144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_04975 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_04975  flagellar assembly protein H  100 
 
 		 224 aa  451  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001188  flagellar assembly protein FliH  87.84 
 
 		 251 aa  405  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4415  flagellar assembly protein H  43.65 
 
 		 230 aa  170  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.127482 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3380  flagellar assembly protein H  39.3 
 
 		 236 aa  150  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.972464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0081  flagellar assembly protein H  38.86 
 
 		 251 aa  148  6e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0252  flagellar assembly protein H  38.31 
 
 		 236 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0633  flagellar assembly protein H  40 
 
 		 238 aa  146  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0075  flagellar assembly protein H  37.62 
 
 		 252 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3657  flagellar assembly protein H  39.3 
 
 		 235 aa  145  5e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0232  flagellar assembly protein H  39.49 
 
 		 238 aa  145  6e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.310336 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0713  flagellar assembly protein H  39.49 
 
 		 238 aa  145  6e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3977  flagellar assembly protein H  36.84 
 
 		 236 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3474  flagellar assembly protein H  35.64 
 
 		 235 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0173  flagellar assembly protein H  35.48 
 
 		 241 aa  124  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0225  flagellar assembly protein H  35.94 
 
 		 242 aa  122  6e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4657  flagellar assembly protein FliH  36.14 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.275761 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0711  flagellar assembly protein FliH  32.37 
 
 		 295 aa  89  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.487054 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3064  flagellar assembly protein FliH  30.35 
 
 		 334 aa  85.1  8e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3045  flagellar assembly protein H  30.41 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4268  flagellar assembly protein H  29.19 
 
 		 267 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1967  flagellar assembly protein FliH  29.27 
 
 		 242 aa  79.3  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.147072  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1620  flagellar assembly protein FliH  27.42 
 
 		 324 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3226  flagellar assembly protein H  31.05 
 
 		 316 aa  77  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3563  flagellar assembly protein FliH  26.7 
 
 		 225 aa  76.6  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1995  flagellar assembly protein FliH  26.63 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2295  flagellar assembly protein H  30.98 
 
 		 300 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50110  flagellar assembly protein H  26.71 
 
 		 268 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973712 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02887  flagellar assembly protein H  26.24 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1344  flagellar assembly protein H  30.57 
 
 		 320 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388859 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0496  flagellar assembly protein FliH  26.95 
 
 		 307 aa  74.3  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1960  flagellar assembly protein Flih, putative  26.26 
 
 		 272 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31844  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1538  flagellar assembly protein H  27.27 
 
 		 268 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1368  flagellar assembly protein FliH  28.42 
 
 		 339 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.981358 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1284  flagellar assembly protein H  28.19 
 
 		 316 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1363  flagellar assembly protein FliH  25.76 
 
 		 316 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3455  flagellar assembly protein H  25.7 
 
 		 272 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2574  flagellar assembly protein H  29.26 
 
 		 318 aa  72  0.000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.412103  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1351  flagellar assembly protein H  28.19 
 
 		 316 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.143361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2823  flagellar assembly protein H  26.71 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.283065  normal  0.0158669 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3692  flagellar assembly protein H  26.26 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.438422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2924  flagellar assembly protein H  28.35 
 
 		 338 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002817  flagellar assembly protein FliH  28.19 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2934  flagellar assembly protein H  27.84 
 
 		 338 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03160  flagellar assembly protein H  26.32 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2357  flagellar assembly protein FliH  29.3 
 
 		 243 aa  69.3  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24210  Flagellar assembly protein  28.09 
 
 		 245 aa  69.3  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0165568  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3066  flagellar assembly protein H  27.84 
 
 		 338 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.934094 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1439  flagellar assembly protein H  27.84 
 
 		 338 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4367  flagellar assembly protein H  24.58 
 
 		 263 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.631289 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1326  flagellar assembly protein H  25.25 
 
