More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_04889 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_04889  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 466 aa  967    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000757  glycine/D-amino acid oxidase  89.06 
 
 		 466 aa  855    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.270345  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2530  FAD dependent oxidoreductase  55.39 
 
 		 521 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3143  FAD dependent oxidoreductase  55.56 
 
 		 462 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3196  FAD dependent oxidoreductase  55.56 
 
 		 462 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6498  FAD dependent oxidoreductase  55.34 
 
 		 491 aa  522  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.438276  normal  0.189635 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3163  aminophosphonate oxidoreductase  54.9 
 
 		 462 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0194513 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3139  aminophosphonate oxidoreductase  54.9 
 
 		 462 aa  514  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000145397 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3079  aminophosphonate oxidoreductase  55.03 
 
 		 462 aa  511  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0471981 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3762  hypothetical protein  54.83 
 
 		 465 aa  509  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2549  hypothetical protein  53.69 
 
 		 463 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165188  decreased coverage  0.00741775 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3166  FAD dependent oxidoreductase  53.69 
 
 		 463 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.659262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3679  FAD dependent oxidoreductase  52.35 
 
 		 463 aa  496  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3367  aminophosphonate oxidoreductase  53.47 
 
 		 463 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.585702  normal  0.425425 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5870  FAD dependent oxidoreductase  53.58 
 
 		 463 aa  494  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.982629  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2220  aminophosphonate oxidoreductase  53.47 
 
 		 463 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44210  putative glycine/D-amino acid oxidase  53.1 
 
 		 465 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.032969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3223  FAD dependent oxidoreductase  52.97 
 
 		 465 aa  481  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.188463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2277  FAD dependent oxidoreductase  40.43 
 
 		 486 aa  322  6e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39720  putative amino acid oxidase  38.61 
 
 		 466 aa  309  5e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3946  hypothetical protein  37 
 
 		 470 aa  296  5e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0812  FAD dependent oxidoreductase  37.75 
 
 		 473 aa  292  1e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0634  FAD dependent oxidoreductase  35.41 
 
 		 476 aa  259  1e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3646  hypothetical protein  37.16 
 
 		 469 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0271589 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2810  FAD dependent oxidoreductase  33.03 
 
 		 496 aa  204  4e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.73838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3392  FAD dependent oxidoreductase  30.79 
 
 		 464 aa  190  5.999999999999999e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6023  hypothetical protein  30.04 
 
 		 466 aa  190  5.999999999999999e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal  0.530201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1549  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 		 472 aa  186  8e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0684426 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0622  FAD dependent oxidoreductase  31.24 
 
 		 463 aa  180  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0903  FAD dependent oxidoreductase  27.5 
 
 		 454 aa  179  9e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3857  FAD dependent oxidoreductase  30.86 
 
 		 462 aa  178  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2906  FAD dependent oxidoreductase  30.2 
 
 		 474 aa  177  4e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000261915  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1113  FAD dependent oxidoreductase  31.04 
 
 		 473 aa  175  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1987  FAD dependent oxidoreductase  28.54 
 
 		 465 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129488  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1013  FAD dependent oxidoreductase  29.29 
 
 		 464 aa  173  5e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.244373 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2153  FAD dependent oxidoreductase  31.36 
 
 		 475 aa  169  9e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.518095  normal  0.441318 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7089  FAD dependent oxidoreductase  29.02 
 
 		 459 aa  169  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.10152 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0095  hypothetical protein  30.28 
 
 		 470 aa  168  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0631849  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0284  putative oxidoreductase  28.54 
 
 		 473 aa  168  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1934  FAD dependent oxidoreductase  29.76 
 
 		 472 aa  168  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1885  hypothetical protein  28.73 
 
 		 464 aa  168  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0919  FAD dependent oxidoreductase  32.12 
 
 		 475 aa  167  5e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.108527  normal  0.544612 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2784  FAD dependent oxidoreductase  30.25 
 
