More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_04892 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_04892  hypothetical protein  100 
 
 
321 aa  664  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000755  outer membrane protein A precursor  83.44 
 
 
326 aa  555  1e-157  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  4.75354e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  58.63 
 
 
330 aa  363  2e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  4.10155e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  58.59 
 
 
334 aa  357  1e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  42.73 
 
 
321 aa  248  1e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  39.51 
 
 
318 aa  223  4e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  37.76 
 
 
320 aa  213  3e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  32.85 
 
 
367 aa  173  3e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0114  outer membrane protein A  33.69 
 
 
342 aa  151  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.394411  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1701  outer membrane protein, OmpA family  32.34 
 
 
355 aa  147  3e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.908317  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0924  OmpA/MotB domain-containing protein  31.25 
 
 
356 aa  147  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4399  OmpA/MotB domain-containing protein  30.61 
 
 
333 aa  136  5e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.421249  normal  0.955819 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0690  OmpA/MotB domain-containing protein  32.35 
 
 
331 aa  133  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2705  OmpA/MotB domain-containing protein  30.33 
 
 
324 aa  130  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3199  outer membrane protein A  28.24 
 
 
353 aa  127  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  3.81188e-11  hitchhiker  0.00427506 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2630  outer membrane protein A  28.24 
 
 
353 aa  127  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  8.8038e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2542  outer membrane protein A  28.24 
 
 
357 aa  127  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  9.37616e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1179  outer membrane protein A  28.36 
 
 
358 aa  117  2e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000188951  normal  0.637141 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1145  outer membrane protein A  28.36 
 
 
369 aa  117  2e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00470585  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0701  OmpA/MotB domain-containing protein  27.33 
 
 
369 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00968  hypothetical protein  27.89 
 
 
346 aa  115  7e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  7.88885e-07  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00961  outer membrane protein A (3a;II*;G;d)  27.89 
 
 
346 aa  115  7e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  5.0212e-07  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2686  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  27.89 
 
 
346 aa  115  7e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  9.93272e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1066  outer membrane protein A  27.89 
 
 
346 aa  115  7e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.14063e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2359  outer membrane protein A  27.89 
 
 
346 aa  115  7e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  4.4176e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1133  outer membrane protein A  28.86 
 
 
369 aa  115  7e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  5.33703e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1121  outer membrane protein A  27.89 
 
 
354 aa  115  8e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  1.16879e-08  normal  0.89417 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2163  outer membrane protein A  28.86 
 
 
358 aa  115  8e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  1.95857e-08  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2639  outer membrane protein A  27.89 
 
 
365 aa  115  9e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  6.98773e-08  unclonable  2.77772e-08 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1112  OmpA/MotB domain-containing protein  29.06 
 
 
369 aa  115  1e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00190106  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3244  OmpA/MotB domain protein  29.06 
 
 
369 aa  115  1e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107614  hitchhiker  0.00411399 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1111  outer membrane protein A  28.07 
 
 
358 aa  115  1e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000109909  hitchhiker  0.00334653 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1071  outer membrane protein A  28.65 
 
 
350 aa  115  1e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  3.3965e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1469  outer membrane protein A  28.33 
 
 
351 aa  114  2e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  8.45833e-08  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1028  outer membrane protein A  27.7 
 
 
371 aa  114  2e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  2.86695e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  26.76 
 
 
365 aa  114  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1754  outer membrane protein A  26.35 
 
 
358 aa  113  4e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  5.40093e-10  decreased coverage  5.07763e-07 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0914  OmpA/MotB  29.09 
 
 
368 aa  111  1e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.412467  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  27.25 
 
 
372 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1209  outer membrane protein A  26.86 
 
 
355 aa  108  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  3.42607e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4513  OmpA domain-containing protein  28.65 
 
 
341 aa  107  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17802  normal  0.652887 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3146  OmpA/MotB domain-containing protein  27.46 
 
 
373 aa  107  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000812337  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  26.96 
 
 
372 aa  107  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1281  OmpA/MotB domain-containing protein  27.86 
 
 
367 aa  105  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000128179  normal  0.0324976 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1050  OmpA/MotB domain-containing protein  27.14 
 
