More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05239 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05239  hemin importer ATP-binding subunit  100 
 
 
260 aa  536  1e-151  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001350  ABC-type hemin transport system ATPase component  84.23 
 
 
260 aa  468  1.0000000000000001e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000143522  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0322  hemin importer ATP-binding subunit  64.48 
 
 
259 aa  359  2e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00006173  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1756  hemin importer ATP-binding subunit  57.48 
 
 
260 aa  290  2e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00991527  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3333  hemin importer ATP-binding subunit  51.63 
 
 
268 aa  251  1e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3675  hemin importer ATP-binding subunit  50.8 
 
 
272 aa  246  3e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3241  hemin importer ATP-binding subunit  48 
 
 
272 aa  232  5e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0946  hemin importer ATP-binding subunit  48.19 
 
 
288 aa  231  9e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3344  hemin importer ATP-binding subunit  47.64 
 
 
290 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.559601  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1048  hemin importer ATP-binding subunit  48.19 
 
 
288 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.540282 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0784  hemin importer ATP-binding subunit  47.92 
 
 
254 aa  228  6e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1015  hemin importer ATP-binding subunit  47.79 
 
 
288 aa  228  9e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0960  hemin importer ATP-binding subunit  49.38 
 
 
274 aa  225  6e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4010  hemin importer ATP-binding subunit  48.99 
 
 
254 aa  223  3e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.240186 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4798  hemin importer ATP-binding subunit  44.27 
 
 
255 aa  206  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000262531  hitchhiker  0.00143182 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4551  hemin importer ATP-binding subunit  43.15 
 
 
255 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000433574  decreased coverage  0.0000000113958 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2165  hemin importer ATP-binding subunit  45.35 
 
 
261 aa  202  3e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.203707  normal  0.489491 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4685  hemin importer ATP-binding subunit  42.34 
 
 
255 aa  201  9e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000508332  hitchhiker  0.00000000000000885497 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0646  hemin importer ATP-binding subunit  45.45 
 
 
266 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.370261 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3805  hemin importer ATP-binding subunit  45.45 
 
 
266 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42590  hemin importer ATP-binding subunit  41.53 
 
 
255 aa  201  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00288273  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3893  hemin importer ATP-binding subunit  45.45 
 
 
266 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4687  hemin importer ATP-binding subunit  43.8 
 
 
255 aa  198  6e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.687839  hitchhiker  0.000215024 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5422  hemin importer ATP-binding subunit  43.15 
 
 
255 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0457387  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62280  hemin importer ATP-binding subunit  43.15 
 
 
255 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000951345  normal  0.390973 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1607  ABC transporter related  39.23 
 
 
269 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000477386 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0747  hemin importer ATP-binding subunit  41.53 
 
 
255 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000209221  decreased coverage  0.000000000000929505 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2462  hemin importer ATP-binding subunit  41.96 
 
 
265 aa  191  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.902212  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2764  hemin importer ATP-binding subunit  41.18 
 
 
265 aa  187  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2166  ABC transporter related protein  42.4 
 
 
253 aa  185  5e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13025  normal  0.348663 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2384  hemin importer ATP-binding subunit  42.64 
 
 
284 aa  185  5e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.258955  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  43.65 
 
 
272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0995  hemin importer ATP-binding subunit  41.94 
 
 
255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000453335  hitchhiker  0.0000000000000146988 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4866  hemin importer ATP-binding subunit  40.56 
 
 
256 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3809  hemin importer ATP-binding subunit  40.56 
 
 
266 aa  183  3e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0346315 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2736  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (hemin)  39.6 
 
 
262 aa  180  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1737  hemin importer ATP-binding subunit  41.83 
 
 
259 aa  177  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1933  ABC transporter related  38.46 
 
 
272 aa  176  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  41.11 
 
 
270 aa  175  5e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5378  hemin importer ATP-binding subunit  40.8 
 
 
261 aa  175  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124371  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0373  ABC transporter related protein  38.17 
 
 
293 aa  175  6e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1212  hemin importer ATP-binding subunit  41.77 
 
 
263 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0126  hemin importer ATP-binding subunit  42.97 
 
 
277 aa  174  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.27999  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4205  hemin importer ATP-binding subunit  39.09 
 
 
257 aa  172  5.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322573  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2322  hemin importer ATP-binding subunit  38.91 
 
 
269 aa  170  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0161777  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2341  hemin importer ATP-binding subunit  36.25 
 
