More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05408 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05408  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  325  1.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001469  non-specific DNA-binding protein Dps/iron-binding ferritin-like antioxidant protein/ferroxidase  98.11 
 
 
159 aa  320  7e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2688  Ferritin Dps family protein  68 
 
 
163 aa  213  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119326  hitchhiker  0.00386206 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2953  Ferritin and Dps  63.4 
 
 
157 aa  209  2e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2381  DPS family protein  68.18 
 
 
156 aa  209  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2829  Ferritin Dps family protein  62.82 
 
 
161 aa  206  9e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.901584  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0131  DNA-binding stress protein  61.59 
 
 
159 aa  203  9e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3485  Ferritin, Dps family protein  58.55 
 
 
157 aa  202  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1214  Ferritin Dps family protein  61.54 
 
 
161 aa  199  9.999999999999999e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2021  DNA-binding protein; DPS family protein  56 
 
 
158 aa  194  5.000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0379  Ferritin Dps family protein  53.8 
 
 
158 aa  181  5.0000000000000004e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.46661 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1541  Ferritin, Dps family protein  54 
 
 
156 aa  179  9.000000000000001e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103118  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1620  putative DNA-binding protein, Dps  48.72 
 
 
161 aa  171  3.9999999999999995e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00952275  normal  0.23564 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1852  Ferritin and Dps  49.36 
 
 
161 aa  170  7.999999999999999e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.206437  normal  0.245818 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4766  Ferritin, Dps family protein  48.05 
 
 
159 aa  154  4e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0327  Ferritin Dps family protein  46.36 
 
 
159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0090  Dps family protein  44.87 
 
 
159 aa  144  7.0000000000000006e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0858157 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0327  Ferritin Dps family protein  42.58 
 
 
159 aa  126  9.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.743454  hitchhiker  0.00750622 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13178  DPS family protein  40.13 
 
 
163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2914  Ferritin Dps family protein  40 
 
 
159 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.319607  hitchhiker  0.00000000175799 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00577  putative DNA-binding stress protein  40.67 
 
 
157 aa  116  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3841  Ferritin and Dps  39.19 
 
 
156 aa  115  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000127863  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1840  Ferritin, Dps family protein  39.19 
 
 
156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5191  general stress protein 20U  39.01 
 
 
146 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.137355  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4875  Ferritin Dps family protein  39.16 
 
 
146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000326402  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5196  DNA protection during starvation protein 2  39.01 
 
 
146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00364208  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0052  DNA protection during starvation protein 2  39.01 
 
 
146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000618139  hitchhiker  0.000000000000272675 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4914  general stress protein 20U  39.01 
 
 
146 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.770524  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4759  Dps family protein  39.01 
 
 
146 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00508779  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5205  DNA protection during starvation protein 2  39.01 
 
 
146 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000105724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5290  general stress protein 20U  39.01 
 
 
146 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1520  Ferritin Dps family protein  41.13 
 
 
147 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.907687  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5159  DNA protection during starvation protein 2  39.01 
 
 
146 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.06041e-34 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2092  general stress protein  40.56 
 
 
147 aa  107  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.233989  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1841  non-specific DNA-binding protein Dps  40.56 
 
 
147 aa  107  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.150285  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1825  non-specific DNA-binding protein, Dps-like  40.56 
 
 
147 aa  107  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2126  DNA protection during starvation protein 1  40.56 
 
 
147 aa  107  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.334442  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2015  DNA protection during starvation protein 1  41.13 
 
 
147 aa  107  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3294  DNA protection during starvation protein 1  41.13 
 
 
147 aa  107  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.623838 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1875  Ferritin Dps family protein  41.26 
 
 
147 aa  107  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0581832  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2047  DNA protection during starvation protein 1  40.56 
 
 
147 aa  107  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00820011 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4778  Dps family protein  38.3 
 
 
146 aa  106  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000253155  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3983  Dps family protein  34.87 
 
 
157 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.257808  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1871  general stress protein  40.43 
 
 
147 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1404  Ferritin and Dps  34.87 
 
 
157 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2013  general stress protein  40.43 
 
 
147 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2658  Ferritin Dps family protein  34.67 
 
 
164 aa  105  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329969  normal  0.0258141 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0644  Ferritin Dps family protein  35.33 
 
 
162 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0618  Ferritin, Dps family protein  35.33 
 
 
162 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0759  Ferritin and Dps  35.1 
 
 
163 aa  105  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2045  Ferritin, Dps family protein  36.49 
 