 
366 aa  105  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0116313  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1045  OmpA/MotB domain-containing protein  26.91 
 
 
363 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  1.83072e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1146  OmpA/MotB domain-containing protein  26.91 
 
 
369 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal  0.603197 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2698  outer membrane protein A  25.21 
 
 
354 aa  102  7e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  1.18487e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3545  OmpA family protein  26.53 
 
 
370 aa  102  8e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2858  outer membrane protein A  25.35 
 
 
361 aa  101  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  1.65079e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1090  OmpA/MotB domain-containing protein  25.9 
 
 
367 aa  99.8  6e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000322286  normal  0.0373781 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  43.24 
 
 
226 aa  97.8  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1319  OmpA/MotB domain-containing protein  28.66 
 
 
376 aa  98.2  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  5.38127e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2899  OmpA/MotB domain-containing protein  26.32 
 
 
376 aa  97.4  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  28.77 
 
 
345 aa  97.4  3e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2549  outer membrane protein A  25.35 
 
 
366 aa  97.1  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000121755  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0708  OmpA/MotB domain-containing protein  44.66 
 
 
228 aa  97.1  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.808623  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10918  outer membrane protein A ompA  44.66 
 
 
326 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  44.66 
 
 
415 aa  92  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  43.56 
 
 
319 aa  91.7  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  6.51702e-11  n/a   
 
 
 
NC_009901  Spea_0456  OmpA domain-containing protein  26.38 
 
 
346 aa  91.3  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3969  OmpA family protein  40.78 
 
 
228 aa  91.3  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  40.19 
 
 
220 aa  90.1  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  40.19 
 
 
220 aa  90.1  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  40.19 
 
 
220 aa  90.1  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  40.19 
 
 
220 aa  90.1  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  40.19 
 
 
220 aa  90.1  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0606  OmpA/MotB domain-containing protein  41.9 
 
 
227 aa  89.7  6e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0759282 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  38.02 
 
 
220 aa  89.7  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  43.56 
 
 
264 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  5.60377e-06 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  28.14 
 
 
333 aa  89.4  8e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  1.97596e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  43.56 
 
 
537 aa  89  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  38.46 
 
 
478 aa  89.4  9e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0665  OmpA/MotB domain-containing protein  39.81 
 
 
230 aa  89  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  1.80741e-07  normal  0.0736379 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3675  OmpA/MotB domain-containing protein  39.81 
 
 
230 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  2.6276e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0709  OmpA/MotB domain-containing protein  39.81 
 
 
230 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  9.40918e-08  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3356  OmpA/MotB domain-containing protein  39.81 
 
 
230 aa  89  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  6.5492e-07  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0679  OmpA/MotB domain-containing protein  39.81 
 
 
230 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0519812  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0666  OmpA/MotB domain-containing protein  39.81 
 
 
230 aa  89  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  5.15803e-09  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1035  hemagglutinin antigen  26.84 
 
 
355 aa  89  1e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  6.58717e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  37.96 
 
 
230 aa  88.2  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4073  OmpA/MotB domain-containing protein  44.12 
 
 
319 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.68736  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0700  OmpA/MotB domain protein  39.81 
 
 
230 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2733  OmpA/MotB  25.07 
 
 
377 aa  88.6  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140281  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  41.35 
 
 
459 aa  88.6  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0062  putative outer membrane lipoprotein  40.19 
 
 
220 aa  87.8  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  41.75 
 
 
222 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  40.95 
 
 
229 aa  87.4  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  38.1 
 
 
422 aa  87  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  33.55 
 
 
239 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5931  OmpA/MotB domain-containing protein  54.93 
 
 
220 aa  87  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.639892 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  48.1 
 
 
215 aa  87  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003729  outer membrane protein  41.9 
 
 
222 aa  86.7  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.113552  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0181  OmpA/MotB domain-containing protein  39.42 
 
 
224 aa  86.7  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  41.9 
 
 
210 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  41.9 
 
 
210 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  4.07187e-05 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5618  OmpA/MotB  54.93 
 
 
220 aa  86.3  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.271834  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  43.33 
 
 
215 aa  86.3  7e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  43.33 
 
 
215 aa  86.3  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  43.33 
 
 
215 aa  86.3  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>