oxalate:formate antiporter  26.19 
 
 		 402 aa  150  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000311684  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2459  major facilitator transporter  26.41 
 
 		 402 aa  150  4e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0169362  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2718  oxalate:formate antiporter, putative  26.29 
 
 		 402 aa  149  7e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00584048  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2695  putative oxalate:formate antiporter  26.07 
 
 		 402 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000183174 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3868  major facilitator family transporter  29.34 
 
 		 402 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2703  putative oxalate:formate antiporter  25.54 
 
 		 402 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2172  major facilitator superfamily MFS_1  28.85 
 
 		 407 aa  147  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00749383  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0936  major facilitator superfamily MFS_1  30.18 
 
 		 407 aa  147  5e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3728  major facilitator transporter  28.99 
 
 		 411 aa  146  8.000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3434  major facilitator superfamily MFS_1  31.77 
 
 		 421 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325529 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4042  major facilitator family transporter  29.06 
 
 		 402 aa  144  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4923  inner membrane protein YhjX  29.06 
 
 		 400 aa  144  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03397  predicted transporter  29.06 
 
 		 402 aa  144  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03348  hypothetical protein  29.06 
 
 		 402 aa  144  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2174  major facilitator transporter  28.8 
 
 		 400 aa  143  5e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0165144  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1880  major facilitator superfamily MFS_1  28.29 
 
 		 407 aa  143  6e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0103294  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3979  major facilitator family transporter  28.77 
 
 		 400 aa  143  6e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.705111  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C10  major facilitator superfamily permease  27.69 
 
 		 413 aa  143  6e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0165  Oxalate/Formate Antiporter  28.77 
 
 		 402 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0169  oxalate/formate antiporter  28.77 
 
 		 402 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.86802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3748  major facilitator family transporter  28.77 
 
 		 402 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1036  major facilitator superfamily MFS_1  27.95 
 
 		 433 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0858  major facilitator transporter  28.99 
 
 		 442 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.326759  normal  0.152741 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2840  major facilitator family transporter  25.94 
 
 		 398 aa  139  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2817  major facilitator family transporter  26 
 
 		 398 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0448046  normal  0.764982 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2736  major facilitator family transporter  25.94 
 
 		 398 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.601142  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2777  major facilitator family transporter  25.94 
 
 		 398 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2952  major facilitator family transporter  25.94 
 
 		 398 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0444  major facilitator transporter  28.27 
 
 		 422 aa  139  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.17352  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1858  major facilitator transporter  27.21 
 
 		 402 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.633531  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  26.27 
 
 		 412 aa  137  3.0000000000000003e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0356  major facilitator superfamily MFS_1  26.17 
 
 		 411 aa  137  4e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2396  oxalate:formate antiporter, putative  28.26 
 
 		 400 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.429266  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4793  major facilitator superfamily MFS_1  25.23 
 
 		 437 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.716859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2385  putative oxalate:formate antiporter  28.53 
 
 		 400 aa  133  5e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2203  oxalate:formate antiporter  28.53 
 
 		 400 aa  133  5e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.111639  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2142  oxalate/formate antiporter  28.53 
 
 		 400 aa  133  5e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0401795  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2126  oxalate/formate antiporter  28.53 
 
 		 400 aa  133  5e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0875766  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2367  oxalate:formate antiporter  28.53 
 
 		 400 aa  133  5e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.880003  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2332  putative oxalate:formate antiporter  28.26 
 
 		 400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134794  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2993  putative oxalate:formate antiporter  28.26 
 
 		 400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0223405  normal  0.0497096 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0121  major facilitator transporter  25 
 
 		 437 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1344  major facilitator superfamily MFS_1  27.83 
 
 		 421 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2356  major facilitator superfamily MFS_1  28.11 
 
 		 405 aa  129  7.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0038  major facilitator transporter  32.15 
 
 		 432 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24130  sugar phosphate permease  26.25 
 
 		 436 aa  127  4.0000000000000003e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0467  major facilitator superfamily MFS_1  27.45 
 
 		 424 aa  126  7e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000451235  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1590  major facilitator transporter  28.9 
 
 		 431 aa  126  7e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0171149  normal  0.72938 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0060  major facilitator superfamily MFS_1  26.16 
 
 		 414 aa  126  7e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0056  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 414 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00977888  hitchhiker  0.000481777 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4298  major facilitator transporter  26.43 
 
 		 414 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000777962  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0061  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 414 aa  126  9e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0161323  hitchhiker  0.000519908 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0056  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 414 aa  126  9e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1033  major facilitator transporter  27.38 
 
 		 430 aa  125  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512076  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1247  major facilitator transporter  25.97 
 
 		 431 aa  125  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.131802 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1160  major facilitator superfamily MFS_1  27.38 
 
 		 430 aa  125  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0058  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 414 aa  124  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000719685  decreased coverage  0.000000078318 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4451  MFS superfamily oxalate/formate antiporter  29.31 
 
 		 438 aa  124  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000266277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2442  major facilitator superfamily MFS_1  25.83 
 
 		 405 aa  123  5e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.234485  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0965  major facilitator superfamily MFS_1  26.89 
 
 		 429 aa  122  9e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2414  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 		 436 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.136193 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4475  major facilitator superfamily MFS_1  26.87 
 
 		 441 aa  122  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2097  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 		 436 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.481915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1032  putative oxalate/formate antiporter  30.67 
 
 		 404 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2137  major facilitator transporter  24.7 
 
 		 436 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.115705  normal  0.336562 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6143  major facilitator transporter  26.17 
 
 		 437 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.645469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1372  major facilitator superfamily MFS_1  23.92 
 
 		 436 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686349  normal  0.752679 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1212  major facilitator transporter  23.68 
 
 		 432 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.260069  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0868  major facilitator superfamily MFS_1  27.31 
 
 		 453 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>