More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05938 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05938  hypothetical protein  100 
 
 		 237 aa  491  9.999999999999999e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000204  putative phosphatase YieH  84.23 
 
 		 222 aa  396  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.30106  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0436  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  53.88 
 
 		 226 aa  246  3e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4007  6-phosphogluconate phosphatase  39.13 
 
 		 222 aa  164  9e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4216  6-phosphogluconate phosphatase  39.13 
 
 		 223 aa  157  9e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4274  6-phosphogluconate phosphatase  38.07 
 
 		 221 aa  157  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4184  HAD family hydrolase  37.56 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4162  6-phosphogluconate phosphatase  44.44 
 
 		 222 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.463446  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4188  6-phosphogluconate phosphatase  43.86 
 
 		 222 aa  148  8e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.274934  hitchhiker  0.00681346 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4240  6-phosphogluconate phosphatase  43.86 
 
 		 222 aa  148  9e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0268  HAD family hydrolase  35.24 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4594  6-phosphogluconate phosphatase  39.77 
 
 		 221 aa  143  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.348928  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4142  6-phosphogluconate phosphatase  37.38 
 
 		 221 aa  142  6e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4077  6-phosphogluconate phosphatase  38.59 
 
 		 221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0020  6-phosphogluconate phosphatase  39.18 
 
 		 221 aa  138  7.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.334296 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4133  6-phosphogluconate phosphatase  38.04 
 
 		 221 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0258255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4061  6-phosphogluconate phosphatase  38.04 
 
 		 221 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4240  6-phosphogluconate phosphatase  38.04 
 
 		 221 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0636361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4183  6-phosphogluconate phosphatase  38.04 
 
 		 221 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.201399  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03599  predicted hydrolase  34.11 
 
 		 221 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4279  6-phosphogluconate phosphatase  34.11 
 
 		 221 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3929  6-phosphogluconate phosphatase  34.11 
 
 		 221 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4224  6-phosphogluconate phosphatase  34.11 
 
 		 221 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03543  hypothetical protein  34.11 
 
 		 221 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4252  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.11 
 
 		 221 aa  135  8e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5021  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.94 
 
 		 223 aa  134  9e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.886555  normal  0.11436 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4082  6-phosphogluconate phosphatase  37.3 
 
 		 221 aa  132  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.580327 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5146  6-phosphogluconate phosphatase  36.76 
 
 		 221 aa  131  9e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.107109 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0113  HAD family hydrolase  36.26 
 
 		 215 aa  125  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.254082  normal  0.189909 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2743  HAD family hydrolase  32.55 
 
 		 227 aa  122  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.994994  normal  0.0511558 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2352  HAD family hydrolase  35.24 
 
 		 222 aa  122  7e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00492029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5789  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  32.65 
 
 		 248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.805096 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2303  HAD family hydrolase  35.85 
 
 		 230 aa  119  4.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.432343  normal  0.0684019 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3573  hypothetical protein  33.69 
 
 		 224 aa  118  7e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141866  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1190  hypothetical protein  35.2 
 
 		 204 aa  117  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3367  isochorismate synthase  36.56 
 
 		 208 aa  114  8.999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0514575 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0442  HAD family hydrolase  35 
 
 		 218 aa  112  6e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4494  HAD family hydrolase  35.38 
 
 		 217 aa  112  6e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.901613 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4120  HAD family hydrolase  32.12 
 
 		 237 aa  111  9e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3783  HAD family hydrolase  35.53 
 
 		 242 aa  111  9e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0711244  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3578  hypothetical protein  32.12 
 
 		 227 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1543  HAD family hydrolase  35.48 
 
 		 218 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.290377 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0085  HAD family hydrolase  30.65 
 
 		 228 aa  108  8.000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1388  HAD family hydrolase  32 
 
 		 223 aa  107  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1679  HAD family hydrolase  33.65 
 
 		 228 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.329871  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0959  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3 family protein  35.45 
 
