94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05656 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05899  chitinase  73 
 
 
729 aa  801  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3655  glycoside hydrolase family protein  63.1 
 
 
727 aa  712  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4085  chitinase A  65.7 
 
 
699 aa  682  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05656  chitinase  100 
 
 
565 aa  1162  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00548  chitinase  73 
 
 
729 aa  801  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2205  glycosyl hydrolase family chitinase  53.27 
 
 
492 aa  366  1e-100  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34870  chitinase  53.03 
 
 
483 aa  357  4e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0143949  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2949  chitinase  55.03 
 
 
483 aa  355  1e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1223  glycoside hydrolase family protein  54.6 
 
 
484 aa  354  2e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0824686  normal  0.0476273 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3568  glycosyl hydrolase family chitinase  55.7 
 
 
353 aa  354  2e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4777  glycoside hydrolase family 18 protein  50 
 
 
803 aa  348  2e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.202282  normal  0.127676 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0400  chitinase  49.59 
 
 
598 aa  345  9e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  1.06126e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0611  glycosy hydrolase family protein  47.25 
 
 
471 aa  295  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0693  glycoside hydrolase family protein  46.3 
 
 
471 aa  291  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl347  chitinase  36.16 
 
 
1113 aa  174  3e-42  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  1.35445e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  30.22 
 
 
1362 aa  148  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3469  chitinase  28.62 
 
 
360 aa  125  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3483  chitinase  28.62 
 
 
360 aa  125  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.219436  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3854  extracellular exochitinase Chi36  28.62 
 
 
360 aa  125  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.063231  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3571  extracellular exochitinase Chi36  28.62 
 
 
360 aa  125  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.297633  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2534  neutral protease  42.11 
 
 
887 aa  124  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.596256  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1540  chitinase  30.03 
 
 
846 aa  123  1e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.987868  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2789  bacillolysin  40.82 
 
 
893 aa  122  2e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000716183  hitchhiker  1.52737e-07 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1799  glycoside hydrolase family protein  29.64 
 
 
551 aa  119  1e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  7.60023e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3490  glycoside hydrolase family protein  29.54 
 
 
360 aa  119  1e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.678093  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3775  extracellular exochitinase Chi36  29.09 
 
 
360 aa  119  1e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  5.59542e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1704  glycosyl hydrolase family chitinase  30.1 
 
 
543 aa  119  2e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.861913 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2310  bacillolysin  48.99 
 
 
886 aa  118  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105645  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3753  extracellular exochitinase Chi36  28.62 
 
 
360 aa  118  4e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.007807  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0757  endochitinase ChiA  29.82 
 
 
846 aa  117  6e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2348  bacillolysin (neutral protease)  42.77 
 
 
890 aa  116  1e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00113983  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2571  neutral protease A, bacillolysin  44.14 
 
 
891 aa  116  1e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  4.42231e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1478  extracellular exochitinase Chi36  28.92 
 
 
360 aa  116  1e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.17366  hitchhiker  0.000283046 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2581  neutral protease  47.59 
 
 
884 aa  114  4e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1855e-15 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002720  chitinase  29.39 
 
 
848 aa  114  5e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.548595  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03258  chitinase  28.98 
 
 
846 aa  113  9e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2624  bacillolysin  40.59 
 
 
891 aa  113  1e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  6.36329e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2393  thermolysin metallopeptidase  46.9 
 
 
530 aa  111  4e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3824  extracellular exochitinase Chi36  28.31 
 
 
360 aa  110  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0158065  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1220  Carbohydrate-binding CenC domain protein  29.64 
 
 
510 aa  107  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  25.67 
 
 
1578 aa  99.8  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3770  glycoside hydrolase family 18  28 
 
 
420 aa  98.6  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5990  Carbohydrate-binding CenC domain protein  26.83 
 
 
648 aa  97.1  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.793128  normal  0.422272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7432  Chitinase-like protein  29.22 
 
 
516 aa  97.1  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.894433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1919  Chitinase-like protein  27.38 
 
 
680 aa  92.8  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0735  glycoside hydrolase family 18  28.16 
 
 
341 aa  91.3  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4225  Carbohydrate-binding CenC domain protein  28.94 
 
 
551 aa  89  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0637754 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4053  glycoside hydrolase family 18  24.37 
 
 
376 aa  88.6  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0226392 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2965  cellulose-binding family II protein  27.08 
 
 
468 aa  85.1  3e-15  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432243  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1917  Chitinase-like protein  25.82 
 
