43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05523 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05523  hypothetical protein  100 
 
 
214 aa  437  9.999999999999999e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3789  hypothetical protein  49.76 
 
 
245 aa  214  5.9999999999999996e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00728655  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4671  hypothetical protein  46.15 
 
 
211 aa  192  3e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.195271  normal  0.101554 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0422  protein of unknown function DUF799  42.71 
 
 
224 aa  168  7e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.754874  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0423  protein of unknown function DUF799  42.71 
 
 
224 aa  167  8e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0394  putative lipoprotein  42.19 
 
 
231 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2761  protein of unknown function DUF799  31.98 
 
 
224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.936694  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4281  hypothetical protein  37.57 
 
 
219 aa  109  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5409  hypothetical protein  35.39 
 
 
220 aa  108  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3429  hypothetical protein  31.47 
 
 
224 aa  107  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4602  protein of unknown function DUF799  35.91 
 
 
219 aa  104  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1455  hypothetical protein  32.07 
 
 
225 aa  102  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1388  hypothetical protein  38.26 
 
 
219 aa  102  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1339  putative lipoprotein  35.39 
 
 
218 aa  100  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1451  hypothetical protein  35.39 
 
 
218 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2721  putative lipoprotein  35.39 
 
 
218 aa  101  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5337  hypothetical protein  29.58 
 
 
219 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.232153  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3003  hypothetical protein  35.2 
 
 
224 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2389  hypothetical protein  35.2 
 
 
224 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3022  hypothetical protein  35.2 
 
 
224 aa  99.8  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1252  lipoprotein, putative  35.41 
 
 
220 aa  98.2  9e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4118  hypothetical protein  30.23 
 
 
230 aa  97.8  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01774  lipoprotein  31.31 
 
 
223 aa  96.3  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0155892  normal  0.405057 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1495  lipoprotein  36.73 
 
 
224 aa  95.9  4e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.196072  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2997  hypothetical protein  34.08 
 
 
224 aa  95.1  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657321  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0050  putative lipoprotein  33.01 
 
 
221 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.99075  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2912  hypothetical protein  35.86 
 
 
221 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21812  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3560  hypothetical protein  32.4 
 
 
221 aa  89.7  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0259131  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4223  protein of unknown function DUF799  31.36 
 
 
219 aa  87  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.644744  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4014  protein of unknown function DUF799  30.33 
 
 
219 aa  87.4  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.741538  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3204  putative lipoprotein  30.69 
 
 
224 aa  87  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0882  glycosyltransferase  32.08 
 
 
223 aa  85.1  8e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3465  putative lipoprotein  29.63 
 
 
224 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3968  putative lipoprotein  29.63 
 
 
224 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0107  putative lipoprotein  29.63 
 
 
228 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.123438  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2889  putative lipoprotein  29.63 
 
 
228 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3887  putative lipoprotein  29.63 
 
 
224 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.488572  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1653  putative lipoprotein  32.47 
 
 
224 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3084  putative lipoprotein  32.47 
 
 
224 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1129  lipoprotein  31.46 
 
 
225 aa  79.3  0.00000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0269959  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1766  hypothetical protein  28.65 
 
 
202 aa  74.3  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.12485  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00590  putative lipoprotein  31.17 
 
 
169 aa  62  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.592522  normal  0.156495 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1196  hypothetical protein  27.27 
 
 
449 aa  51.6  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00854603  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>