47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_04894 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_04894  hypothetical protein  100 
 
 
261 aa  548  1e-155  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000753  hypothetical protein  73.93 
 
 
257 aa  416  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000139258  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1471  putative antibiotic resistance protein  53.67 
 
 
262 aa  294  9e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.292447  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5377  aminoglycoside phosphotransferase  45.35 
 
 
265 aa  235  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.556886  normal  0.652804 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4227  aminoglycoside phosphotransferase  42.02 
 
 
324 aa  210  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.722733 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2326  aminoglycoside phosphotransferase  43.32 
 
 
256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030159 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4777  aminoglycoside phosphotransferase  41.25 
 
 
281 aa  195  5.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.266614  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3328  aminoglycoside phosphotransferase  36.43 
 
 
264 aa  167  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.302299  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1028  trifolitoxin immunity protein  36.29 
 
 
263 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102871  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1031  trifolitoxin immunity protein  36.29 
 
 
263 aa  160  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000298382  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1053  trifolitoxin immunity domain-containing protein  35.91 
 
 
262 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000137711  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1288  trifolitoxin immunity domain protein  36.02 
 
 
263 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000214818  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1133  trifolitoxin immunity domain-containing protein  35.91 
 
 
262 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000583619  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1230  trifolitoxin immunity domain-containing protein  36.78 
 
 
263 aa  160  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000170799  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4156  trifolitoxin immunity protein  35.14 
 
 
263 aa  157  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000289256  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6530  aminoglycoside phosphotransferase  36.69 
 
 
238 aa  156  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0352215  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1183  trifolitoxin immunity protein  34.75 
 
 
263 aa  155  6e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00210871  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2126  aminoglycoside phosphotransferase  34.98 
 
 
247 aa  154  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.171035  normal  0.0430024 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1296  aminoglycoside phosphotransferase  36.9 
 
 
295 aa  154  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.240005  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1186  aminoglycoside phosphotransferase  35.57 
 
 
286 aa  149  4e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00289458 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0761  aminoglycoside phosphotransferase  32.64 
 
 
273 aa  133  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.230447  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1068  aminoglycoside phosphotransferase  32.61 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3172  aminoglycoside phosphotransferase  34.43 
 
 
257 aa  118  7.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0232436  hitchhiker  0.0000000099783 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5213  putative aminoglycoside phosphotransferase protein (antibiotic resistance protein)  33.08 
 
 
279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311333  normal  0.607466 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0822  hypothetical protein  41.07 
 
 
219 aa  115  5e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0740155  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7402  hypothetical protein  35.6 
 
 
266 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1734  aminoglycoside phosphotransferase  34.48 
 
 
283 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3956  aminoglycoside phosphotransferase  33.95 
 
 
251 aa  113  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.189113 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0079  aminoglycoside phosphotransferase  26.48 
 
 
259 aa  102  7e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2954  aminoglycoside phosphotransferase  32.27 
 
 
255 aa  102  9e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00316699  decreased coverage  0.00012693 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5537  aminoglycoside phosphotransferase  30 
 
 
268 aa  98.2  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.72204  normal  0.857744 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2798  aminoglycoside phosphotransferase  32.44 
 
 
264 aa  97.8  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789559  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2772  aminoglycoside phosphotransferase  28.63 
 
 
285 aa  95.1  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1984  putative TfxG-like immunity protein against TfxA-like peptides  32.5 
 
 
291 aa  87.8  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1212  trifolitoxin immunity protein  37.98 
 
 
140 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1395  putative trifolitoxin immunity protein  32.65 
 
 
243 aa  83.6  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.815075  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1013  aminoglycoside phosphotransferase  27.97 
 
 
279 aa  83.2  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1421  putative trifolitoxin immunity protein  31.1 
 
 
254 aa  82.8  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2262  aminoglycoside phosphotransferase  26.19 
 
 
253 aa  82  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.657806 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3867  aminoglycoside phosphotransferase  24.8 
 
 
264 aa  81.6  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.499671  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2040  aminoglycoside phosphotransferase  26.69 
 
 
277 aa  79.3  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.569005 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35590  phosphotransferase family protein  26.56 
 
 
269 aa  75.5  0.0000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.886492  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2966  aminoglycoside phosphotransferase  25 
 
 
252 aa  72  0.000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14970  putative homoserine kinase type II (protein kinase fold)  23.4 
 
 
256 aa  72  0.000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.448489  normal  0.426954 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1211  trifolitoxin immunity domain protein  36.76 
 
 
93 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3335  aminoglycoside phosphotransferase  29.09 
 
 
243 aa  43.5  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.244161  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0158  hypothetical protein  31.48 
 
 
234 aa  43.5  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>