More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05403 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05403  ABC transporter ATPase subunit  100 
 
 		 237 aa  489  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001466  ABC transporter ATP-binding protein  89.45 
 
 		 238 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2658  ABC transporter-related protein  79.02 
 
 		 227 aa  369  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3195  putative ABC transporter, ATP-binding protein  77.23 
 
 		 227 aa  367  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1431  ABC transporter related  75.89 
 
 		 227 aa  358  3e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.815325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2536  ABC transporter related protein  54.95 
 
 		 230 aa  256  2e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  51.35 
 
 		 234 aa  236  3e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2375  ABC-type transport system, ATPase component  51.35 
 
 		 229 aa  229  2e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000797432  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0433  ABC transporter related  55.41 
 
 		 233 aa  229  4e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5040  ABC transporter, ATP-binding protein  52.63 
 
 		 246 aa  228  5e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2507  ABC transporter related  49.55 
 
 		 231 aa  227  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5302  ABC transporter related  51.57 
 
 		 234 aa  225  4e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.155471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1662  ABC transporter related  51.12 
 
 		 234 aa  223  3e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.822676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0855  ABC transporter related  49.33 
 
 		 228 aa  222  4e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00113999  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  49.77 
 
 		 231 aa  218  7e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0495  ABC transporter related  47.51 
 
 		 237 aa  216  2e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  49.32 
 
 		 230 aa  216  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  49.77 
 
 		 237 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4081  ABC transporter related  49.09 
 
 		 237 aa  215  4e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4048  ABC transporter-related protein  49.09 
 
 		 237 aa  215  4e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2653  ABC transporter, ATP-binding protein  48.53 
 
 		 214 aa  214  7e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.670995  normal  0.0652814 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3939  ABC transporter, ATPase subunit  48.64 
 
 		 236 aa  214  8e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.920707  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2531  ABC transporter related  47.96 
 
 		 228 aa  213  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.799962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1802  ABC transporter related  47.93 
 
 		 234 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  47.75 
 
 		 266 aa  213  1.9999999999999998e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  46.36 
 
 		 242 aa  213  1.9999999999999998e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  45.95 
 
 		 239 aa  212  3.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  46.58 
 
 		 231 aa  211  7.999999999999999e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  46.4 
 
 		 242 aa  210  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  46.85 
 
 		 221 aa  210  1e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2019  ABC transporter related protein  44.39 
 
 		 228 aa  210  2e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0275435  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  48.21 
 
 		 228 aa  210  2e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  47 
 
 		 239 aa  209  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0194  hypothetical protein  47.98 
 
 		 226 aa  209  2e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000219285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  45.13 
 
 		 246 aa  209  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  47.75 
 
 		 241 aa  209  4e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0205  ABC transporter related  44.89 
 
 		 233 aa  209  4e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  45.74 
 
 		 224 aa  207  9e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0064  ABC transporter-related protein  47.3 
 
 		 222 aa  207  9e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.283331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  45.74 
 
 		 224 aa  207  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  45.74 
 
 		 224 aa  207  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2904  ABC transporter-like protein  48.64 
 
 		 224 aa  207  1e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.108903 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  45.74 
 
 		 224 aa  207  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  45.29 
 
 		 224 aa  206  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  45.29 
 
 		 224 aa  206  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  45.29 
 
 		 224 aa  206  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0354  ABC transporter related  43.35 
 
 		 249 aa  206  2e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.774428  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3264  ABC transporter related protein  47.27 
 
 		 229 aa  206  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29510  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  45.5 
 
 		 250 aa  207  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3149  ABC transporter related  45.45 
 
 		 563 aa  206  3e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  46.22 
 
 		 252 aa  206  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2147  ABC transporter related  47.34 
 
 		 252 aa  206  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.852094 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  45.13 
 
 		 253 aa  206  3e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0035  ABC transporter related  46.85 
 
 		 225 aa  206  3e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000173721  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0756  ABC transporter related  49.1 
 
 		 226 aa  206  3e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.688421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0791  ABC transporter, ATP-binding protein  44.84 
 
 		 220 aa  205  4e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.271834 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2216  ABC transporter-related protein  45.21 
 
 		 233 aa  206  4e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1628  ABC transporter related protein  45.87 
 
 		 250 aa  205  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  45.95 
 
 		 239 aa  205  5e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2540  ABC transporter related  44.84 
 
 		 241 aa  205  5e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.656818  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  45.5 
 
 		 225 aa  205  6e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6690  ABC transporter, ATPase subunit  43.22 
 
 		 234 aa  205  6e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.810231  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  45.74 
 
 		 224 aa  205  6e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  45.74 
 
 		 224 aa  205  6e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  44.86 
 
 		 260 aa  204  8e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  43.86 
 
 		 228 aa  204  9e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  44.64 
 
 		 242 aa  204  9e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3212  cyclic nucleotide-binding protein  45.09 
 
 		 388 aa  204  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  45.5 
 
 		 232 aa  204  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3285  ABC transporter related  48.18 
 
 		 249 aa  204  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  44.39 
 
 		 224 aa  204  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1457  ABC transporter related  46.12 
 
 		 228 aa  203  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2318  ABC transporter related  45 
 
 		 565 aa  203  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  45.66 
 
 		 248 aa  202  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  45.66 
 
 		 248 aa  202  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0321  ABC transporter related  46.9 
 
 		 227 aa  203  2e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0987  ABC transporter related  46.36 
 
 		 229 aa  202  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.891984 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  44.93 
 
 		 229 aa  202  3e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2521  ABC transporter related  46.12 
 
 		 235 aa  202  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1291  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein LolD  45.29 
 
 		 235 aa  202  3e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.286185 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  45.5 
 
 		 232 aa  202  5e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  44.84 
 
 		 228 aa  201  6e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4127  ABC transporter related  44.29 
 
 		 241 aa  201  6e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.330151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  44.2 
 
 		 229 aa  201  6e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0759  ABC transporter ATP-binding protein  43.95 
 
 		 224 aa  201  7e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2437  ABC transporter related  44.75 
 
 		 231 aa  201  7e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1984  ABC transporter related  45.45 
 
 		 231 aa  201  7e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  43.3 
 
 		 225 aa  201  8e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  46.36 
 
 		 220 aa  201  8e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  43.3 
 
 		 225 aa  201  8e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4072  ABC transporter related  43.16 
 
 		 253 aa  201  9e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0863  ABC transporter related  42.92 
 
 		 246 aa  201  9e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3159  ABC transporter related  42.92 
 
 		 246 aa  201  9e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3260  ABC transporter related  42.92 
 
 		 246 aa  201  9e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3722  ABC transporter related  44.2 
 
 		 263 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.323053 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2391  ABC transporter related  47.73 
 
 		 253 aa  200  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  46.36 
 
 		 227 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1414  ATPase  44.44 
 
 		 241 aa  201  9.999999999999999e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2710  cyclic nucleotide-binding protein  44.64 
 
 		 388 aa  200  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  46.85 
 
 		 235 aa  201  9.999999999999999e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>