More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05872 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_3654  ClpA/B type protease  48.36 
 
 		 889 aa  770    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0097  ATPase  50.67 
 
 		 866 aa  824    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02051  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  46.7 
 
 		 910 aa  759    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0433  clpB protein, putative  51.78 
 
 		 875 aa  827    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1684  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  43.01 
 
 		 898 aa  652    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1474  type VI secretion ATPase  42.69 
 
 		 885 aa  646    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3095  chaperone-associated ATPase, putative  45.23 
 
 		 878 aa  717    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.829668 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1102  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  47.81 
 
 		 911 aa  753    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3610  type VI secretion ATPase  50.89 
 
 		 875 aa  832    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1177  chaperone ClpB-1  41.74 
 
 		 872 aa  674    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.1943  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3129  ClpA/ClpB family protein  45.49 
 
 		 881 aa  734    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01959  putative CLPA/B-type chaperone protein  47.03 
 
 		 905 aa  743    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1789  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  44.25 
 
 		 884 aa  684    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0160275  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00259  ClpB  43.31 
 
 		 901 aa  664    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.388989  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2924  type VI secretion ATPase  48.56 
 
 		 889 aa  781    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2548  clpB protein, putative  48.61 
 
 		 867 aa  840    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.575234  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5425  clpB protein, putative  51.17 
 
 		 882 aa  849    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0295  ATPase  43.46 
 
 		 879 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.621453  normal  0.878276 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2954  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  44.25 
 
 		 888 aa  691    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.400792  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2830  ClpA/B type protease  47.98 
 
 		 897 aa  767    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0409  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  44.25 
 
 		 884 aa  685    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.834401  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4919  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  48.24 
 
 		 891 aa  761    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.989717  hitchhiker  0.00768481 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0237  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  47.21 
 
 		 923 aa  750    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3147  ClpA/B type protease  48.36 
 
 		 889 aa  770    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4958  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal:Clp, N terminal  45.17 
 
 		 867 aa  731    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0459  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  44.25 
 
 		 884 aa  684    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2171  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  46.77 
 
 		 899 aa  757    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.203695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1727  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  45.01 
 
 		 898 aa  725    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.141687  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1789  ATPase  45.34 
 
 		 884 aa  756    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5260  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal:phosphopantetheine attachment site  46.9 
 
 		 913 aa  767    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0229  type VI secretion ATPase  47.28 
 
 		 923 aa  748    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3629  ClpA/B type protease  48.36 
 
 		 889 aa  772    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2505  AAA family ATPase  46.21 
 
 		 880 aa  754    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3638  protease associated ATPase ClpB  48.36 
 
 		 889 aa  772    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1194  SciG protein  44.36 
 
 		 888 aa  694    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.445857  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1221  chaperone protein clpB  47.99 
 
 		 911 aa  753    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.362993 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3036  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  43.05 
 
 		 903 aa  691    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.125208  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3412  ClpA/B-type protease  45.67 
 
 		 846 aa  654    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.219119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3118  ATPase  47.06 
 
 		 889 aa  702    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0362166 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5584  ClpB protein, putative  51.28 
 
 		 885 aa  863    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3069  ATPase  46.92 
 
 		 882 aa  756    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3474  hypothetical protein  46.88 
 
 		 889 aa  684    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2820  heat shock protein ClpB-like  47.49 
 
 		 899 aa  775    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3565  chaperonin clpA/B/, ATPase  48.02 
 
 		 889 aa  771    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0530  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  42.84 
 
 		 909 aa  709    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1582  AAA ATPase, Clp  44.42 
 
 		 887 aa  688    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.385377 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2769  type VI secretion ATPase  45.23 
 
 		 865 aa  733    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186875  normal  0.804579 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3315  AAA ATPase  53.16 
 
 		 878 aa  810    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2829  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  44.47 
 
 		 888 aa  693    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2627  ATPase  44.46 
 
 		 865 aa  683    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1119  chaperone ClpB  52.95 
 
 		 872 aa  815    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.135027  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50860  AAA ATPase  45.89 
 