 
156 aa  105  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0289299  normal  0.419788 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0696  Ferritin Dps family protein  35.33 
 
 
162 aa  104  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134287  normal  0.270439 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0244  Ferritin and Dps  35.33 
 
 
162 aa  104  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944059  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0728  Ferritin, Dps family protein  35.33 
 
 
162 aa  104  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.717842  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2302  Ferritin Dps family protein  34.67 
 
 
155 aa  104  5e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112088  normal  0.237053 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4414  Ferritin and Dps  34.87 
 
 
156 aa  104  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0174703  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1226  Ferritin and Dps  37.09 
 
 
156 aa  104  6e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000988048  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4208  Ferritin Dps family protein  34.21 
 
 
157 aa  103  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.857368  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4005  Ferritin Dps family protein  34.21 
 
 
157 aa  103  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1239  Ferritin, Dps family protein  34.21 
 
 
157 aa  103  8e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.698815  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3364  DpsA  35.33 
 
 
162 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.197988  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2788  Ferritin Dps family protein  38.46 
 
 
146 aa  103  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0475826  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2394  ferritin-like domain-containing protein  34.67 
 
 
162 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3808  Ferritin Dps family protein  36.81 
 
 
145 aa  102  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000002907  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2580  ferritin-like domain-containing protein  34.67 
 
 
162 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3319  putative DNA-binding protein  34.67 
 
 
162 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3353  ferritin-like domain-containing protein  34.67 
 
 
162 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.27996  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0310  ferritin-like domain-containing protein  34.67 
 
 
162 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1171  ferritin-like domain-containing protein  34.67 
 
 
162 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0585  Ferritin Dps family protein  35.66 
 
 
146 aa  101  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1210  DNA-binding stress protein, putative  34 
 
 
157 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1284  DpsA  34 
 
 
162 aa  101  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0981  Ferritin, Dps family protein  35.33 
 
 
155 aa  101  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0902637 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1046  Ferritin, Dps family protein  35.33 
 
 
155 aa  101  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.609194  hitchhiker  0.00550798 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0985  Ferritin, Dps family protein  35.33 
 
 
155 aa  101  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.890442  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2946  Ferritin Dps family protein  36.18 
 
 
156 aa  101  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3327  Ferritin Dps family protein  35.33 
 
 
155 aa  101  5e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.818415  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4066  Ferritin Dps family protein  33.33 
 
 
158 aa  101  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4105  Ferritin Dps family protein  33.33 
 
 
158 aa  100  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0333  Ferritin and Dps  34.46 
 
 
158 aa  100  6e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1265  Ferritin, Dps family protein  35.33 
 
 
156 aa  100  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.758544  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2879  Ferritin, Dps family protein  35.33 
 
 
155 aa  100  6e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.68737  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3463  Ferritin Dps family protein  35.33 
 
 
155 aa  99.8  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1985  ferritin DPS family DNA-binding protein  36.24 
 
 
168 aa  99.8  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.596457  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0102  Ferritin Dps family protein  32.89 
 
 
156 aa  99.4  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.923698  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1158  Dps family protein  35.33 
 
 
155 aa  99.8  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3285  Ferritin Dps family protein  35.33 
 
 
155 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1082  Ferritin Dps family protein  35.33 
 
 
155 aa  99.8  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.500393  hitchhiker  0.000284805 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0714  Ferritin Dps family protein  33.77 
 
 
165 aa  99  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.8561 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1120  Ferritin and Dps  31.13 
 
 
156 aa  98.6  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.143063  normal  0.27853 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3984  ferritin DPS family DNA-binding protein  33.77 
 
 
165 aa  98.6  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2520  Ferritin Dps family protein  33.33 
 
 
162 aa  97.8  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0352668  normal  0.816406 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0665  ferritin and Dps  35.14 
 
 
155 aa  97.4  6e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00368678 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2804  Ferritin and Dps  32 
 
 
161 aa  97.1  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0829  Ferritin Dps family protein  37.68 
 
 
145 aa  97.1  9e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3626  Ferritin Dps family protein  34.97 
 
 
146 aa  96.7  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0595  Ferritin, Dps family protein  32.03 
 
 
174 aa  96.7  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0325  Ferritin, Dps family protein  34.87 
 
 
174 aa  95.9  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0225857 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2687  putative DNA protection during starvation or oxydative stress transcription regulator protein  33.33 
 
 
166 aa  95.1  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0650  Ferritin Dps family protein  33.77 
 
 
180 aa  95.1  3e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>