More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05548 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05548  electron transfer flavoprotein subunit beta  100 
 
 
249 aa  498  1e-140  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000407  electron transfer flavoprotein beta subunit  71.89 
 
 
250 aa  359  3e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.674522  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1995  electron transfer flavoprotein subunit beta  68.67 
 
 
249 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0184939  normal  0.281055 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1352  electron transfer flavoprotein beta-subunit  68.27 
 
 
249 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00189671  hitchhiker  0.00845091 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1417  electron transfer flavoprotein beta-subunit  68.27 
 
 
249 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000497046  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1405  electron transfer flavoprotein beta-subunit  68.27 
 
 
249 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000200993  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2185  electron transfer flavoprotein, beta subunit  68.27 
 
 
249 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2748  electron transfer flavoprotein beta-subunit  68.27 
 
 
249 aa  334  7e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000223089  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3145  electron transfer flavoprotein, beta subunit  67.87 
 
 
249 aa  334  9e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2209  electron transfer flavoprotein beta-subunit  68.67 
 
 
249 aa  334  9e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2511  electron transfer flavoprotein beta-subunit  68.27 
 
 
249 aa  334  9e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000144951  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3526  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  68.27 
 
 
249 aa  334  1e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25860  electron transfer flavoprotein beta-subunit  68.67 
 
 
249 aa  334  1e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.064795  normal  0.177804 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4117  electron transfer flavoprotein subunit beta  67.87 
 
 
249 aa  332  4e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.838389  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4202  electron transfer flavoprotein, beta subunit  67.87 
 
 
249 aa  331  9e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1651  electron transfer flavoprotein, alpha/beta-subunit-like protein  67.87 
 
 
249 aa  331  9e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2174  electron transfer flavoprotein subunit beta  67.47 
 
 
249 aa  330  1e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.892923  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3774  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  67.47 
 
 
249 aa  330  1e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00996  electron transfer flavoprotein, beta subunit  67.47 
 
 
250 aa  330  1e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.125142  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3160  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  67.07 
 
 
249 aa  330  2e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2707  electron transfer flavoprotein beta-subunit  67.87 
 
 
249 aa  329  3e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.462646  normal  0.372016 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1613  electron transfer flavoprotein beta-subunit  67.87 
 
 
250 aa  327  1.0000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44944  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2584  electron transfer flavoprotein beta-subunit  65.06 
 
 
249 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000331041  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2855  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  64.66 
 
 
249 aa  325  3e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2995  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  65.46 
 
 
249 aa  325  4.0000000000000003e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0119952  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1511  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  65.46 
 
 
249 aa  325  4.0000000000000003e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000178615  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2866  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  65.46 
 
 
249 aa  325  4.0000000000000003e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000232207  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2847  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  65.46 
 
 
249 aa  325  4.0000000000000003e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000762035  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3687  electron transfer flavoprotein, beta subunit  65.86 
 
 
250 aa  323  1e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.519348  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0614  electron transfer flavoprotein, alpha/beta-subunit-like protein  65.06 
 
 
249 aa  323  2e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.347072  normal  0.790745 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2539  electron transfer flavoprotein beta-subunit  65.06 
 
 
249 aa  322  3e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000795792  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1471  electron transfer flavoprotein beta-subunit  66.67 
 
 
249 aa  322  3e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00534232  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15180  Electron transfer flavoprotein beta-subunit  67.07 
 
 
249 aa  322  4e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3236  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  64.66 
 
 
249 aa  322  4e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.654108 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14280  Electron transfer flavoprotein beta-subunit  65.46 
 
 
256 aa  317  1e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.577888  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2146  electron transfer flavoprotein beta-subunit  64.26 
 
 
271 aa  315  4e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0676192  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0532  electron transport flavoprotein beta-subunit  64.26 
 
 
249 aa  313  9.999999999999999e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0527  electron transfer flavoprotein beta-subunit  64.26 
 
 
249 aa  313  1.9999999999999998e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0240946  hitchhiker  0.00903597 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1169  electron transfer flavoprotein, beta subunit  61.85 
 
 
249 aa  312  2.9999999999999996e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000191925  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1445  electron transfer flavoprotein beta-subunit  63.86 
 
 
249 aa  311  6.999999999999999e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0968162  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2363  electron transfer flavoprotein beta-subunit  64.26 
 
 
249 aa  311  6.999999999999999e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0654  electron transfer flavoprotein beta-subunit  67.07 
 
 
249 aa  310  2e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3015  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  63.05 
 
 
249 aa  306  1.0000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.437148 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0512  electron transfer flavoprotein beta-subunit  62.25 
 
 
249 aa  306  2.0000000000000002e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2268  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  63.05 
 
 
249 aa  304  7e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.074688  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1211  electron transfer flavoprotein subunit beta  63.05 
 
