More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_03692 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_03692  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  293  4e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002375  MSHA pilin protein MshA  59.76 
 
 
168 aa  160  5.0000000000000005e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0138724  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0476  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin A  58.39 
 
 
157 aa  151  2.9999999999999998e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0477  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin A  72.55 
 
 
156 aa  147  6e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.581973  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2827  MSHA pilin protein MshA  47.67 
 
 
178 aa  127  6e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.99325  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3828  methylation site containing protein  44.89 
 
 
172 aa  121  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000112537  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4409  methylation site containing protein  43.51 
 
 
166 aa  115  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000123074  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0397  methylation site containing protein  39.47 
 
 
163 aa  114  6e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.061774  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0552  MSHA pilin protein MshA  53.85 
 
 
159 aa  111  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00386307  normal  0.526597 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4105  MSHA pilin protein MshA  48.12 
 
 
171 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0491  methylation site containing protein  53.77 
 
 
186 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000497616  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00258  MSHA pilin protein MshA  44.68 
 
 
163 aa  107  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0512  methylation site containing protein  53.77 
 
 
182 aa  107  6e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000175657  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0473  methylation site containing protein  46.02 
 
 
174 aa  106  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000513166  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4408  MSHA pilin protein MshA  42.38 
 
 
170 aa  106  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00456827  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0461  MSHA pilin protein MshA  45.86 
 
 
172 aa  106  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3479  methylation site containing protein  41.03 
 
 
169 aa  105  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000294883  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3656  methylation site containing protein  52.43 
 
 
169 aa  105  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00406084  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0396  methylation site containing protein  43.11 
 
 
169 aa  103  6e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0195536  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3296  methylation site containing protein  42.86 
 
 
173 aa  103  6e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3744  methylation site containing protein  42.94 
 
 
173 aa  103  9e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.144711  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0567  methylation site containing protein  41.4 
 
 
169 aa  102  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.468703  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0516  methylation site containing protein  42.69 
 
 
172 aa  102  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00623258  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1141  V10 pilin  59.52 
 
 
163 aa  102  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3761  MSHA pilin protein MshA  41.32 
 
 
178 aa  102  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000202365  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3760  methylation site containing protein  71.21 
 
 
176 aa  101  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000143336  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0573  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  41.45 
 
 
166 aa  100  8e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.200044 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0515  methylation site containing protein  41.67 
 
 
168 aa  99.8  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000372661  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4410  methylation site containing protein  63.77 
 
 
175 aa  97.4  6e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000246782  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0551  MSHA pilin protein MshA  66.67 
 
 
173 aa  97.1  8e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000258454  normal  0.542221 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3340  methylation  40 
 
 
172 aa  95.5  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000827612  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0364  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  37.75 
 
 
163 aa  94.7  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0735599  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0568  methylation site containing protein  40.76 
 
 
169 aa  90.9  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.238644  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4569  MSHA pilin protein MshA  36.93 
 
 
187 aa  90.9  6e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442923  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3478  methylation site containing protein  44.37 
 
 
169 aa  90.9  6e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000141512  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1109  hypothetical protein  48.89 
 
 
166 aa  87.8  5e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3983  methylation site containing protein  37.59 
 
 
165 aa  87.4  6e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3099  methylation site containing protein  38.36 
 
 
172 aa  86.3  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0760  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  40.71 
 
 
156 aa  84.3  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.014468  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1380  methylation site containing protein  53.33 
 
 
190 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0550  methylation site containing protein  47.67 
 
 
218 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000424061  normal  0.764365 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0883  general secretion pathway protein H  39.87 
 
 
146 aa  79.7  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0109332  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000280  MSHA pilin protein MshA  45.19 
 
 
176 aa  79.3  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.528287  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0327  methylation site containing protein  35.06 
 
 
179 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0267191  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3480  methylation site containing protein  46.15 
 
 
205 aa  77  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000493749  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3822  putative V10 pilin  44.32 
 
 
163 aa  77  0.00000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4106  MSHA pilin protein MshB  45.05 
 
