More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05821 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05821  homocysteine S-methyltransferase  100 
 
 
301 aa  627  1e-179  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0658  homocysteine S-methyltransferase family protein  47.35 
 
 
311 aa  285  7e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.778946  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0692  homocysteine S-methyltransferase  46.69 
 
 
311 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0245772 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4282  homocysteine S-methyltransferase  45.48 
 
 
309 aa  279  4e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2776  homocysteine S-methyltransferase family protein  46.98 
 
 
307 aa  278  6e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420407  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4837  homocysteine S-methyltransferase  46.82 
 
 
309 aa  277  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.345042 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2160  homocysteine S-methyltransferase  46.98 
 
 
310 aa  277  1e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00664  homocysteine S-methyltransferase family protein  45.72 
 
 
305 aa  273  3e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2779  homocysteine S-methyltransferase  47.44 
 
 
308 aa  272  6e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2930  homocysteine S-methyltransferase  45.1 
 
 
303 aa  268  5.9999999999999995e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5121  homocysteine S-methyltransferase  47.02 
 
 
299 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0135376  normal  0.478948 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6804  homocysteine S-methyltransferase  44.55 
 
 
313 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3747  homocysteine S-methyltransferase  48.31 
 
 
302 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0975  homocysteine S-methyltransferase  46.49 
 
 
310 aa  249  6e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000866621  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1277  homocysteine S-methyltransferase  44.48 
 
 
300 aa  245  8e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0441893 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3243  homocysteine S-methyltransferase  43.81 
 
 
300 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.562987  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1497  homocysteine S-methyltransferase  42.9 
 
 
310 aa  242  6e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.191799  normal  0.658864 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1135  homocysteine S-methyltransferase family protein  44.26 
 
 
298 aa  240  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.300332  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4534  homocysteine S-methyltransferase  43 
 
 
302 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0770365 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5017  S-methyltransferase  41.67 
 
 
301 aa  238  1e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3865  homocysteine S-methyltransferase  43.14 
 
 
300 aa  236  2e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6392  homocysteine S-methyltransferase  40.47 
 
 
302 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.612657 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3090  homocysteine S-methyltransferase  44.82 
 
 
300 aa  231  9e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3100  homocysteine S-methyltransferase  44.82 
 
 
300 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2815  homocysteine S-methyltransferase  36.27 
 
 
304 aa  170  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48307  predicted protein  32.39 
 
 
346 aa  168  1e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.532238  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0392  homocysteine S-methyltransferase  35.08 
 
 
305 aa  162  8.000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.108543  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1598  homocysteine S-methyltransferase  34 
 
 
297 aa  144  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.296852 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3928  homocysteine S-methyltransferase  34.68 
 
 
308 aa  124  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.45742 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1230  homocysteine S-methyltransferase  27.13 
 
 
311 aa  97.1  3e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.829907  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0866  homocysteine methyltransferase  23.81 
 
 
316 aa  96.7  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.142005  normal  0.135969 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5466  homocysteine methyltransferase  26.99 
 
 
325 aa  93.6  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0696243  hitchhiker  0.00895387 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2200  homocysteine S-methyltransferase  27.76 
 
 
307 aa  91.7  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.558388  normal  0.514236 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3471  homocysteine methyltransferase  29.78 
 
 
312 aa  89.7  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0182  methionine synthase  25.89 
 
 
1263 aa  83.2  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0799  methionine synthase I  28 
 
 
335 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2124  methionine synthase I  28 
 
 
335 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0828  homocysteine methyltransferase  25.71 
 
 
311 aa  82.4  0.000000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1535  homocysteine methyltransferase  26.84 
 
 
315 aa  82  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.521433  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0595  B12-dependent methionine synthase  26.77 
 
 
1272 aa  81.3  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1268  homocysteine S-methyltransferase  25.32 
 
 
320 aa  80.1  0.00000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.897971 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  27.45 
 
 
800 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01795  homocysteine methyltransferase  27.1 
 
 
325 aa  77.4  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.443349  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1792  homocysteine S-methyltransferase  25.16 
 
 
774 aa  77.4  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.709712  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2926  homocysteine methyltransferase  26.98 
 
 
313 aa  77  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0709  methionine synthase I  26.8 
 
 
357 aa  75.9  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3344  homocysteine S-methyltransferase  25.24 
 
