295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_03532 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_03532  4'-phosphopantetheinyl transferase  100 
 
 
126 aa  252  1.0000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002501  holo-[acyl-carrier protein] synthase  82.54 
 
 
126 aa  220  4e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2521  4'-phosphopantetheinyl transferase  73.02 
 
 
126 aa  191  4e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.280431  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2035  4'-phosphopantetheinyl transferase  69.11 
 
 
126 aa  181  3e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2739  4'-phosphopantetheinyl transferase  58.73 
 
 
126 aa  150  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.180999  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2955  4'-phosphopantetheinyl transferase  58.73 
 
 
126 aa  150  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.620212  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2843  4'-phosphopantetheinyl transferase  58.73 
 
 
126 aa  150  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.819519 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2820  4'-phosphopantetheinyl transferase  58.73 
 
 
126 aa  150  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.539822  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2780  4'-phosphopantetheinyl transferase  58.73 
 
 
126 aa  149  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3067  4'-phosphopantetheinyl transferase  57.14 
 
 
126 aa  147  4e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.46528  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2716  4'-phosphopantetheinyl transferase  57.94 
 
 
126 aa  147  6e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2928  4'-phosphopantetheinyl transferase  57.94 
 
 
126 aa  146  8e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.768725  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2849  4'-phosphopantetheinyl transferase  57.94 
 
 
126 aa  146  8e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.575353  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02457  4'-phosphopantetheinyl transferase  57.14 
 
 
126 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1105  holo-acyl-carrier-protein synthase  57.14 
 
 
126 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.331177  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2718  4'-phosphopantetheinyl transferase  57.94 
 
 
126 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1072  4'-phosphopantetheinyl transferase  58.4 
 
 
126 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.549498  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02421  hypothetical protein  57.14 
 
 
126 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3799  4'-phosphopantetheinyl transferase  57.94 
 
 
126 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1114  4'-phosphopantetheinyl transferase  57.14 
 
 
126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2781  4'-phosphopantetheinyl transferase  58.73 
 
 
126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1208  4'-phosphopantetheinyl transferase  55.56 
 
 
126 aa  144  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3050  4'-phosphopantetheinyl transferase  56.35 
 
 
126 aa  144  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0986537  normal  0.022176 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1140  4'-phosphopantetheinyl transferase  56.35 
 
 
126 aa  140  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1193  4'-phosphopantetheinyl transferase  56.35 
 
 
126 aa  140  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3615  4'-phosphopantetheinyl transferase  55.56 
 
 
126 aa  139  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3665  4'-phosphopantetheinyl transferase  52.8 
 
 
126 aa  133  7.000000000000001e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0884  4'-phosphopantetheinyl transferase  54.03 
 
 
125 aa  130  5e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.331575 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0278  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  51.2 
 
 
146 aa  123  7e-28  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3708  4'-phosphopantetheinyl transferase  51.59 
 
 
126 aa  122  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.314229  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0738  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  47.58 
 
 
127 aa  120  9e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03403  4'-phosphopantetheinyl transferase  50 
 
 
126 aa  115  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.109163  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1384  holo-acyl-carrier-protein synthase  47.2 
 
 
130 aa  107  8.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2762  4'-phosphopantetheinyl transferase  52.76 
 
 
126 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.111815  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1247  4'-phosphopantetheinyl transferase  52.67 
 
 
132 aa  106  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000019749  unclonable  0.0000000106801 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1058  4'-phosphopantetheinyl transferase  50.38 
 
 
133 aa  103  9e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0030  holo-acyl-carrier-protein synthase  51.64 
 
 
126 aa  102  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0208  4'-phosphopantetheinyl transferase  47.2 
 
 
119 aa  101  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0873821  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1144  4'-phosphopantetheinyl transferase  46.77 
 
 
124 aa  101  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.332386  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2033  Holo-acyl carrier protein synthase:phosphopantethiene-protein transferase  45.6 
 
 
125 aa  101  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.20523  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1249  holo-acyl-carrier-protein synthase  47.24 
 
 
127 aa  100  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1152  4'-phosphopantetheinyl transferase  53.03 
 
 
132 aa  100  9e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0996  4'-phosphopantetheinyl transferase  45.31 
 
 
134 aa  99.8  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.638191  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1760  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.28 
 
 
125 aa  100  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0306  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.41 
 
 
137 aa  99  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1249  4'-phosphopantetheinyl transferase  50 
 
 
127 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0121118  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3108  4'-phosphopantetheinyl transferase  50 
 