 		 375 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1500  flagellar assembly protein H  24.58 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3928  flagellar assembly protein H  24.58 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1715  flagellar assembly protein H  26.78 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2186  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like  22.75 
 
 		 349 aa  66.2  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1504  flagellar assembly protein H  24.39 
 
 		 262 aa  65.9  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1957  flagellar assembly protein FliH  26 
 
 		 252 aa  65.9  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.253082  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5263  flagellar assembly protein H  29.94 
 
 		 278 aa  65.9  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16543  normal  0.0759214 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0392  flagellar assembly protein H  29.45 
 
 		 248 aa  65.1  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1184  flagellar assembly protein H  28.87 
 
 		 403 aa  63.2  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0567  flagellar biosynthesis protein  28.06 
 
 		 268 aa  62.8  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0771  flagellar assembly protein FliH  26.58 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.24197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2306  flagellar assembly protein H  21.76 
 
 		 265 aa  62.4  0.000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1160  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  26.98 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966123 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1542  flagellar assembly protein FliH  27.43 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1440  flagellar assembly protein FliH  24.14 
 
 		 276 aa  59.3  0.00000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0552  flagellar assembly protein FliH  26.71 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3652  flagellar assembly protein H  27.44 
 
 		 245 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.526766 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4729  flagellar assembly protein H  27.44 
 
 		 245 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.249746  normal  0.0365414 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1018  flagellar assembly protein FliH  29.65 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1602  flagellar assembly protein FliH  25.39 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5099  flagellar assembly protein H  25.77 
 
 		 255 aa  54.3  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.484808  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0198  flagellar assembly protein H  26.49 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1115  flagellar assembly protein FliH  29.89 
 
 		 247 aa  54.3  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.222897 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1889  flagellar assembly protein H  25.95 
 
 		 240 aa  53.1  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2577  flagellar assembly protein H  25.95 
 
 		 241 aa  53.1  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11533  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3085  flagellar assembly protein H  26.79 
 
 		 227 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0955445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3063  flagellar assembly protein H  27.45 
 
 		 225 aa  53.5  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3111  flagellar assembly protein H  27.45 
 
 		 227 aa  52.4  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.33418  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6415  flagellar assembly protein H  27.45 
 
 		 227 aa  52.4  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.491071 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0640  flagellar assembly protein FliH  26.18 
 
 		 303 aa  52.4  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2977  flagellar assembly protein H  27.45 
 
 		 227 aa  52  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.575281 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1391  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  28.82 
 
 		 262 aa  51.6  0.000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1878  flagellar assembly protein FliH  25.33 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.479163  normal  0.528624 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3805  flagellar assembly protein FliH  25.82 
 
 		 244 aa  51.6  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0570665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0220  flagellar assembly protein H  25.75 
 
 		 226 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.188523  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3079  flagellar assembly protein FliH  25.82 
 
 		 244 aa  51.6  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.131312  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3279  flagellar assembly protein H  25.75 
 
 		 226 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0415  flagellar assembly protein H  25.75 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.359601  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2452  flagellar assembly protein H  26.79 
 
 		 227 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0964661  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3066  flagellar assembly protein H  26.79 
 
 		 227 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00102567  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2944  flagellar assembly protein H  25.75 
 
 		 226 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.122685  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2144  flagellar assembly protein H  25.75 
 
 		 226 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0232  flagellar assembly protein H  25.75 
 
 		 226 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0216224  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3402  flagellar assembly protein H  25.75 
 
 		 226 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1190  flagellar biosynthesis protein  25.61 
 
 		 241 aa  49.3  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4170  flagellar assembly protein FliH  34.69 
 
 		 237 aa  49.7  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.299024  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0690  flagellar assembly protein FliH  23.38 
 
 		 249 aa  49.3  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1574  flagellar assembly protein H  26.98 
 
 		 251 aa  48.9  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1347  flagellar assembly protein FliH  23.17 
 
 		 251 aa  48.5  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1611  hypothetical protein  43.18 
 
 		 318 aa  47.8  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.5466e-22  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>