 
249 aa  303  1.0000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0857  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  64.66 
 
 
249 aa  304  1.0000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0421  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  62.65 
 
 
249 aa  303  1.0000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0148  electron transfer flavoprotein beta-subunit  62.25 
 
 
249 aa  303  1.0000000000000001e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.220254  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2810  electron transfer flavoprotein beta-subunit  63.05 
 
 
249 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.194225  normal  0.152197 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2299  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  63.05 
 
 
249 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3731  electron transfer flavoprotein beta-subunit  62.65 
 
 
249 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2168  electron transfer flavoprotein beta-subunit  63.45 
 
 
249 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0160278  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4307  electron transfer flavoprotein beta-subunit  63.45 
 
 
249 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3012  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  62.65 
 
 
249 aa  302  3.0000000000000004e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3143  electron transfer flavoprotein beta-subunit  63.86 
 
 
249 aa  302  4.0000000000000003e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0241376 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3374  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  63.05 
 
 
249 aa  301  9e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0752119  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2131  electron transfer flavoprotein beta-subunit  64.26 
 
 
249 aa  300  1e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0693479 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6870  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  61.85 
 
 
249 aa  300  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.562162  normal  0.410167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3196  electron transfer flavoprotein, alpha/beta-subunit-like protein  65.43 
 
 
249 aa  299  2e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.410827  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1194  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  63.05 
 
 
249 aa  299  3e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0762  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  62.65 
 
 
249 aa  299  4e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0953  electron transfer flavoprotein subunit beta  60.24 
 
 
249 aa  298  7e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2730  electron transfer flavoprotein subunit beta  61.85 
 
 
249 aa  298  8e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4188  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  63.45 
 
 
249 aa  298  8e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000750076 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2159  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  64.26 
 
 
249 aa  297  9e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.205102  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4829  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  63.05 
 
 
249 aa  297  9e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3598  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  62.65 
 
 
249 aa  297  1e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16410  electron transfer flavoprotein beta subunit  64.26 
 
 
249 aa  297  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.272786  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0864  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  61.45 
 
 
249 aa  297  1e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0174422  normal  0.553934 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0923  electron transfer flavoprotein subunit beta  61.45 
 
 
249 aa  296  2e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.421451  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0984  electron transfer flavoprotein subunit beta  59.84 
 
 
249 aa  296  2e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2133  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  60.64 
 
 
249 aa  296  2e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1223  electron transfer flavoprotein beta-subunit  63.86 
 
 
249 aa  296  2e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181506  normal  0.15593 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0411  electron transfer flavoprotein, beta subunit  61.85 
 
 
249 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2977  electron transfer flavoprotein, beta subunit  61.85 
 
 
249 aa  296  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2867  electron transfer flavoprotein, beta subunit  61.85 
 
 
249 aa  296  3e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.101956  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1653  electron transfer flavoprotein, beta subunit  61.85 
 
 
249 aa  296  3e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0931  electron transfer flavoprotein, beta subunit  61.85 
 
 
249 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0793  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  61.45 
 
 
249 aa  296  3e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.335872  normal  0.477243 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2555  electron transfer flavoprotein, beta subunit  61.85 
 
 
249 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2928  electron transfer flavoprotein, beta subunit  61.85 
 
 
249 aa  296  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0218  electron transfer flavoprotein, beta subunit  61.85 
 
 
249 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1576  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  63.86 
 
 
250 aa  295  4e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00497736 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0178  electron transfer flavoprotein beta-subunit  62.96 
 
 
249 aa  295  4e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2985  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  62.65 
 
 
249 aa  295  5e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.26291  hitchhiker  0.000621115 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2540  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  62.65 
 
 
249 aa  295  6e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0011084 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0998  electron transfer flavoprotein subunit beta  62.65 
 
 
249 aa  295  6e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0740496  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2550  electron transfer flavoprotein subunit beta  61.85 
 
 
249 aa  294  9e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2390  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  62.25 
 
 
249 aa  294  1e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.424195  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2639  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  61.04 
 
 
249 aa  293  1e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0930  electron transfer flavoprotein beta-subunit  61.45 
 
 
249 aa  293  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1701  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  62.4 
 
 
249 aa  294  1e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.712326  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1021  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  61.85 
 
 
249 aa  294  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1062  electron transfer flavoprotein beta-subunit  61.85 
 
 
249 aa  294  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1402  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  61.85 
 
 
249 aa  293  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.881408  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0737  electron transfer flavoprotein beta-subunit  61.04 
 
 
267 aa  293  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0122378  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2960  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  62.4 
 
 
249 aa  292  3e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7804  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  58.63 
 
 
446 aa  292  4e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55949  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1998  ATPase  61.85 
 
 
249 aa  292  4e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00163986  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>