45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05861 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05861  hypothetical protein  100 
 
 
136 aa  280  7.000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000439  hypothetical protein  98.53 
 
 
136 aa  276  1e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319963  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3312  hypothetical protein  35.11 
 
 
136 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0430  tail lysozyme, putative  33.59 
 
 
135 aa  80.1  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0047  hypothetical protein  33.33 
 
 
142 aa  70.9  0.000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2527  type VI secretion system lysozyme-related protein  33.04 
 
 
141 aa  67  0.00000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5431  hypothetical protein  32.52 
 
 
135 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5593  hypothetical protein  34.58 
 
 
135 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1122  putative type VI secretion protein VasS  32.79 
 
 
141 aa  65.5  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111003  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3731  hypothetical protein  33.61 
 
 
145 aa  65.1  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0092  GPW/gp25 family protein  29.55 
 
 
142 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1072  type VI secretion system lysozyme-related protein  30.65 
 
 
143 aa  62.8  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3253  type VI secretion system lysozyme-related protein  30.65 
 
 
143 aa  62  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3613  hypothetical protein  32.14 
 
 
135 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.231309  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43020  hypothetical protein  31.78 
 
 
135 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.434691 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0388  type VI secretion system lysozyme-related protein  33.33 
 
 
146 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3226  type VI secretion system lysozyme-related protein  32.71 
 
 
136 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3903  hypothetical protein  33.33 
 
 
146 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0315  hypothetical protein  33.33 
 
 
146 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1198  GPW/gp25 family protein  25.56 
 
 
145 aa  58.2  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.308622  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2805  type VI secretion system lysozyme-related protein  31.78 
 
 
143 aa  57.4  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0867  hypothetical protein  29.55 
 
 
158 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2545  hypothetical protein  31.13 
 
 
135 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0298259  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4076  hypothetical protein  29.81 
 
 
136 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000287373  unclonable  0.000000759929 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2622  hypothetical protein  35.29 
 
 
136 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0741  hypothetical protein  28.03 
 
 
153 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.228212  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0607  hypothetical protein  28.03 
 
 
153 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0718  hypothetical protein  28.03 
 
 
153 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.236426  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1676  hypothetical protein  28.03 
 
 
153 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3409  hypothetical protein  25.95 
 
 
147 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0029  hypothetical protein  30 
 
 
141 aa  50.4  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.475972  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34020  hypothetical protein  29.09 
 
 
141 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.311323  normal  0.0827701 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2125  GPW/gp25 family protein  34.12 
 
 
136 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.718172  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2893  hypothetical protein  30.56 
 
 
141 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2028  hypothetical protein  27.52 
 
 
153 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2126  hypothetical protein  27.52 
 
 
153 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.753195  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0537  hypothetical protein  27.52 
 
 
153 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1803  GPW/gp25 family protein  28.12 
 
 
149 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200889  normal  0.04666 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0244  hypothetical protein  30.63 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0238  hypothetical protein  30.63 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0236  hypothetical protein  30.63 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3242  type VI secretion system lysozyme-related protein  28.95 
 
 
148 aa  40.4  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.963032  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2636  GPW/gp25 family protein  22.55 
 
 
116 aa  40.4  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.06569  hitchhiker  0.000477271 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2602  GPW/gp25 family protein  22.55 
 
 
116 aa  40.4  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0538459  hitchhiker  0.000000000023308 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50830  hypothetical protein  25 
 
 
150 aa  40.4  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0626343  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>