264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05516 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05516  aminopeptidase  100 
 
 
504 aa  1053    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0421  aminopeptidase  47.31 
 
 
501 aa  471  1.0000000000000001e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.131984  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  43.97 
 
 
677 aa  415  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2131  leucyl aminopeptidase  38.95 
 
 
523 aa  363  4e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.227059  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5001  leucyl aminopeptidase  45.94 
 
 
417 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.341623  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4476  leucyl aminopeptidase  45.94 
 
 
417 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0596  aminopeptidase Ap1  46.57 
 
 
417 aa  298  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5218  leucyl aminopeptidase  46.7 
 
 
417 aa  297  3e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3301  leucyl aminopeptidase  46.13 
 
 
417 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177748  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5067  leucyl aminopeptidase  46.13 
 
 
417 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0487  putative leucine aminopeptidase  45.1 
 
 
408 aa  294  3e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2124  aminopeptidase  45.1 
 
 
408 aa  294  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1852  leucine aminopeptidase, putative  45.27 
 
 
408 aa  294  3e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0188761  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0757  peptidase family protein  45.1 
 
 
408 aa  294  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31218  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1962  putative leucine aminopeptidase  45.1 
 
 
384 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0694  putative leucine aminopeptidase  45.1 
 
 
384 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.832714  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0990  putative leucine aminopeptidase  45.1 
 
 
384 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0845  peptidase family protein  45.1 
 
 
384 aa  293  6e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.292004  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07020  leucyl aminopeptidase  39.23 
 
 
483 aa  236  9e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.384558  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2729  hypothetical protein  39.37 
 
 
401 aa  193  6e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2866  hypothetical protein  35.95 
 
 
401 aa  191  2e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0031  hypothetical protein  35.74 
 
 
397 aa  181  2e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0032  hypothetical protein  31.03 
 
 
397 aa  176  8e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI04080  peptidase, putative  34.56 
 
 
402 aa  156  7e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.321428  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28372  leucyl aminopeptidase precursor  35.64 
 
 
407 aa  155  2e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.36652 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07035  aminopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04210)  34.71 
 
 
390 aa  149  8e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1163  hypothetical protein  31.71 
 
 
398 aa  139  8.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1158  hypothetical protein  31.49 
 
 
398 aa  138  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2373  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.4 
 
 
628 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.200632  normal  0.503534 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3194  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.39 
 
 
629 aa  80.1  0.00000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0427  peptidase domain-containing protein  36.27 
 
 
553 aa  80.1  0.00000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3338  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.39 
 
 
629 aa  80.1  0.00000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1173  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.39 
 
 
629 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3200  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.39 
 
 
629 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0371  hemagglutinin/protease  29.14 
 
 
609 aa  78.2  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3015  peptidase M4, thermolysin  37 
 
 
777 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0428  peptidase M4, thermolysin  36.63 
 
 
775 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4736  peptidase M28  32.54 
 
 
497 aa  73.9  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.517188  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001489  alkaline serine exoprotease A precursor  33.33 
 
 
534 aa  72.4  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.24 
 
 
807 aa  72  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000415164  unclonable  0.00000378434 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2289  peptidase M28  27.5 
 
 
338 aa  71.6  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3106  cold-active serine alkaline protease  33.86 
 
 
807 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1409  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.17 
 
 
803 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000345823  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2578  peptidase M28  33.57 
 
 
563 aa  70.9  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0256321  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1390  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36 
 
 
805 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000278441  hitchhiker  0.0000000134181 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1455  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36 
 
 
805 aa  70.5  0.00000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00029067  hitchhiker  0.000623133 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36 
 
 
809 aa  70.5  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000125277  hitchhiker  0.0000000821824 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1016  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.37 
 
 
630 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  27.73 
 
 
598 aa  68.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1190  peptidase M28  27.95 
 
 
629 aa  68.9  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.909659  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1611  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36 
 
 
802 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0326681 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4623  peptidase domain-containing protein  35.58 
 
 
658 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.272632  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0556  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.63 
 
 
494 aa  68.6  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0947915  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3182  peptidase M28  30.29 
 
 
472 aa  68.6  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.569108  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2692  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.13 
 
 
818 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1875  peptidase M28  25.26 
 
 
509 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.967408  normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12058  peptidase, M28D family protein  35.71 
 
 
472 aa  68.2  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02449  hypothetical protein  34.34 
 
 
489 aa  67.4  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1208  peptidase M28  29.03 
 
 
525 aa  67.4  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382894  decreased coverage  0.00811068 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1362  peptidase M28  30 
 
 
495 aa  67  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.162739  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2185  cold-active serine alkaline protease  36 
 
 
803 aa  66.6  0.0000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000390899  decreased coverage  0.00433013 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04872  cold-active alkaline serine protease  35.64 
 
 
794 aa  66.6  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  29.03 
 
 
1103 aa  66.2  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1065  peptidase M28  29.02 
 
 
455 aa  66.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.377443  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2654  peptidase M28  29.95 
 
 
525 aa  65.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.423469 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0456  peptidase M4 thermolysin  33.33 
 
 
778 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2477  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.81 
 
 
823 aa  65.9  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000447493  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3874  peptidase M4 thermolysin  32.35 
 
 
778 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6038  peptidase M28  46.67 
 
 
454 aa  64.7  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5481  putative aminopeptidase  30.37 
 
 
466 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5470  putative aminopeptidase  30.37 
 
 
466 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.155221 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03458  cold-active serine alkaline protease  43.06 
 
 
533 aa  65.1  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0416206  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1578  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.19 
 
 
819 aa  65.1  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000462777  hitchhiker  0.00000000445269 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0439  peptidase M4 thermolysin  32.35 
 
 
778 aa  64.3  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2874  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34 
 
 
819 aa  64.7  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000394785  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2799  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34 
 
 
819 aa  64.7  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000118341  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2779  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34 
 
 
819 aa  64.7  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000279348  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0465  peptidase M4 thermolysin  32.35 
 
 
778 aa  64.3  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0075  peptidase M28  28.29 
 
 
947 aa  64.3  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11414  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1190  peptidase M28  25.6 
 
 
458 aa  63.9  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5488  aminopeptidase, putative  30.77 
 
 
466 aa  63.5  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  29.07 
 
 
533 aa  63.2  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0422  hypothetical protein  35.64 
 
 
476 aa  62  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0260128  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3859  peptidase M28  27.07 
 
 
478 aa  62  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3021  endonuclease I  33.66 
 
 
553 aa  62.4  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00455766  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  27.37 
 
 
465 aa  62.4  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3041  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.16 
 
 
807 aa  62.8  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.022997  normal  0.0310863 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5040  aminopeptidase  30.26 
 
 
466 aa  61.6  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5056  aminopeptidase  30.26 
 
 
466 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.418047  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5537  putative aminopeptidase  30.26 
 
 
466 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5450  putative aminopeptidase  30.26 
 
 
466 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35493  predicted protein  26.18 
 
 
450 aa  61.2  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0224729  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0712  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32 
 
 
579 aa  60.8  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.482553 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1367  aminopeptidase Y  30.68 
 
 
519 aa  60.8  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.227193  hitchhiker  0.000286251 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  29.26 
 
 
559 aa  60.5  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4257  endonuclease I  34.78 
 
 
558 aa  60.5  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0454  peptidase M28  27.13 
 
 
325 aa  60.5  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5208  aminopeptidase  29.74 
 
 
466 aa  60.5  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274505  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5606  aminopeptidase  29.74 
 
 
466 aa  60.5  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0557  peptidase M4 thermolysin  28.79 
 
 
774 aa  60.5  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25076  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>