 
205 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3657  methylation site containing protein  45.05 
 
 
205 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000205665  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0566  MSHA pilin protein MshB  43.96 
 
 
205 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.571105  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0472  methylation site containing protein  45.05 
 
 
205 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000795599  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0490  MSHA pilin protein MshB  45.05 
 
 
205 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000965015  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0511  MSHA pilin protein MshB  45.05 
 
 
205 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000086206  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3829  MSHA pilin protein MshB  45.05 
 
 
205 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000175672  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0514  MSHA pilin protein MshB  45.05 
 
 
205 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00061527  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2151  membrane protein  52.86 
 
 
186 aa  74.3  0.0000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.899411  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3762  methylation site containing protein  40 
 
 
202 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000262752  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3758  hypothetical protein  50.68 
 
 
174 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0395  methylation site containing protein  43.48 
 
 
211 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0635812  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3341  methylation  46.59 
 
 
205 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000885834  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3821  hypothetical protein  41.86 
 
 
173 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3745  methylation site containing protein  44.44 
 
 
201 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0403042  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2913  hypothetical protein  42.48 
 
 
182 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4411  methylation site containing protein  42.22 
 
 
219 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000316241  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4255  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  33.33 
 
 
176 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0576  hypothetical protein  49.32 
 
 
174 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0726397 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0067  hypothetical protein  39.13 
 
 
169 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0176  prepilin-type cleavage/methylation  40.43 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0460  MSHA pilin protein MshB  44.32 
 
 
201 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.671  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003563  type II secretory pathway pseudopilin PulG  41.57 
 
 
163 aa  67.8  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3315  pilin, putative  57.41 
 
 
185 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.540059  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0898  hypothetical protein  49.18 
 
 
172 aa  67  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3464  hypothetical protein  49.18 
 
 
172 aa  67  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0708  methylation site containing protein  50.82 
 
 
170 aa  67  0.00000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0386199  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1176  hypothetical protein  42.86 
 
 
163 aa  67  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3781  hypothetical protein  52.46 
 
 
172 aa  67  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0907  hypothetical protein  49.18 
 
 
172 aa  67  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0872  hypothetical protein  49.18 
 
 
172 aa  67  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0856  methylation site containing protein  60.42 
 
 
182 aa  67  0.00000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0177  prepilin-type cleavage/methylation  53.49 
 
 
186 aa  66.6  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02523  hypothetical protein  40.45 
 
 
163 aa  66.2  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0964  pilin, putative  30 
 
 
187 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0885526  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1066  pilin, putative  30.41 
 
 
187 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00196226  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3326  pilin, putative  30 
 
 
187 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0266287  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1033  pilin, putative  30 
 
 
187 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0234716  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1064  methylation site containing protein  42.65 
 
 
164 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.691522  normal  0.0588159 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1141  MSHA pilin protein MshB  44.87 
 
 
126 aa  63.9  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0999  methylation site containing protein  42.65 
 
 
164 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0926979  normal  0.0597088 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1003  methylation site containing protein  42.65 
 
 
164 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.102399 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0842  hypothetical protein  42.86 
 
 
193 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3690  methylation site containing protein  50.79 
 
 
185 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2860  methylation site containing protein  39.71 
 
 
167 aa  63.2  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01338  hypothetical protein  37.14 
 
 
195 aa  63.2  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3074  pilin, putative  55.77 
 
 
178 aa  63.2  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3217  hypothetical protein  60.78 
 
 
108 aa  63.2  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000170582 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0754  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  36.84 
 
 
195 aa  62.4  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.430859  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3689  pilin, putative  58 
 
 
186 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3989  pilin, putative  52.73 
 
 
187 aa  62.4  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.387559 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3266  methylation site containing protein  42.42 
 
 
167 aa  61.6  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3444  methylation site containing protein  42.42 
 
 
167 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280491 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1101  methylation site containing protein  42.42 
 
 
167 aa  61.6  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000943511 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>