162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_04983 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_04983  putative hydrolase  100 
 
 		 251 aa  525  1e-148  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001195  histidinol phosphatase  88.05 
 
 		 251 aa  475  1e-133  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0344  putative hydrolase  73.98 
 
 		 250 aa  395  1e-109  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00676194  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0887  putative hydrolase  67.61 
 
 		 247 aa  357  9e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214006  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001417  histidinol phosphatase  60.16 
 
 		 248 aa  333  1e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1472  putative hydrolase  44.03 
 
 		 254 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.855662  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2880  putative hydrolase  44.03 
 
 		 254 aa  225  6e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014614 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1503  putative hydrolase  44.03 
 
 		 254 aa  225  6e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1467  putative hydrolase  43.62 
 
 		 254 aa  223  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2686  putative hydrolase  44.86 
 
 		 252 aa  221  9e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.796861  unclonable  0.000044786 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1369  putative hydrolase  43.62 
 
 		 251 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.979942  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1652  putative hydrolase  43.85 
 
 		 252 aa  219  3e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1060  putative hydrolase  45.42 
 
 		 245 aa  218  6e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.464705  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1420  putative hydrolase  43.32 
 
 		 247 aa  216  4e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0157701 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3868  putative hydrolase  45.06 
 
 		 250 aa  211  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0341145  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2619  putative hydrolase  44.86 
 
 		 252 aa  206  3e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000339322 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2794  putative hydrolase  44.44 
 
 		 252 aa  205  7e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165673 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1436  putative hydrolase  42.91 
 
 		 260 aa  204  1e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2233  putative hydrolase  42.8 
 
 		 251 aa  202  3e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0111  putative hydrolase  44.1 
 
 		 241 aa  202  4e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1232  putative hydrolase  41.15 
 
 		 245 aa  201  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2054  putative hydrolase  41.15 
 
 		 245 aa  201  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0675001  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2237  putative hydrolase  41.15 
 
 		 245 aa  201  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.616812 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1706  putative hydrolase  40.98 
 
 		 249 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.946189 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1202  putative hydrolase  41.15 
 
 		 245 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.499056  normal  0.794104 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2611  PHP domain protein  41.98 
 
 		 245 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000586023  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3709  putative hydrolase  40.89 
 
 		 248 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000275833  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2185  putative hydrolase  39.92 
 
 		 245 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1247  putative hydrolase  41.15 
 
 		 245 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.428207 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1550  putative hydrolase  41.15 
 
 		 245 aa  196  3e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.115806  normal  0.103219 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2939  putative hydrolase  41.3 
 
 		 246 aa  196  3e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2292  putative hydrolase  41.84 
 
 		 239 aa  195  6e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2280  putative hydrolase  39.51 
 
 		 245 aa  194  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2075  putative hydrolase  39.33 
 
 		 245 aa  194  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.674909  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01031  hypothetical protein  41.98 
 
 		 245 aa  192  5e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1152  putative hydrolase  41.98 
 
 		 245 aa  192  5e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0656771  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01038  hypothetical protein  41.98 
 
 		 245 aa  192  5e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2565  putative hydrolase  41.98 
 
 		 245 aa  192  5e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.155213 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2099  putative hydrolase  41.98 
 
 		 245 aa  192  5e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.95835 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1412  putative hydrolase  41.98 
 
 		 245 aa  192  5e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0615585 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2295  putative hydrolase  41.98 
 
 		 245 aa  192  5e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.31426  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1153  putative hydrolase  41.98 
 
 		 245 aa  192  6e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1934  putative hydrolase  40.33 
 
 		 245 aa  192  6e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000352911  hitchhiker  0.00478063 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1798  putative hydrolase  38.91 
 
 		 245 aa  191  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00489097  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2053  putative hydrolase  38.68 
 
 		 245 aa  190  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2165  putative hydrolase  38.68 
 
 		 245 aa  190  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.213486  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2446  putative hydrolase  38.68 
 
 		 245 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0620  putative hydrolase  39.08 
 
 		 240 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000619827  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4253  putative hydrolase  41.95 
 
 		 237 aa  181  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0316  putative hydrolase  36.93 
 
 		 244 aa  178  9e-44  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2491  putative hydrolase  41.2 
 
 		 248 aa  176  4e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.130978 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2028  PHP domain protein  36.4 
 