 		 483 aa  166  8e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4303  FAD dependent oxidoreductase  31.36 
 
 		 468 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0390  hypothetical protein  28.77 
 
 		 465 aa  164  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0908  FAD dependent oxidoreductase  29.52 
 
 		 460 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2058  hypothetical protein  29.2 
 
 		 480 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00793169  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1702  hypothetical protein  30.64 
 
 		 468 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0875  FAD dependent oxidoreductase  31.44 
 
 		 476 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.120395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3861  FAD dependent oxidoreductase  27.23 
 
 		 457 aa  162  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4628  FAD dependent oxidoreductase  30.82 
 
 		 477 aa  160  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1109  FAD dependent oxidoreductase  28.67 
 
 		 457 aa  160  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.921836 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0905  FAD dependent oxidoreductase  31.44 
 
 		 468 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.358766 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5174  FAD dependent oxidoreductase  27.96 
 
 		 456 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5086  FAD dependent oxidoreductase  27.96 
 
 		 456 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.973879  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5196  FAD dependent oxidoreductase  29.79 
 
 		 486 aa  158  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1515  FAD dependent oxidoreductase  29.55 
 
 		 463 aa  158  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1496  FAD dependent oxidoreductase  28.98 
 
 		 453 aa  157  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.381032  normal  0.348972 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3231  FAD dependent oxidoreductase  27.96 
 
 		 466 aa  157  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.749546  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5713  FAD dependent oxidoreductase  29.86 
 
 		 460 aa  157  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1338  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 425 aa  157  4e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  29.57 
 
 		 428 aa  157  4e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3062  FAD dependent oxidoreductase  28.98 
 
 		 482 aa  157  5.0000000000000005e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.30158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5703  FAD dependent oxidoreductase  29.26 
 
 		 472 aa  157  6e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.563172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6396  FAD dependent oxidoreductase  27.31 
 
 		 482 aa  156  8e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0152469  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19770  hypothetical protein  30.15 
 
 		 468 aa  156  8e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5715  FAD dependent oxidoreductase  30.49 
 
 		 480 aa  155  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  29.33 
 
 		 428 aa  155  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  29.33 
 
 		 428 aa  155  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6399  twin-arginine translocation pathway signal  28.23 
 
 		 482 aa  155  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5464  FAD dependent oxidoreductase  28.51 
 
 		 456 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2415  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 436 aa  154  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342096  normal  0.0777393 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3861  FAD dependent oxidoreductase  28.06 
 
 		 470 aa  152  8e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  0.682317 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3170  FAD dependent oxidoreductase  28.54 
 
 		 477 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540221 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  27.39 
 
 		 429 aa  152  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  29.04 
 
 		 426 aa  152  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  27.23 
 
 		 427 aa  151  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  27.4 
 
 		 427 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0950  FAD dependent oxidoreductase  29.98 
 
 		 466 aa  151  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.230558  normal  0.1985 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  27.4 
 
 		 427 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  27.17 
 
 		 427 aa  151  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  27.59 
 
 		 427 aa  150  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  27.17 
 
 		 427 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  28.37 
 
 		 440 aa  150  4e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  29.18 
 
 		 439 aa  150  5e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  29.12 
 
 		 437 aa  150  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  28.93 
 
 		 439 aa  150  7e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1741  FAD dependent oxidoreductase  29.13 
 
 		 441 aa  149  9e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0139  FAD dependent oxidoreductase  27.8 
 
 		 464 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.412915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2617  FAD dependent oxidoreductase  27.72 
 
 		 460 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523362  normal  0.489524 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  28.07 
 
 		 428 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0254  FAD dependent oxidoreductase  27.62 
 
 		 443 aa  148  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  28.92 
 
 		 426 aa  147  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  28.54 
 
 		 437 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  28.92 
 
 		 426 aa  147  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  28.92 
 
 		 426 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  28.92 
 
 		 426 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  28.92 
 
 		 426 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  28.92 
 
 		 426 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  28.92 
 
 		 426 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>