 		 842 aa  648    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0264  ClpA/B type protease  44.28 
 
 		 885 aa  691    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3644  type VI secretion ATPase  44.77 
 
 		 902 aa  715    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.9184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2958  ClpA/B type protease  48.41 
 
 		 887 aa  776    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0804  type VI secretion ATPase  46 
 
 		 880 aa  751    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.493869  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0322  type VI secretion ATPase  48.55 
 
 		 867 aa  764    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26610  ClpA/B-type protease  43.16 
 
 		 886 aa  657    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.526897  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05872  ClpA/B type protease  100 
 
 		 894 aa  1828    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2505  type VI secretion ATPase  45.23 
 
 		 865 aa  738    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.58674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0732  type VI secretion ATPase  46.16 
 
 		 882 aa  747    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.759249  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1536  fibronectin, type III  43.92 
 
 		 897 aa  701    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0231  ATP-dependent chaperone protein ClpB  47.38 
 
 		 919 aa  754    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2366  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  43.89 
 
 		 904 aa  691    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.266382 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1362  Clp protease-associated protein ClpB  42.69 
 
 		 885 aa  646    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1205  ATPase  49.37 
 
 		 873 aa  810    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.394277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2273  ATPase AAA-2  45.5 
 
 		 889 aa  727    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0162  type VI secretion ATPase  43.95 
 
 		 902 aa  701    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.475088  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2331  ATPase  45.03 
 
 		 900 aa  701    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0518917  normal  0.0250901 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0618  ATPase AAA-2  47.03 
 
 		 893 aa  764    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0224161 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0395  type VI secretion ATPase  48.44 
 
 		 867 aa  761    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2890  type VI secretion ATPase  46.65 
 
 		 849 aa  657    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5984  type VI secretion ATPase  44.43 
 
 		 909 aa  717    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3255  type VI secretion ATPase  44.93 
 
 		 884 aa  704    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2632  ATPase AAA-2  52.5 
 
 		 681 aa  675    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0170  AAA family ATPase  45.67 
 
 		 882 aa  743    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000964396 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3013  ATPase  45.59 
 
 		 887 aa  711    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0021  clpB protein  50.4 
 
 		 869 aa  800    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2362  ATPase  45.36 
 
 		 868 aa  748    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.488644  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1713  ClpA/B type protease  48.36 
 
 		 889 aa  770    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0387  ATPase  47.9 
 
 		 889 aa  759    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.315602  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0200  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  44.73 
 
 		 908 aa  657    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01100  putative ClpA/B-type chaperone  44.64 
 
 		 902 aa  704    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33990  putative ClpA/B-type protease  46.21 
 
 		 849 aa  654    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000016123  normal  0.0826946 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42980  putative ClpA/B-type protease  51.38 
 
 		 877 aa  848    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.172523  normal  0.0852173 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3864  type VI secretion ATPase  44.28 
 
 		 928 aa  655    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00372415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4084  type VI secretion ATPase  44.65 
 
 		 916 aa  705    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000202411 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0473  ATPase  47.86 
 
 		 889 aa  768    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0451  type VI secretion ATPase  47.65 
 
 		 889 aa  765    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2520  type VI secretion ATPase  49.44 
 
 		 863 aa  803    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2440  ATPase  43.78 
 
 		 915 aa  660    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.217736  normal  0.396011 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2696  Clp ATPase  42.96 
 
 		 891 aa  649    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.310032  hitchhiker  0.00716242 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0310  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  43.32 
 
 		 879 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0408  type VI secretion ATPase  47.69 
 
 		 889 aa  756    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3724  ATPase  50.06 
 
 		 895 aa  811    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.154192  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0298  ClpV1 family type VI secretion ATPase  43.58 
 
 		 879 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.140659 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1482  ATPase  43.39 
 
 		 925 aa  665    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2982  AAA family ATPase  46.16 
 
 		 880 aa  750    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00017738 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1606  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  44.25 
 
 		 884 aa  685    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0054  ClpA/B type protease  47.98 
 
 		 897 aa  767    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.622723  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>