More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06007 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06007  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  100 
 
 
298 aa  619  1e-176  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001069  iron(III) dicitrate transport system iron-binding protein fecB  59.07 
 
 
307 aa  360  1e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0693  periplasmic binding protein  48.35 
 
 
306 aa  281  1e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1282  periplasmic binding protein  51.15 
 
 
357 aa  273  3e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0974  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  47.52 
 
 
304 aa  266  2e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.37813  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04156  iron-dicitrate transporter subunit  47.23 
 
 
300 aa  261  1e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04119  hypothetical protein  47.23 
 
 
300 aa  261  1e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0742  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  47.23 
 
 
300 aa  261  1e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4867  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  47.41 
 
 
302 aa  260  2e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3710  periplasmic binding protein  46.86 
 
 
300 aa  258  9e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.508283  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0763  iron(III) dicitrate transport system, periplasmic iron-binding protein FecB  46.21 
 
 
306 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0667  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  45.45 
 
 
306 aa  249  4e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4780  periplasmic binding protein  39.4 
 
 
305 aa  220  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1777  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  38.43 
 
 
331 aa  197  2e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2208  periplasmic binding protein  36.14 
 
 
327 aa  189  5e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.970371  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2246  periplasmic binding protein  36.14 
 
 
327 aa  189  5e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.13483  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1097  periplasmic binding protein  36.97 
 
 
319 aa  184  1e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  1.53945e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1119  periplasmic binding protein  36.97 
 
 
319 aa  184  1e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  5.65066e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2757  periplasmic binding protein  33.93 
 
 
309 aa  132  6e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1523  periplasmic binding protein  30.87 
 
 
313 aa  122  7e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2416  periplasmic binding protein  31.41 
 
 
311 aa  120  2e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2940  periplasmic binding protein  29.73 
 
 
316 aa  115  7e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0778  lipoprotein  29.23 
 
 
316 aa  115  8e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.662712  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2283  substrate-binding family protein, putative  26.57 
 
 
321 aa  110  4e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00918063  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2099  substrate-binding family protein  26.57 
 
 
320 aa  109  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  2.70129e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2038  iron(III) dicitrate-binding protein  26.57 
 
 
320 aa  109  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  3.24878e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2280  putative iron compound-binding protein  26.57 
 
 
320 aa  109  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17371e-45 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2255  substrate-binding family protein  26.57 
 
 
320 aa  109  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00818777  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2365  putative iron compound-binding protein  26.22 
 
 
320 aa  109  7e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00267184  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0463  periplasmic binding protein  28.67 
 
 
308 aa  109  7e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1987  periplasmic binding protein  28.78 
 
 
324 aa  109  7e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  1.25239e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2264  periplasmic binding protein  27.62 
 
 
324 aa  108  8e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2078  periplasmic binding protein  26.9 
 
 
320 aa  108  9e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0923581  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3087  putative iron compound-binding protein  25.87 
 
 
320 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.32473  hitchhiker  9.18537e-17 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0550  periplasmic binding protein  29.47 
 
 
313 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2237  putative iron compound-binding protein  25.87 
 
 
305 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0793747  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7985  substrate-binding family protein, putative  31.91 
 
 
336 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.428373  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2036  iron(III) dicitrate-binding protein  26.04 
 
 
320 aa  107  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  1.0516e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1784  hypothetical protein  28.29 
 
 
309 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.933909 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4123  periplasmic binding protein  27.17 
 
 
346 aa  98.6  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1763  periplasmic binding protein  25.24 
 
 
316 aa  98.6  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.361737  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30510  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  29.3 
 
 
326 aa  97.8  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.163783  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2422  periplasmic binding protein  25.54 
 
 
300 aa  97.1  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0632  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  28.57 
 
 
309 aa  96.3  5e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2011  periplasmic binding protein  28.72 
 
 
662 aa  96.3  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756421  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2035  periplasmic binding protein  24.6 
 
 
316 aa  94.7  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0413  periplasmic binding protein  26.77 
 
 
319 aa  93.2  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4069  periplasmic binding protein  29.43 
 
 
342 aa  92.4  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.423894 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3654  periplasmic binding protein  29.2 
 
 
329 aa  92.4  9e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.841476  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2064  periplasmic binding protein  27.69 
 
 
313 aa  92  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4685  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.91 
 
 
322 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0132289  hitchhiker  2.7046e-21 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0106  periplasmic binding protein  27.76 
 