 
262 aa  169  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0724766  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3202  ABC transporter related  35.89 
 
 
405 aa  169  6e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2832  hemin importer ATP-binding subunit  40.16 
 
 
264 aa  168  8e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  34.78 
 
 
269 aa  168  8e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0343  hemin importer ATP-binding subunit  38.96 
 
 
260 aa  167  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3308  ABC transporter related  41.09 
 
 
271 aa  167  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.069398  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3618  hemin importer ATP-binding subunit  37.14 
 
 
267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.740254  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3476  ABC transporter related  36.05 
 
 
260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3576  ABC transporter related  39.33 
 
 
264 aa  165  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0297567 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5816  ABC transporter related  35.14 
 
 
259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0864104 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4373  ABC transporter related  42.32 
 
 
271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4590  ABC transporter related  39.29 
 
 
274 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.983683  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7222  ABC transporter related  37.78 
 
 
282 aa  163  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1967  hemin importer ATP-binding subunit  39.23 
 
 
269 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3537  ABC transporter related  37.05 
 
 
264 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.878481 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0168  hemin importer ATP-binding subunit  36.55 
 
 
262 aa  161  9e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0086  ABC transporter related  36.4 
 
 
255 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3564  ABC transporter related  39.53 
 
 
274 aa  160  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1943  ABC transporter related  36.57 
 
 
253 aa  160  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82055  normal  0.0334831 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6719  ABC transporter related  34.82 
 
 
259 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000596509  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2348  hemin importer ATP-binding subunit  35.34 
 
 
261 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00837343  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3581  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ferrichrome)  39.02 
 
 
271 aa  159  4e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01766  hypothetical protein  37.24 
 
 
267 aa  158  7e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0851  ABC transporter related  37.26 
 
 
265 aa  158  8e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.317375  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09850  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  39.84 
 
 
308 aa  157  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0480584  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1437  ABC Fe+3 hydroxamate (ferrichrome) transporter, ATPase subunit  35.98 
 
 
255 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2143  hemin importer ATP-binding subunit  39.51 
 
 
272 aa  157  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  37.77 
 
 
268 aa  157  2e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3334  hemin importer ATP-binding subunit  39.36 
 
 
280 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319448  hitchhiker  0.00127806 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0571  hemin importer ATP-binding subunit  36.8 
 
 
260 aa  157  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.479313  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3272  hemin importer ATP-binding subunit  33.98 
 
 
264 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00219245 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1152  multi anti extrusion protein MatE  38.27 
 
 
255 aa  157  2e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2761  ABC transporter related protein  39.77 
 
 
292 aa  156  3e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.503989  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0180  ABC transporter related  39.51 
 
 
258 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2136  hemin importer ATP-binding subunit  37.45 
 
 
270 aa  155  5.0000000000000005e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.740786  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8245  ABC transporter related  37.35 
 
 
271 aa  155  7e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475817  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3021  hemin importer ATP-binding subunit  33.98 
 
 
264 aa  155  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.65849  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0455  hemin importer ATP-binding subunit  35 
 
 
264 aa  155  9e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.341265  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1564  ABC transporter related protein  38.89 
 
 
259 aa  154  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575357  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3466  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  37.71 
 
 
269 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39496  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  35.02 
 
 
409 aa  154  1e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0965  ABC transporter related  37.69 
 
 
293 aa  153  2e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1444  hemin importer ATP-binding subunit  38.17 
 
 
263 aa  154  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326637  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0622  ABC transporter related  37.8 
 
 
275 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.258343  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  33.88 
 
 
490 aa  151  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3549  ABC transporter-related protein  37.29 
 
 
271 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0341647  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2409  hemin importer ATP-binding subunit  39.11 
 
 
268 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.128742  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0258  ABC transporter related  33.59 
 
 
424 aa  150  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3617  ABC transporter related  37.29 
 
 
270 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4776  hemin importer ATP-binding subunit  39.67 
 
 
273 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.633447  normal  0.666848 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003570  ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC  35.2 
 
 
254 aa  150  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1142  ABC transporter related  37.55 
 
 
255 aa  149  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1993  ABC transporter related  36.36 
 
 
269 aa  150  3e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_590  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, ATPase component  37.01 
 
 
275 aa  149  4e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.139681  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2875  hemin importer ATP-binding subunit  41.2 
 
 
272 aa  149  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.971494  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>