91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_03337 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_03337  beta-D-galactosidase, alpha subunit  100 
 
 		 245 aa  516  1.0000000000000001e-145  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002658  beta-D-galactosidase alpha subunit  94.29 
 
 		 1032 aa  488  1e-137  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.454065  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3370  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  65.53 
 
 		 1030 aa  345  4e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02945  cryptic beta-D-galactosidase, alpha subunit  65.11 
 
 		 1030 aa  342  2e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0625  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  65.11 
 
 		 1030 aa  342  2e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02895  hypothetical protein  65.11 
 
 		 1030 aa  342  2e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3543  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  65.11 
 
 		 1030 aa  342  2e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0624  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  64.68 
 
 		 1030 aa  341  5.999999999999999e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4390  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  64.68 
 
 		 1030 aa  341  5.999999999999999e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3258  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  64.68 
 
 		 1030 aa  340  1e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1973  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  57.94 
 
 		 1030 aa  293  2e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.75541  hitchhiker  0.00919107 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  37.67 
 
 		 1033 aa  151  8.999999999999999e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1218  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  32.5 
 
 		 1041 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000962199  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0715  Beta-galactosidase  34.58 
 
 		 1024 aa  137  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3903  Beta-galactosidase  35.89 
 
 		 1063 aa  128  8.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.120366  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2370  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  31.25 
 
 		 1026 aa  128  9.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0768675  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03201  beta-galactosidase (Eurofung)  29.09 
 
 		 1030 aa  122  7e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.112028 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4102  Beta-galactosidase  35.71 
 
 		 1108 aa  118  7e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283499  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0821  glycoside hydrolase family protein  32.04 
 
 		 1079 aa  112  6e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00114768  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4911  Beta-galactosidase  34.74 
 
 		 1003 aa  112  6e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.114803  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0154  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  31.9 
 
 		 1030 aa  111  8.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1433  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  33.81 
 
 		 1003 aa  112  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1625  glycoside hydrolase family 42 protein  35.26 
 
 		 1084 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00573488  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02463  beta-galactosidase (Eurofung)  30.53 
 
 		 1023 aa  110  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.220978 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1559  glycoside hydrolase family protein  35.26 
 
 		 1084 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000116157  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4961  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  31.09 
 
 		 1018 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2493  Beta-galactosidase  34.1 
 
 		 1043 aa  104  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  31.91 
 
 		 1129 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4484  glycoside hydrolase family protein  32.63 
 
 		 1049 aa  104  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.137937  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1221  beta-galactosidase  41.26 
 
 		 1455 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2714  Beta-galactosidase  31.73 
 
 		 1020 aa  103  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2717  Beta-galactosidase  32.98 
 
 		 1045 aa  102  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.945973 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46582  predicted protein  28.79 
 
 		 561 aa  99.4  5e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3466  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  30.33 
 
 		 968 aa  98.2  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.52907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0766  beta-galactosidase  27.59 
 
 		 1012 aa  97.1  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.156765  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0750  beta-galactosidase  27.59 
 
 		 1009 aa  97.4  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0186034  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3909  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  30.29 
 
 		 1600 aa  96.7  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4018  beta-galactosidase  29.21 
 
 		 1059 aa  96.3  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000751059 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2469  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  33.15 
 
 		 1036 aa  91.7  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4065  glycoside hydrolase family protein  31.79 
 
 		 1045 aa  91.3  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.212111  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3269  Beta-galactosidase  27.6 
 
 		 1076 aa  91.7  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00255337 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3118  glycoside hydrolase family protein  29.53 
 
 		 1043 aa  90.9  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2720  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  31.58 
 
 		 1053 aa  89  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119488  Beta-galactosidase, putative  33.54 
 
 		 1164 aa  88.6  9e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.873023  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1013  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  31.43 
 
 		 1033 aa  88.2  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.188379  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4634  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.04 
 