 		 238 aa  174  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.731698 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3933  putative hydrolase  40.68 
 
 		 238 aa  170  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00241921  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4017  putative hydrolase  40.17 
 
 		 238 aa  165  8e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.59903e-24 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19230  biotin (acetyl-CoA carboxylase) synthetase  36.55 
 
 		 239 aa  161  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0261596  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3779  PHP domain protein  33.33 
 
 		 243 aa  156  3e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.262487  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0657  PHP domain protein  34.32 
 
 		 235 aa  154  2e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0627  phosphotransferase domain-containing protein  34.03 
 
 		 242 aa  154  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000135059  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1950  putative hydrolase  36.63 
 
 		 244 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2586  putative hydrolase  33.9 
 
 		 240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0073149  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0063  phosphotransferase domain-containing protein  30.21 
 
 		 236 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0109  PHP domain protein  29.02 
 
 		 270 aa  112  6e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.165533 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1177  phosphotransferase domain-containing protein  27.84 
 
 		 243 aa  90.9  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.133886  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0486  PHP-like protein  26.05 
 
 		 574 aa  76.6  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1901  PHP domain protein  29.36 
 
 		 347 aa  75.5  0.0000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1600  PHP domain protein  30.23 
 
 		 580 aa  75.1  0.0000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6605  DNA-directed DNA polymerase  26.34 
 
 		 586 aa  74.3  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.403533  normal  0.15183 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1105  DNA-dependent DNA polymerase family X protein  26.98 
 
 		 557 aa  71.2  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0282445  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0901  PHP-like  27.98 
 
 		 598 aa  70.9  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0250  PHP domain protein  28.71 
 
 		 578 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00055482 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2389  DNA polymerase X family protein  27.54 
 
 		 584 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.766089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05670  DNA polymerase X family protein  26.32 
 
 		 573 aa  67.8  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4036  hypothetical protein  27.27 
 
 		 381 aa  67  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2634  DNA-directed DNA polymerase  29.05 
 
 		 583 aa  66.2  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5838  PHP domain protein  27.06 
 
 		 592 aa  63.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1586  DNA Polymerase X family  24.03 
 
 		 594 aa  64.7  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0273065  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0599  DNA-binding/PHP domain-containing protein  24.03 
 
 		 578 aa  64.3  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000111495  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0265  PHP domain protein  26.79 
 
 		 578 aa  64.3  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0448  PHP domain protein  28.14 
 
 		 357 aa  63.5  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13892  hypothetical protein  34.53 
 
 		 335 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0112  PHP domain protein  26.55 
 
 		 562 aa  62.8  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1963  phosphotransferase domain-containing protein  26.48 
 
 		 614 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.4254  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1134  DNA-directed DNA polymerase  28.91 
 
 		 586 aa  62.4  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.402489  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1792  DNA-directed DNA polymerase  28.12 
 
 		 576 aa  62  0.000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.197029  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3374  PHP domain protein  26.29 
 
 		 349 aa  62  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.24416  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15900  PHP domain protein  27.73 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00203207  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1730  DNA-directed DNA polymerase  26.47 
 
 		 570 aa  60.8  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0586087  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1131  PHP domain protein  25.4 
 
 		 532 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1075  PHP domain protein  26.85 
 
 		 584 aa  60.5  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3942  PHP domain protein  24.8 
 
 		 245 aa  60.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000108896  normal  0.54969 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0710  DNA polymerase X family protein  25.71 
 
 		 642 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.963352  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1814  PHP domain protein  28.99 
 
 		 571 aa  59.7  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.873874  normal  0.593252 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5687  hypothetical protein  26.1 
 
 		 335 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0196791 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5440  hypothetical protein  25.4 
 
 		 334 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.763333  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1064  hypothetical protein  25.83 
 
 		 339 aa  59.3  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.740781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0958  PHP domain protein  24.43 
 
 		 574 aa  59.3  0.00000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0038338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4412  PHP domain protein  26.09 
 
 		 579 aa  58.9  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2005  DNA polymerase X family/PHP domain-containing protein  25.71 
 
 		 650 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0459  phosphotransferase domain-containing protein  32.35 
 
 		 586 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3104  DNA polymerase X family protein  27.65 
 
 		 576 aa  58.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.533704  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>