More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05715 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05715  Na+-driven multidrug efflux pump  100 
 
 		 461 aa  925    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000109  adhesin  83.95 
 
 		 461 aa  804    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.466925  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003772  Na+ driven multidrug efflux pump  33.18 
 
 		 458 aa  267  2.9999999999999995e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02650  hypothetical protein  33.11 
 
 		 458 aa  262  8.999999999999999e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2022  multidrug efflux pump  34.01 
 
 		 459 aa  257  3e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.54695  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1237  hypothetical protein  31.71 
 
 		 458 aa  255  1.0000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0290804  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2766  MATE efflux family protein  33.33 
 
 		 453 aa  249  1e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0984562  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3712  MATE efflux family protein  32.81 
 
 		 454 aa  235  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139203  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0830  MATE efflux family protein  30.34 
 
 		 445 aa  227  3e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000918772  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0279  MATE efflux family protein  28.92 
 
 		 445 aa  218  1e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2828  MATE efflux family protein  29.87 
 
 		 463 aa  217  4e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2514  MATE efflux family protein  29.65 
 
 		 463 aa  216  5e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0330  MATE efflux family protein  29.18 
 
 		 479 aa  212  1e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0621  MATE efflux family protein  29.57 
 
 		 460 aa  207  3e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.27098  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0537  hypothetical protein  31.05 
 
 		 460 aa  207  4e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0897  MATE efflux family protein  28.82 
 
 		 453 aa  194  3e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000262958  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0848  MATE efflux family protein  27.79 
 
 		 458 aa  193  6e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.720761  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0857  MATE efflux family protein  27.79 
 
 		 458 aa  192  8e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0522  MATE efflux family protein  26.81 
 
 		 461 aa  186  7e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0994  MATE efflux family protein  28.32 
 
 		 449 aa  181  2.9999999999999997e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1138  MATE efflux family protein  27.19 
 
 		 450 aa  172  1e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000318212  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1116  MATE efflux family protein  25.22 
 
 		 456 aa  158  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1981  MATE efflux family protein  22.42 
 
 		 455 aa  151  3e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0743  MATE efflux family protein  24.79 
 
 		 484 aa  150  4e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000192336  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18490  MATE efflux family protein  26.49 
 
 		 442 aa  138  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000174233  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  24.57 
 
 		 464 aa  123  9e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000923462  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  28.92 
 
 		 469 aa  121  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2630  MATE efflux family protein  26.73 
 
 		 472 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.850794  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0981  MATE efflux family protein  25.56 
 
 		 456 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.730082  normal  0.0880752 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  20.96 
 
 		 475 aa  118  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1106  MATE efflux family protein  24.49 
 
 		 464 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1088  efflux protein  24.49 
 
 		 464 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000024435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  24.49 
 
 		 464 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1196  MATE efflux family protein  24.49 
 
 		 464 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000655029  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1343  MATE efflux family protein  24.49 
 
 		 464 aa  117  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000317655  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0901  MATE efflux family protein  24.31 
 
 		 463 aa  117  5e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000627796  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  24.95 
 
 		 469 aa  116  6e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1506  MATE efflux family protein  25.05 
 
 		 450 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1266  MATE efflux family protein  24.49 
 
 		 464 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1305  MATE efflux family protein  24.6 
 
 		 464 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.40401  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4103  Na+ driven multidrug efflux pump  24.37 
 
 		 463 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0660054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000940  Na+ driven multidrug efflux pump  25.39 
 
 		 446 aa  113  7.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000926882  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3485  MATE efflux family protein  25.97 
 
 		 453 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1239  MATE efflux family protein  24.14 
 
 		 464 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  25.94 
 
 		 459 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0299  MATE efflux family protein  25.96 
 
 		 456 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3315  MATE efflux family protein  25.51 
 
 		 456 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0638  MATE efflux family protein  25.51 
 
 		 456 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  24.03 
 
 		 438 aa  108  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  22.93 
 
 		 453 aa  108  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3187  MATE efflux family protein  25.17 
 
 		 486 aa  108  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2475  MATE efflux family protein  24.01 
 
 		 463 aa  107  4e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.211957  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0802  MATE efflux family protein  24.6 
 
 		 453 aa  106  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0597  hypothetical protein  21.92 
 
 		 444 aa  105  1e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0691  MATE efflux family protein  23.52 
 
 		 450 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3760  MATE efflux family protein  24.61 
 
 		 464 aa  104  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0651  MATE efflux family protein  23.79 
 
 		 446 aa  103  5e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000388571  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  24 
 
 		 458 aa  103  7e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  22.25 
 
 		 446 aa  101  3e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5025  MATE efflux family protein  25.78 
 
 		 461 aa  101  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274377  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3779  MATE efflux family protein  25.45 
 
 		 453 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  23.33 
 
 		 450 aa  100  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2156  MATE efflux family protein  23.4 
 
 		 451 aa  99.8  9e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  26.5 
 
 		 464 aa  99.4  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2425  MATE efflux family protein  23 
 
 		 461 aa  99.4  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.264518  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  26.82 
 
 		 464 aa  99.4  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  25.24 
 
 		 468 aa  99.4  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0536  mate efflux family protein  22.57 
 
 		 440 aa  99  2e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06935  Na+-driven multidrug efflux pump  24.43 
 
 		 446 aa  99  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  24.58 
 
 		 452 aa  97.8  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09173  MATE efflux family protein  24.38 
 
 		 457 aa  97.1  6e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  23.74 
 
 		 445 aa  97.1  6e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0649  MATE efflux family protein  25.45 
 
 		 453 aa  97.1  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  27.08 
 
 		 462 aa  97.1  7e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3656  MATE efflux family protein  24.72 
 
 		 453 aa  96.3  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3589  MATE efflux family protein  24.07 
 
 		 476 aa  95.5  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1709  MATE efflux family protein  24.75 
 
 		 470 aa  94.7  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578822 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3419  MATE efflux family protein  25.25 
 
 		 504 aa  94.4  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  23.54 
 
 		 454 aa  94.4  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0596  hypothetical protein  23.28 
 
 		 449 aa  94.4  4e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.207285  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0723  multidrug resistance protein  25.64 
 
 		 454 aa  94  5e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  22.36 
 
 		 463 aa  93.6  6e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0883  MATE efflux family protein  22.51 
 
 		 451 aa  92.4  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  21.32 
 
 		 448 aa  92.8  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  25.68 
 
 		 468 aa  92.8  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  21.67 
 
 		 467 aa  92  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2542  MATE efflux family protein  25.23 
 
 		 459 aa  92.4  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0078  mate efflux family protein  22.3 
 
 		 439 aa  92.4  2e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.129262  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7238  MATE efflux family protein  20.81 
 
 		 450 aa  91.7  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  23.95 
 
 		 475 aa  90.9  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1139  hypothetical protein  21.62 
 
 		 484 aa  90.5  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000023845  hitchhiker  0.0000334983 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  24.7 
 
 		 461 aa  90.5  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  23.82 
 
 		 483 aa  90.5  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1252  MATE efflux family protein  21.46 
 
 		 445 aa  90.1  8e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000131388  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  25.78 
 
 		 460 aa  90.1  8e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0441  MATE efflux family protein  23.06 
 
 		 446 aa  89.4  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000223642  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0645  DcuC protein  21.9 
 
 		 439 aa  89.7  1e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2108  hypothetical protein  21.83 
 
 		 546 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.24671e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2267  hypothetical protein  21.62 
 
 		 546 aa  89  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000010697  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1669  MATE efflux family protein  21.62 
 
 		 495 aa  89  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135228  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>