 
613 aa  79.7  1e-13  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1458  glycosyl hydrolase family chitinase  26.62 
 
 
460 aa  78.6  3e-13  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0201  chitinase like protein  40.19 
 
 
1204 aa  77.4  6e-13  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.137759 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2383  putative surface protein  38.89 
 
 
929 aa  76.6  1e-12  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13211  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3735  extracellular exochitinase Chi36  35.07 
 
 
189 aa  72.4  2e-11  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.72466e-18 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24870  predicted xylanase/chitin deacetylase  36.84 
 
 
503 aa  71.2  5e-11  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  35.61 
 
 
2638 aa  68.9  2e-10  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  31.79 
 
 
972 aa  65.9  2e-09  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3186  cellulose-binding family II protein  29.5 
 
 
467 aa  64.3  6e-09  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00151543 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0647  chitinase-related protein  40.54 
 
 
105 aa  63.9  7e-09  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01990  hypothetical protein  26.85 
 
 
582 aa  63.5  1e-08  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1101  chitinase  40.24 
 
 
565 aa  60.5  8e-08  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4667  chitin-binding protein CbpD precursor  50 
 
 
388 aa  57.8  5e-07  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.353514  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53250  chitin-binding protein CbpD precursor  50 
 
 
389 aa  57.8  5e-07  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.889986 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0423  N-acetylglucosamine-binding protein A  53.85 
 
 
485 aa  57.4  6e-07  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0208095  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1122  hypothetical protein  41.67 
 
 
105 aa  56.6  1e-06  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0136739  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0257  hypothetical protein  54 
 
 
378 aa  56.6  1e-06  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1144  hypothetical protein  41.67 
 
 
105 aa  56.6  1e-06  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0791111  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0255  endochitinase  47.46 
 
 
587 aa  55.8  2e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.931196 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0274  endochitinase  47.46 
 
 
587 aa  55.8  2e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0255  endochitinase  47.46 
 
 
587 aa  55.8  2e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.942643 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0271  endochitinase  47.46 
 
 
587 aa  55.8  2e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.527688  normal  0.775272 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05607  hypothetical protein  32.12 
 
 
962 aa  55.5  3e-06  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001124  chitin binding protein  46.43 
 
 
487 aa  53.9  7e-06  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.177583  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0260  basic endochitinase  45.76 
 
 
553 aa  53.9  7e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.361835 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1975  hypothetical protein  47.5 
 
 
967 aa  53.5  1e-05  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000301767  hitchhiker  4.79173e-05 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1073  discoidin domain-containing protein  41.54 
 
 
2142 aa  53.1  1e-05  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.742063  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04739  N-acetylglucosamine-binding protein A  44.64 
 
 
487 aa  53.1  1e-05  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0134  N-acetylglucosamine-binding protein A  44.64 
 
 
491 aa  53.5  1e-05  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271889  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3182  hypothetical protein  24.62 
 
 
334 aa  52.8  2e-05  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  3.13674e-05  decreased coverage  1.45488e-06 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1121  hypothetical protein  29.25 
 
 
782 aa  51.6  4e-05  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4362  PHB depolymerase family esterase  31.09 
 
 
576 aa  51.6  4e-05  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  50 
 
 
792 aa  50.8  6e-05  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  8.52085e-05  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1419  N-acetylglucosamine-binding protein A  43.75 
 
 
497 aa  47.4  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.28582  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_93602  predicted protein  41.54 
 
 
2146 aa  46.6  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00915503 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0949  chitinase B  39.68 
 
 
64 aa  46.2  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00782065  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1489  F5/8 type C domain-containing protein  37.5 
 
 
1687 aa  45.8  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1117  hypothetical protein  25.85 
 
 
782 aa  45.8  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3877  chitin-binding domain 3 protein  47.5 
 
 
390 aa  45.4  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.770078 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1278  leucine rich repeat domain-containing protein  37.5 
 
 
1465 aa  45.4  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0180436  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3878  chitin-binding domain 3 protein  42.55 
 
 
391 aa  45.1  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1072  N-acetylglucosamine-binding protein A  40.35 
 
 
491 aa  43.9  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0390  polysaccharide lyase family protein 8  25.98 
 
 
985 aa  43.9  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.918566  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0947  N-acetylglucosamine-binding protein A  40.35 
 
 
491 aa  43.5  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.809737  normal  0.0565044 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3027  N-acetylglucosamine-binding protein A  40.35 
 
 
491 aa  43.5  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.483728 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>