71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06020 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06020  hypothetical protein  100 
 
 		 211 aa  431  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2146  putative MltA-interacting protein MipA  40 
 
 		 250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0292974  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3466  MltA-interacting MipA family protein  28.3 
 
 		 244 aa  98.2  8e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1413  MltA-interacting protein  28.57 
 
 		 248 aa  91.3  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.598328  normal  0.558802 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1889  MltA-interacting protein  28.57 
 
 		 248 aa  91.3  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.310283  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2070  MltA-interacting protein  28.57 
 
 		 248 aa  91.3  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000515947 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1397  MltA-interacting protein  28.57 
 
 		 274 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000401837 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1380  MltA-interacting protein  28.57 
 
 		 274 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.215527 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2258  MltA-interacting MipA family protein  28.97 
 
 		 249 aa  90.1  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0145  MltA-interacting MipA family protein  30.88 
 
 		 246 aa  89.4  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.531464 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1962  MltA-interacting MipA family protein  30 
 
 		 249 aa  88.2  7e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.433624  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1672  MltA-interacting MipA family protein  26.67 
 
 		 248 aa  87  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.594604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2506  MltA-interacting protein MipA  27.75 
 
 		 248 aa  82  0.000000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0237592  normal  0.810887 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01751  scaffolding protein for murein synthesizing machinery  27.27 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.910835  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1867  MltA-interacting protein MipA  27.27 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00884269  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2006  MltA-interacting protein MipA  27.27 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.666046  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3701  MltA-interacting MipA family protein  26.83 
 
 		 250 aa  80.5  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1850  MltA-interacting MipA family protein  27.27 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.112768  hitchhiker  0.0014018 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1409  MltA-interacting protein MipA  27.27 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.543769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2030  MltA-interacting protein MipA  27.27 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1860  MltA-interacting MipA family protein  27.27 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000393444  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01739  hypothetical protein  27.27 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.923789  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2730  MltA-interacting MipA family protein  25.96 
 
 		 254 aa  77.4  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.207086  hitchhiker  0.000331014 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2098  MltA-interacting MipA family protein  26.86 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2353  hypothetical protein  26.86 
 
 		 273 aa  77  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000266286  normal  0.096147 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1990  MltA-interacting protein  26.86 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000189285  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1976  MltA-interacting MipA family protein  25.49 
 
 		 249 aa  75.1  0.0000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2218  MltA-interacting MipA family protein  24.52 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03439  hypothetical protein  23.15 
 
 		 246 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03390  hypothetical protein  23.15 
 
 		 246 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4953  MltA-interacting protein MipA  23.15 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3788  MltA-interacting protein MipA  24.24 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0129  MltA-interacting MipA family protein  23.15 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.862546  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0125  MltA-interacting MipA family protein  24.24 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3910  MltA-interacting protein MipA  23.15 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.709992 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4081  MltA-interacting protein MipA  23.15 
 
 		 246 aa  68.6  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2644  MltA-interacting protein  28.9 
 
 		 259 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158606  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1684  MltA-interacting MipA family protein  27.31 
 
 		 263 aa  68.2  0.00000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000137839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0808  MltA-interacting MipA family protein  23.81 
 
 		 247 aa  64.3  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.121594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2376  MltA-interacting MipA  27.73 
 
 		 259 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.487283  normal  0.1296 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0478  MltA-interacting MipA family protein  26.42 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1392  MltA-interacting MipA family protein  23.58 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.212014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2564  MltA-interacting MipA family protein  26.15 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.295331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3687  MltA-interacting MipA family protein  25.79 
 
 		 257 aa  54.7  0.0000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.645543  normal  0.0147446 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3498  MltA-interacting MipA family protein  25.79 
 
 		 257 aa  54.7  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.605906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1891  MltA-interacting MipA  23.58 
 
 		 270 aa  54.7  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0905177 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3566  MltA-interacting MipA family protein  25.16 
 
 		 257 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.119628  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0847  MltA-interacting MipA family protein  26.32 
 
 		 257 aa  53.9  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0974591  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0752  MltA-interacting MipA family protein  25.16 
 
 		 257 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0638189  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3818  MltA-interacting MipA family protein  25 
 
 		 491 aa  52.4  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.217348  normal  0.980819 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1032  MltA-interacting MipA family protein  24.85 
 
 		 292 aa  52.4  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000317103  normal  0.951238 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03124  hypothetical protein  24.3 
 
 		 255 aa  51.6  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3058  MltA-interacting MipA family protein  25.71 
 
 		 257 aa  50.8  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4564  MltA-interacting MipA  24.38 
 
 		 497 aa  50.4  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.672306  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1656  putative outer membrane protein/scaffolding protein MipA  22.49 
 
 		 270 aa  49.7  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0234795  normal  0.604065 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0351  MltA-interacting MipA  28.05 
 
 		 256 aa  49.7  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.2595  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0548  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.95 
 
 		 327 aa  48.9  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000364413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0561  MltA-interacting MipA  23.98 
 
 		 257 aa  48.5  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.711283  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0152  hypothetical protein  24.36 
 
 		 307 aa  47  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0983  MltA-interacting MipA family protein  22.42 
 
 		 294 aa  46.2  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0175299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3085  MltA-interacting MipA family protein  25.16 
 
 		 287 aa  45.8  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00416947  normal  0.497411 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3004  MltA-interacting MipA family protein  25.16 
 
 		 287 aa  45.8  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000564668  normal  0.120239 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3182  MltA-interacting MipA family protein  25.15 
 
 		 304 aa  45.4  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0446172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0634  outer membrane protein V-like protein  24.57 
 
 		 278 aa  45.4  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.712948 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3166  MltA-interacting MipA family protein  20.73 
 
 		 257 aa  44.7  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0454156  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3569  MltA-interacting MipA  21.26 
 
 		 292 aa  44.7  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000215128  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3975  MltA-interacting MipA family protein  23.93 
 
 		 257 aa  44.3  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.859945  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3592  hypothetical protein  24.16 
 
 		 304 aa  43.5  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2798  putative outer membrane protein  23.84 
 
 		 294 aa  42.7  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0453163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0898  MltA-interacting MipA family protein  21.85 
 
 		 311 aa  42  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.436193  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3980  MltA-interacting MipA family protein  32.22 
 
 		 289 aa  42  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.806511 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>