 		 1424 aa  87.4  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.893507  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3614  glycoside hydrolase family protein  33.54 
 
 		 1094 aa  87.4  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0195  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  30.72 
 
 		 1329 aa  86.7  3e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0896  beta-galactosidase  29.7 
 
 		 1017 aa  86.7  3e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1666  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  31.17 
 
 		 1289 aa  86.3  4e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0824  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  40.16 
 
 		 1264 aa  85.5  7e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000954733  decreased coverage  0.00757756 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0534  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  29.35 
 
 		 1013 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1917  beta-D-galactosidase  33.02 
 
 		 1044 aa  84.3  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3187  glycoside hydrolase family protein  27.27 
 
 		 1022 aa  85.1  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0580  glycoside hydrolase family protein  27.57 
 
 		 1077 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  26.59 
 
 		 1019 aa  80.1  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1366  beta-galactosidase  27.27 
 
 		 1026 aa  79.3  0.00000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0729  beta-galactosidase  32.39 
 
 		 1023 aa  79  0.00000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0768617  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2038  Beta-galactosidase  26.92 
 
 		 1046 aa  78.2  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0998  Beta-galactosidase  25.52 
 
 		 1012 aa  78.2  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00145387  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1807  Beta-galactosidase  31.58 
 
 		 1035 aa  77.4  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.489965  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5411  beta-galactosidase  31.33 
 
 		 1008 aa  75.5  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111624  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14320  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  30.14 
 
 		 992 aa  74.3  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0920  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  30.34 
 
 		 1005 aa  75.1  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0700596  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30036  Beta-galactosidase (Lactase)  25.89 
 
 		 1021 aa  74.3  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0855272  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2733  beta-D-galactosidase  31.61 
 
 		 1036 aa  70.9  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000508239  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1316  beta-D-galactosidase  27.7 
 
 		 1036 aa  70.1  0.00000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3719  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  31.34 
 
 		 1004 aa  68.9  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3379  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  30.05 
 
 		 992 aa  68.2  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2019  beta-D-galactosidase  26.86 
 
 		 1035 aa  66.6  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0466092  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0665  beta-galactosidase  25.13 
 
 		 1112 aa  65.5  0.0000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26640  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  25.82 
 
 		 996 aa  65.5  0.0000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0408  beta-D-galactosidase  28.33 
 
 		 1024 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000144327  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3281  beta-D-galactosidase  28.33 
 
 		 1024 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000245928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0368  beta-D-galactosidase  28.33 
 
 		 1024 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000219694  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00302  hypothetical protein  28.33 
 
 		 1024 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000375259  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00298  beta-D-galactosidase  28.33 
 
 		 1024 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000026518  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3262  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.33 
 
 		 1024 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000877394  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0375  beta-D-galactosidase  28.33 
 
 		 1024 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000167859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3917  glycoside hydrolase family protein  28.28 
 
 		 1020 aa  63.2  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0417  beta-D-galactosidase  28.33 
 
 		 1024 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000241482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00275  beta-D-galactosidase  28.18 
 
 		 1041 aa  62.4  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3257  glycoside hydrolase family protein  26.83 
 
 		 1017 aa  59.7  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1261  beta-D-galactosidase  26.2 
 
 		 1032 aa  57  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000337049  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1362  beta-D-galactosidase  28.21 
 
 		 1043 aa  55.5  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00215799  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1768  beta-D-galactosidase  27.27 
 
 		 1043 aa  53.1  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.035592  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0928  beta-D-galactosidase  26.16 
 
 		 1028 aa  53.1  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000620353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1044  beta-D-galactosidase  25.27 
 
 		 1031 aa  52.8  0.000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.230358  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3173  beta-D-galactosidase  23.58 
 
 		 1029 aa  50.1  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00462554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1950  beta-galactosidase  31.87 
 
 		 103 aa  46.6  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0289  glycoside hydrolase family 42 protein  24.65 
 
 		 319 aa  45.8  0.0006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0613274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>