 
310 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2740  homocysteine methyltransferase  26.47 
 
 
287 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164066  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1101  B12-dependent methionine synthase  25.07 
 
 
1230 aa  74.7  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875071  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4156  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  24.76 
 
 
1132 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4478  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  24.76 
 
 
1132 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1305  homocysteine methyltransferase  28.44 
 
 
314 aa  73.9  0.000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.343801  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4005  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  24.76 
 
 
1133 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1187  homocysteine S-methyltransferase  26.86 
 
 
629 aa  73.9  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4274  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  24.76 
 
 
1132 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3995  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  24.76 
 
 
1133 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0657  methionine synthase  25.82 
 
 
1238 aa  73.6  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0891  homocysteine S-methyltransferase  25.32 
 
 
303 aa  73.2  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.784239 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0868  methionine synthase  25.08 
 
 
1132 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2983  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  24.37 
 
 
1132 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0113  B12-dependent methionine synthase  25.91 
 
 
1227 aa  73.2  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.352445  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4366  methionine synthase  25.08 
 
 
1132 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1526  B12-dependent methionine synthase  24.77 
 
 
1232 aa  72.8  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0295  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  24.85 
 
 
346 aa  72.4  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4332  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  24.76 
 
 
1132 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0149  homocysteine S-methyltransferase  24.55 
 
 
346 aa  72.4  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.637039 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1206  B12-dependent methionine synthase  25.15 
 
 
1232 aa  72  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1315  homocysteine S-methyltransferase  24.16 
 
 
288 aa  72  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0420975  normal  0.31637 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2062  B12-dependent methionine synthase  25.15 
 
 
1228 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.458303  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0156  homocysteine S-methyltransferase  24.24 
 
 
346 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4385  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  24.14 
 
 
1132 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3503  methionine synthase  25.54 
 
 
1212 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.929135  normal  0.479801 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37350  homocysteine methyltransferase  23.05 
 
 
295 aa  70.5  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.493269 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002355  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  24.24 
 
 
1226 aa  70.9  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2492  methionine synthase (B12-dependent)  25.08 
 
 
1224 aa  70.5  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.494606  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1138  methionine synthase  26.07 
 
 
1215 aa  70.9  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.537288  normal  0.145457 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1689  homocysteine S-methyltransferase  25.61 
 
 
354 aa  70.1  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1980  methionine synthase  24.74 
 
 
354 aa  70.1  0.00000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3775  B12-dependent methionine synthase  24.92 
 
 
1227 aa  69.7  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0772  homocysteine S-methyltransferase  23.62 
 
 
780 aa  70.1  0.00000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0538889  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0118  methionine synthase (B12-dependent)  25.15 
 
 
351 aa  69.7  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3951  B12-dependent methionine synthase  24.46 
 
 
1227 aa  69.3  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360627  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2433  methionine synthase  24.4 
 
 
1236 aa  69.3  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1508  homocysteine S-methyltransferase  24.7 
 
 
334 aa  69.3  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0454  B12-dependent methionine synthase  24.92 
 
 
1228 aa  68.6  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0341811  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6259  methionine synthase (B12-dependent)  25.37 
 
 
372 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0369  B12-dependent methionine synthase  24.53 
 
 
1228 aa  68.9  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.789152  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0222  B12-dependent methionine synthase  23.77 
 
 
1227 aa  68.9  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.145544 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0283  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  27.88 
 
 
615 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0238  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  25.42 
 
 
609 aa  67.4  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0315  B12-dependent methionine synthase  24.39 
 
 
1225 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000170465 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1146  homocysteine methyltransferase  24.12 
 
 
319 aa  67.8  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000617566 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0325  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  27.39 
 
 
605 aa  67.8  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0358  homocysteine S-methyltransferase, putative  23.85 
 
 
358 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0102  homocysteine S-methyltransferase  24.39 
 
 
344 aa  67.4  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3282  B12-dependent methionine synthase  25.83 
 
 
1244 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4108  methionine synthase  23.64 
 
 
1132 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0403  B12-dependent methionine synthase  26.69 
 
 
1271 aa  67  0.0000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0459446  hitchhiker  0.000026899 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0141  homocysteine S-methyltransferase  23.55 
 
 
816 aa  67  0.0000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000403798  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0169  homocysteine S-methyltransferase  25 
 
 
368 aa  66.6  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>