 
127 aa  98.2  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000299312  normal  0.0184251 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1673  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.41 
 
 
137 aa  98.6  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1205  4'-phosphopantetheinyl transferase  50 
 
 
127 aa  98.2  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00105057  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2272  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.19 
 
 
136 aa  98.2  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.130152 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0520  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.72 
 
 
150 aa  97.8  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1149  4'-phosphopantetheinyl transferase  45.31 
 
 
134 aa  97.4  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2925  4'-phosphopantetheinyl transferase  49.21 
 
 
126 aa  97.4  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1255  4'-phosphopantetheinyl transferase  45.16 
 
 
124 aa  97.1  7e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1282  4'-phosphopantetheinyl transferase  49.23 
 
 
127 aa  96.7  9e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0790463  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0198  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.84 
 
 
139 aa  96.7  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1163  4'-phosphopantetheinyl transferase  49.21 
 
 
127 aa  96.3  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.211721  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0421  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.28 
 
 
139 aa  96.3  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.364619  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0659  4'-phosphopantetheinyl transferase  45.31 
 
 
134 aa  95.5  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0916337  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1352  4'-phosphopantetheinyl transferase  50 
 
 
127 aa  95.5  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2844  4'-phosphopantetheinyl transferase  51.18 
 
 
127 aa  95.9  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.712393  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2926  4'-phosphopantetheinyl transferase  51.18 
 
 
127 aa  95.9  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0680  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.97 
 
 
139 aa  95.9  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2547  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.41 
 
 
136 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605965  normal  0.0384272 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0652  4'-phosphopantetheinyl transferase  45.31 
 
 
134 aa  95.5  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.512753  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0030  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.67 
 
 
134 aa  95.9  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0361  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.46 
 
 
123 aa  95.1  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2629  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.75 
 
 
158 aa  94.7  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597065  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1760  holo-acyl-carrier-protein synthase  42.28 
 
 
126 aa  94.7  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0948  holo-acyl-carrier-protein synthase  42.19 
 
 
133 aa  94.7  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2167  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.4 
 
 
141 aa  94.7  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3022  4'-phosphopantetheinyl transferase  50.39 
 
 
127 aa  94.7  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0398332  normal  0.769901 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2230  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.41 
 
 
136 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.558509  normal  0.0780683 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2573  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.84 
 
 
137 aa  94.4  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0256708 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1351  holo-acyl-carrier-protein synthase  48.8 
 
 
128 aa  94.4  5e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0301322  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0471  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.19 
 
 
133 aa  94.4  5e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0868  4'-phosphopantetheinyl transferase  45.53 
 
 
126 aa  92.8  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0432796 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1012  4'-phosphopantetheinyl transferase  45.53 
 
 
126 aa  92.8  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0277595 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2561  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.09 
 
 
142 aa  93.2  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0826465  hitchhiker  0.00133765 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1041  4'-phosphopantetheinyl transferase  49.23 
 
 
131 aa  93.2  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.893857  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0993  holo-acyl-carrier-protein synthase  43.75 
 
 
145 aa  92  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0239531 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1096  holo-acyl-carrier-protein synthase  45.6 
 
 
126 aa  92.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.383403  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2527  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.13 
 
 
126 aa  92.4  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.252162  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1089  4'-phosphopantetheinyl transferase  45.6 
 
 
129 aa  91.7  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2308  holo-acyl-carrier-protein synthase  44.44 
 
 
125 aa  91.3  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0208119  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1572  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.84 
 
 
142 aa  90.9  6e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.335849  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1409  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.31 
 
 
133 aa  90.1  9e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1753  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.76 
 
 
130 aa  90.1  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0326  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.9 
 
 
126 aa  89.4  2e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000137986  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3631  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.06 
 
 
132 aa  89  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1200  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.06 
 
 
543 aa  89  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.174413  decreased coverage  0.00601757 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0532  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.86 
 
 
134 aa  88.6  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0694245  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0375  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.88 
 
 
136 aa  88.6  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.457034  normal  0.658443 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2615  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.72 
 
 
130 aa  87.8  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0741  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.13 
 
 
123 aa  87.8  4e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.125291  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7365  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.28 
 
 
132 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.012479  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3262  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.72 
 
 
130 aa  87.8  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.033674 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0236  4'-phosphopantetheinyl transferase  47.24 
 
 
119 aa  87.4  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3057  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.84 
 
 
130 aa  87.4  6e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1208  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.32 
 
 
128 aa  87  7e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>