More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05093 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_0086  prolyl endopeptidase  63.82 
 
 
723 aa  915    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05093  protease  100 
 
 
679 aa  1401    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0462  prolyl oligopeptidase  48.02 
 
 
689 aa  646    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.14887 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0810  peptidase S9A prolyl oligopeptidase domain protein beta-propeller  60.44 
 
 
708 aa  880    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0746  Prolyl oligopeptidase  48.83 
 
 
688 aa  650    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001383  prolyl endopeptidase  65 
 
 
719 aa  940    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1313  prolyl oligopeptidase  60.59 
 
 
700 aa  865    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2782  prolyl oligopeptidase  62.83 
 
 
724 aa  910    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.119974  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3157  prolyl oligopeptidase  46.97 
 
 
703 aa  639    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.385606  hitchhiker  0.000562539 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4608  Prolyl oligopeptidase  48.9 
 
 
703 aa  650    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.638407  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06386  peptidase  63.97 
 
 
730 aa  925    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2323  Prolyl oligopeptidase  51.99 
 
 
685 aa  697    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001226  serine protease of the peptidase family S9A  87.74 
 
 
677 aa  1250    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5257  Prolyl oligopeptidase  49.85 
 
 
701 aa  676    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2458  Prolyl oligopeptidase  57.08 
 
 
713 aa  801    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.768929  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02385  Prolyl endopeptidase  60.76 
 
 
719 aa  873    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4948  prolyl oligopeptidase  47.14 
 
 
689 aa  633  1e-180  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4245  Prolyl oligopeptidase  47.87 
 
 
688 aa  630  1e-179  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4307  Prolyl oligopeptidase  47.87 
 
 
688 aa  630  1e-179  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.17426  normal  0.0613524 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3925  Prolyl oligopeptidase  47.39 
 
 
695 aa  622  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.999576  normal  0.0353969 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2569  prolyl oligopeptidase  46.15 
 
 
718 aa  593  1e-168  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000045371  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2753  prolyl endopeptidase  44.85 
 
 
727 aa  587  1e-166  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2736  prolyl oligopeptidase  45.62 
 
 
714 aa  588  1e-166  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.304191  hitchhiker  0.00018874 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2445  prolyl oligopeptidase  44.71 
 
 
727 aa  585  1e-166  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000119752  normal  0.316847 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1522  prolyl oligopeptidase  44.63 
 
 
696 aa  587  1e-166  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.2073  normal  0.773785 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2373  prolyl oligopeptidase  44.56 
 
 
727 aa  585  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000160004  normal  0.331023 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2536  prolyl oligopeptidase  44.56 
 
 
726 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000370848  normal  0.321881 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1195  prolyl endopeptidase  44.95 
 
 
685 aa  581  1e-164  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00494828  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1602  prolyl oligopeptidase  44.54 
 
 
729 aa  578  1.0000000000000001e-163  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000159045  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2543  Prolyl oligopeptidase  43.68 
 
 
727 aa  570  1e-161  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000249468  hitchhiker  0.000000327157 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1737  prolyl oligopeptidase  43.55 
 
 
727 aa  569  1e-161  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000036721  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1852  prolyl oligopeptidase  44.81 
 
 
718 aa  570  1e-161  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0419328  normal  0.988399 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1741  prolyl oligopeptidase  43.68 
 
 
727 aa  569  1e-161  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000789532  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1780  prolyl oligopeptidase  43.55 
 
 
727 aa  568  1e-160  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000219198  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2091  prolyl oligopeptidase  42.52 
 
 
718 aa  558  1e-157  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000105582  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0382  Prolyl oligopeptidase  43.77 
 
 
685 aa  555  1e-156  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.450015  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1978  prolyl oligopeptidase  42.79 
 
 
719 aa  552  1e-156  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.370537 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01001  Prolyl endopeptidase  43.01 
 
 
719 aa  547  1e-154  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1324  prolyl oligopeptidase  43.92 
 
 
710 aa  542  1e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.198944 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6402  Prolyl oligopeptidase  42.22 
 
 
745 aa  537  1e-151  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2893  Prolyl oligopeptidase  42.73 
 
 
682 aa  534  1e-150  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.114884 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2525  prolyl oligopeptidase  42.19 
 
 
711 aa  522  1e-147  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440403  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2524  prolyl oligopeptidase  38.25 
 
 
714 aa  476  1e-133  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.260792  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0129  Prolyl oligopeptidase  36.75 
 
 
726 aa  469  1.0000000000000001e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1967  Prolyl oligopeptidase  37.29 
 
 
670 aa  471  1.0000000000000001e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00433613  normal  0.203518 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0615  prolyl oligopeptidase  37.32 
 
 
719 aa  446  1.0000000000000001e-124  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4142  prolyl oligopeptidase  35.61 
 
 
707 aa  439  9.999999999999999e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.199893 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1339  Prolyl oligopeptidase  34.48 
 