 
330 aa  90.9  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  1.00605e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3525  periplasmic binding protein  25.8 
 
 
310 aa  90.9  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.476755  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1739  periplasmic binding protein  36.88 
 
 
352 aa  91.3  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0102  periplasmic binding protein  27.76 
 
 
330 aa  90.9  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  1.4163e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1806  periplasmic binding protein  28.93 
 
 
358 aa  90.5  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.455628  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0683  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.57 
 
 
321 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0743  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.84 
 
 
321 aa  89  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  8.97265e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0362  periplasmic binding protein  25.44 
 
 
315 aa  88.6  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0652  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.76 
 
 
322 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000476646  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0581  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  26.47 
 
 
321 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  6.73134e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  26.47 
 
 
321 aa  87.8  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.33829e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0670  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.47 
 
 
321 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.07774e-37 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0615  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  26.47 
 
 
321 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  2.82355e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0529  periplasmic binding protein  26.47 
 
 
322 aa  87.4  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00029355  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2404  periplasmic binding protein  27.34 
 
 
315 aa  87  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0899785  hitchhiker  0.00440693 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  26.47 
 
 
321 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  2.68482e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2590  periplasmic binding protein  29.37 
 
 
301 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.37556  normal  0.0169021 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2829  twin-arginine translocation pathway signal  29.43 
 
 
300 aa  85.5  9e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.582079  normal  0.501847 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2421  periplasmic binding protein  25.16 
 
 
309 aa  84.7  2e-15  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4041  periplasmic binding protein  28.74 
 
 
341 aa  84  3e-15  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0675  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  28.21 
 
 
315 aa  83.6  4e-15  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1738  periplasmic binding protein  25.26 
 
 
363 aa  82.8  6e-15  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.028401  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3865  periplasmic binding protein  26.15 
 
 
329 aa  82.4  9e-15  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.900175  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06135  ABC-type enterochelin transport system periplasmic protein  27.86 
 
 
302 aa  81.6  1e-14  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2413  periplasmic binding protein  26.37 
 
 
351 aa  80.9  3e-14  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1638  periplasmic binding protein  26.44 
 
 
341 aa  80.5  3e-14  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.120815  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2189  periplasmic binding protein  25.99 
 
 
309 aa  80.5  3e-14  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1158  periplasmic binding protein  26.44 
 
 
341 aa  80.5  3e-14  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360135  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0523  ABC Fe3+-hydroxamate transporter, periplasmic ligand binding protein  29.04 
 
 
276 aa  80.1  4e-14  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1185  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  28.11 
 
 
342 aa  80.1  4e-14  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.145194  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5759  periplasmic binding protein  25.68 
 
 
331 aa  79.7  5e-14  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4143  iron chelate ABC transporter periplasmic iron-binding protein  26.5 
 
 
317 aa  79.7  5e-14  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0242829  normal  0.0341564 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4091  iron chelate ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  26.5 
 
 
317 aa  79.7  5e-14  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0071  periplasmic binding protein  26.5 
 
 
317 aa  79.7  5e-14  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0133  periplasmic binding protein  24.73 
 
 
306 aa  79.7  6e-14  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2699  periplasmic binding protein  24.01 
 
 
305 aa  79.7  6e-14  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.885635  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1001  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, periplasmic vibriobactin/enterobactin-binding protein  28 
 
 
333 aa  79.3  7e-14  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  2.70207e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0291  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  28.11 
 
 
398 aa  79.3  7e-14  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0133819  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1628  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  28.11 
 
 
398 aa  79.3  7e-14  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.400123  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0870  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  28.11 
 
 
398 aa  79.3  7e-14  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322201  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2122  periplasmic binding protein  25.33 
 
 
298 aa  79  9e-14  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10692  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0661  periplasmic binding protein  28.68 
 
 
354 aa  78.2  1e-13  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4155  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.27 
 
 
314 aa  79  1e-13  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  6.76883e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5060  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.59 
 
 
314 aa  78.2  1e-13  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.320975  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5229  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  23.59 
 
 
314 aa  78.2  1e-13  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2083  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  28.62 
 
 
429 aa  78.6  1e-13  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.108843  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5077  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.59 
 
 
314 aa  78.2  1e-13  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5628  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  23.59 
 
 
314 aa  78.2  1e-13  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5558  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.59 
 
 
311 aa  78.6  1e-13  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>