21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05692 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05692  hypothetical protein  100 
 
 
62 aa  120  8e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000079  hypothetical protein  76.56 
 
 
63 aa  84.7  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.231186  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1408  hypothetical protein  70.83 
 
 
67 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1658  hypothetical protein  54.55 
 
 
76 aa  57  0.00000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.222694  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1538  hypothetical protein  76.92 
 
 
53 aa  53.9  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.038639  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2649  hypothetical protein  49.18 
 
 
65 aa  50.4  0.000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000100004  normal  0.0307301 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2391  hypothetical protein  62.79 
 
 
54 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.595265  hitchhiker  0.00196894 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4779  hypothetical protein  71.74 
 
 
49 aa  48.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.151068  unclonable  0.00000000788092 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0117  hypothetical protein  52.73 
 
 
53 aa  47.8  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2580  hypothetical protein  53.7 
 
 
51 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0287  hypothetical protein  81.08 
 
 
63 aa  47  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000239094  hitchhiker  0.000000000863491 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4421  hypothetical protein  62.96 
 
 
60 aa  46.2  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4387  hypothetical protein  60 
 
 
52 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129081 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3277  hypothetical protein  56.52 
 
 
51 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.878206 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3136  hypothetical protein  51.85 
 
 
51 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2863  hypothetical protein  54.76 
 
 
59 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.327982 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2885  hypothetical protein  66.67 
 
 
64 aa  44.3  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0292  hypothetical protein  53.33 
 
 
86 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000163282  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0304  hypothetical protein  55.77 
 
 
83 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000261079  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0300  hypothetical protein  72.22 
 
 
66 aa  40.4  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00679932  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0299  hypothetical protein  72.22 
 
 
78 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000880989  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>