 
703 aa  422  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.234666  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7338  Prolyl oligopeptidase  34.53 
 
 
690 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2543  prolyl oligopeptidase  35.35 
 
 
690 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.768819  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  34.91 
 
 
1283 aa  411  1e-113  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2940  Prolyl oligopeptidase  34.22 
 
 
713 aa  404  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000682776  hitchhiker  0.000230055 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6440  Prolyl oligopeptidase  32.37 
 
 
666 aa  389  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.575381  normal  0.082879 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3423  Prolyl oligopeptidase  32.95 
 
 
697 aa  389  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2212  prolyl oligopeptidase  33.38 
 
 
702 aa  382  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7340  Prolyl oligopeptidase  33.62 
 
 
709 aa  383  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021168 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1604  prolyl oligopeptidase  33.29 
 
 
723 aa  380  1e-104  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.115584  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3951  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  36.33 
 
 
740 aa  377  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.26671  normal  0.109471 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1536  Prolyl oligopeptidase  31.36 
 
 
692 aa  378  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469574  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1137  Prolyl oligopeptidase  32.04 
 
 
705 aa  359  7e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1364  Prolyl oligopeptidase  32.77 
 
 
742 aa  357  5e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.199496  hitchhiker  0.000136214 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3530  Prolyl oligopeptidase  32.19 
 
 
717 aa  349  1e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.345733  normal  0.681062 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2982  Prolyl oligopeptidase  33.1 
 
 
704 aa  341  2e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.35677  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1856  prolyl oligopeptidase  29.49 
 
 
686 aa  283  8.000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.149667  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3635  prolyl oligopeptidase  29.6 
 
 
697 aa  269  2e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1444  Prolyl oligopeptidase  28.31 
 
 
734 aa  267  5.999999999999999e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1041  Prolyl oligopeptidase  29.23 
 
 
704 aa  260  5.0000000000000005e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.726536  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1498  Prolyl oligopeptidase  26.8 
 
 
730 aa  260  7e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1786  oligopeptidase B  27.6 
 
 
688 aa  257  4e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4277  Prolyl oligopeptidase  28.1 
 
 
705 aa  256  9e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2047  prolyl oligopeptidase family protein  28.33 
 
 
697 aa  254  3e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1010  oligopeptidase B  27.39 
 
 
732 aa  253  6e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.371768  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1870  prolyl oligopeptidase  29.34 
 
 
697 aa  252  1e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0010219  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2229  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.34 
 
 
697 aa  252  2e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.271219  normal  0.279234 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2098  prolyl oligopeptidase  28.45 
 
 
701 aa  252  2e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0491197  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1757  prolyl oligopeptidase  36.44 
 
 
696 aa  251  2e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0107679 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3588  prolyl oligopeptidase  28.82 
 
 
695 aa  251  3e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.331687  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2104  prolyl oligopeptidase  29.2 
 
 
697 aa  251  5e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.258358  normal  0.949573 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2255  prolyl oligopeptidase  29.06 
 
 
697 aa  250  7e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000270623  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2328  oligopeptidase B  27.77 
 
 
697 aa  249  8e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0142443 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0781  prolyl oligopeptidase  28.38 
 
 
733 aa  249  1e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.515058  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2372  prolyl oligopeptidase  29.06 
 
 
697 aa  249  1e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000969986  normal  0.312788 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5032  prolyl oligopeptidase  28.73 
 
 
718 aa  249  1e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2090  Prolyl oligopeptidase  28.92 
 
 
697 aa  248  3e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000397024  normal  0.20354 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1129  Prolyl oligopeptidase  29.53 
 
 
614 aa  247  4.9999999999999997e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.107697  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3479  Oligopeptidase B  29.41 
 
 
710 aa  246  9.999999999999999e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.607992 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2995  oligopeptidase B  29.41 
 
 
715 aa  246  9.999999999999999e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0563376 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2232  prolyl oligopeptidase  29.95 
 
 
696 aa  245  1.9999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000449493 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04127  protease II  28.61 
 
 
678 aa  243  9e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6532  Oligopeptidase B  28.1 
 
 
721 aa  239  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0448855  normal  0.250213 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1579  oligopeptidase B  27.76 
 
 
682 aa  239  2e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.767471  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1781  oligopeptidase B  28.78 
 
 
678 aa  238  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3959  oligopeptidase B  28.43 
 
 
708 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2940  prolyl oligopeptidase  28.74 
 
 
710 aa  234  5e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.029506  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2691  oligopeptidase B  27.86 
 
 
701 aa  232  1e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0551  Oligopeptidase B  26.48 
 
 
678 aa  232  2e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2371  prolyl oligopeptidase  26.59 
 
 
690 aa  232  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3948  prolyl oligopeptidase  28.84 
 
 
702 aa  231  3e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32900  Oligopeptidase B protein  28.08 
 
 
682 aa  231  4e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46548  predicted protein  36.36 
 
 
793 aa  231  5e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.560157  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>