 		 216 aa  107  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0734377  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0089  hypothetical protein  32.63 
 
 		 228 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.16166  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1899  HAD family hydrolase  30.35 
 
 		 233 aa  107  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.629061  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1725  HAD family hydrolase  32.63 
 
 		 228 aa  106  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0243  HAD family hydrolase  32.8 
 
 		 217 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4509  HAD family hydrolase  33.16 
 
 		 225 aa  105  9e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3747  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.5 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.422409  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0969  HAD superfamily hydrolase  32.13 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.512298  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0110  HAD family hydrolase  33.16 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3493  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.25 
 
 		 228 aa  104  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.292984 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0045  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  30.11 
 
 		 232 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  0.617373 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0109  HAD family hydrolase  32.52 
 
 		 223 aa  102  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00453013 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0467  HAD family hydrolase  33.16 
 
 		 219 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.577769 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0412  HAD family hydrolase  31.79 
 
 		 230 aa  102  6e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.983661  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3616  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.81 
 
 		 228 aa  100  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0589  HAD family hydrolase  31.18 
 
 		 217 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02312  putative unknown enzyme  29.38 
 
 		 224 aa  101  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00322256  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3293  HAD family hydrolase  32.98 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.567903  normal  0.782847 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0909  HAD superfamily hydrolase  31.67 
 
 		 223 aa  99.4  4e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0453  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.72 
 
 		 219 aa  99.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1142  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.47 
 
 		 231 aa  99  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513371  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6257  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.82 
 
 		 240 aa  97.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.766914 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2473  HAD family hydrolase  29.36 
 
 		 230 aa  98.2  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0237734  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0271  hypothetical protein  30 
 
 		 229 aa  97.4  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.586518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3445  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4176  HAD family hydrolase  31.38 
 
 		 218 aa  96.7  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.767688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0142  HAD family hydrolase  28.31 
 
 		 235 aa  95.9  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0130  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.53 
 
 		 232 aa  94.7  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2179  HAD family hydrolase  31.89 
 
 		 223 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.812633 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5532  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.22 
 
 		 214 aa  94  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5978  HAD family hydrolase  31.05 
 
 		 230 aa  93.2  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.367832 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0122  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.12 
 
 		 229 aa  92.8  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3250  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.94 
 
 		 223 aa  91.7  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0996  HAD family hydrolase  26.29 
 
 		 219 aa  88.6  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0106068 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0545  HAD-superfamily hydrolase  28.28 
 
 		 246 aa  88.6  8e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0603  HAD family hydrolase  26.07 
 
 		 230 aa  88.2  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.432882  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0642  HAD family hydrolase  30.57 
 
 		 255 aa  87.4  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.911495  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4948  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.32 
 
 		 223 aa  84.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  27.1 
 
 		 221 aa  85.1  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0489  HAD superfamily hydrolase  26.67 
 
 		 228 aa  83.6  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0902  hydrolase, haloacid dehalogenase-like hydrolase  29.82 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  32.46 
 
 		 396 aa  84  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3004  HAD family hydrolase  30.41 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.293742 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0493  phosphoglycolate phosphatase  26.67 
 
 		 228 aa  83.6  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0539  HAD family hydrolase  27.32 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598939  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2561  HAD family hydrolase  29.82 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.467395  normal  0.978444 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3787  HAD family hydrolase  26.96 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2538  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.1 
 
 		 241 aa  82.4  0.000000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1631  HAD family hydrolase  29.48 
 
 		 230 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.318646  normal  0.223643 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0762  HAD family hydrolase  28.12 
 
 		 229 aa  81.6  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1040  HAD family hydrolase  30.37 
 
 		 226 aa  80.9  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000171478  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2542  HAD family hydrolase  26.92 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.214098 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.81 
 
 		 228 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866957  normal  0.157588 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7385  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  26.27 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3047  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.14 
 
 		 226 aa  80.1  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>