More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05708 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05708  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  199  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0586  ArsR family transcriptional regulator  62.77 
 
 		 105 aa  131  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000101  transcriptional regulator ArsR family  67.39 
 
 		 102 aa  129  9e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.344497  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3631  transcriptional regulator of ArsR family protein  62.07 
 
 		 103 aa  110  8.000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1717  ArsR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 122 aa  90.5  7e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.805435  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0456  ArsR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 107 aa  85.9  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0026  ArsR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 101 aa  85.9  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.849172  normal  0.018094 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2367  regulatory protein ArsR  43.01 
 
 		 97 aa  85.9  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.74667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1211  transcriptional regulator, ArsR family  40.86 
 
 		 113 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3223  ArsR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 123 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0020  regulatory protein, ArsR  43.01 
 
 		 101 aa  85.1  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0028  regulatory protein, ArsR  41.94 
 
 		 102 aa  84.3  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000136281  normal  0.0492639 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0396  ArsR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 107 aa  84.3  5e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0018  transcriptional regulator, ArsR family protein  42.39 
 
 		 101 aa  84  6e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.591177  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3331  regulatory protein ArsR  44.83 
 
 		 116 aa  83.6  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0576  transcriptional activator HlyU  45.16 
 
 		 103 aa  83.6  9e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000103894  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0024  ArsR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 101 aa  83.6  9e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000555304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1079  ArsR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 104 aa  83.6  9e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000795282  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  40.23 
 
 		 115 aa  82.8  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1609  regulatory protein ArsR  40.86 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.020188  normal  0.119159 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2074  ArsR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 114 aa  82  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.362278  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1996  ArsR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 114 aa  82  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.422542  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2894  transcriptional regulator, ArsR family protein  45.74 
 
 		 98 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0578791  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1095  ArsR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 98 aa  82  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000620503  normal  0.070685 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1236  ArsR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 101 aa  81.6  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118736  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0037  ArsR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 102 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.139091 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1190  ArsR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 98 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00010661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  40.43 
 
 		 114 aa  80.9  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1287  ArsR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 98 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000165957  normal  0.329148 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0920  transcriptional regulator HlyU  44.57 
 
 		 98 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000331953  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3538  transcriptional regulator HlyU  44.57 
 
 		 98 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2435  ArsR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.285599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1050  regulatory protein, ArsR  44.57 
 
 		 98 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000242354  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3239  transcriptional regulator, ArsR family  44.57 
 
 		 98 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00078895  normal  0.52452 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1117  regulatory protein ArsR  44.57 
 
 		 98 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000362609  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1151  ArsR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 98 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000355977  normal  0.185077 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0025  ArsR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 101 aa  79  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0018  regulatory protein, ArsR  39.78 
 
 		 102 aa  79  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.413678  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2961  ArsR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 98 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000318119  normal  0.703465 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3043  ArsR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 98 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000176438  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0240  ArsR family transcriptional regulator  43.82 
 
 		 110 aa  78.6  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1055  regulatory protein, ArsR  44.57 
 
 		 98 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.584265  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3141  ArsR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 98 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000177762  normal  0.988511 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1410  transcriptional regulator, ArsR family  36.17 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4302  ArsR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 106 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4153  transcriptional regulator, ArsR family  38.04 
 
 		 119 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4201  regulatory protein, ArsR  40.66 
 
 		 106 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541615  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0026  ArsR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 102 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1742  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 106 aa  77.4  0.00000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11027 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1619  regulatory protein ArsR  37.78 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000554955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0025  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 102 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00398711  normal  0.0110166 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0132  transcriptional regulator, TrmB  40.91 
 
 		 107 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500146  normal  0.0196192 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3285  transcriptional regulator ArsR family  39.33 
 
 		 105 aa  76.3  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2476  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 110 aa  76.6  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0025  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 		 102 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111257  hitchhiker  0.00000153005 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0021  regulatory protein ArsR  39.13 
 
 		 102 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00282375  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0026  regulatory protein, ArsR  39.13 
 
 		 102 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000871967  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0023  ArsR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 102 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000124872  hitchhiker  0.000733869 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0021  ArsR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 102 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000364753  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48910  ArsR family regulatory protein  39.33 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.316349  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0029  ArsR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 102 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000481298  hitchhiker  0.000000745632 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0210  transcriptional activator HlyU  42.68 
 
 		 85 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000976206  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0363  regulatory protein, ArsR  37.11 
 
 		 111 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000621973 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2068  ArsR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 96 aa  75.5  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.887596  normal  0.21575 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1617  ArsR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 115 aa  75.9  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.755746  normal  0.662554 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1791  ArsR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 96 aa  75.1  0.0000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0793  regulatory protein, ArsR  36.26 
 
 		 105 aa  75.5  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4701  regulatory protein, ArsR  38.71 
 
 		 106 aa  75.1  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593544  normal  0.304994 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0454  ArsR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 92 aa  74.7  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1189  transcriptional regulator, ArsR family  40.86 
 
 		 142 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3721  ArsR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 104 aa  74.3  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0645821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0234  ArsR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 112 aa  73.9  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2615  ArsR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 119 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.237547  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6240  ArsR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 94 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2369  transcriptional regulator, ArsR family  42.35 
 
 		 100 aa  73.6  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000230878  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2002  transcriptional regulator, ArsR family  42.35 
 
 		 100 aa  73.6  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1206  ArsR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 115 aa  73.6  0.0000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.233915  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2727  regulatory protein, ArsR  42.27 
 
 		 98 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000369896  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 104 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2351  transcriptional regulator, ArsR family  40.82 
 
 		 109 aa  73.2  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000226954  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1286  transcriptional regulator, ArsR family  34.74 
 
 		 109 aa  72.8  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0854  regulatory protein, ArsR  37.5 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229848 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004423  transcriptional activator HlyU  39.78 
 
 		 100 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000188739  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3096  transcriptional regulator, ArsR family  38.37 
 
 		 105 aa  72  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.556468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2812  transcriptional regulator  36.84 
 
 		 111 aa  72  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.158239 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1937  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3286  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 		 106 aa  72  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1543  transcription regulator protein  33.68 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0436972 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3214  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 		 99 aa  71.6  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2370  ArsR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 103 aa  71.6  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000192814  hitchhiker  0.0000168087 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2827  transcriptional regulator, ArsR family  38.55 
 
 		 105 aa  71.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313122  normal  0.191386 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1106  regulatory protein ArsR  36.17 
 
 		 103 aa  71.6  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6792  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.439051  normal  0.0283932 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1306  ArsR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 109 aa  70.9  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.680406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00976  hypothetical protein  39.13 
 
 		 101 aa  70.5  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  39.29 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3909  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 		 99 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.305368 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1016  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 		 99 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1039  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 99 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2947  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 99 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>