277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_03289 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_03289  hypothetical protein  100 
 
 
199 aa  412  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002695  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazol monophosphate biosynthesis enzyme  85.43 
 
 
199 aa  369  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0941  protein ThiJ  64.1 
 
 
196 aa  263  1e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.963617  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2890  DJ-1 family protein  53.33 
 
 
196 aa  211  7.999999999999999e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1082  DJ-1 family protein  55.21 
 
 
196 aa  206  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000871553 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3249  DJ-1 family protein  51.79 
 
 
196 aa  202  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3107  DJ-1 family protein  51.79 
 
 
196 aa  202  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3069  DJ-1 family protein  51.79 
 
 
196 aa  201  7e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1034  DJ-1 family protein  52.31 
 
 
196 aa  200  9e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.463185  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3081  DJ-1 family protein  51.79 
 
 
198 aa  200  9.999999999999999e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.713776  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3277  DJ-1 family protein  52.04 
 
 
196 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00372  hypothetical protein  51.02 
 
 
196 aa  193  1e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0456  DJ-1 family protein  51.02 
 
 
196 aa  193  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0496  DJ-1 family protein  51.02 
 
 
196 aa  193  1e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0346  DJ-1 family protein  51.02 
 
 
196 aa  193  1e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0508  DJ-1 family protein  50.51 
 
 
196 aa  193  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.44518  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00376  hypothetical protein  51.02 
 
 
196 aa  193  1e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0460  DJ-1 family protein  51.02 
 
 
196 aa  193  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3209  DJ-1 family protein  51.02 
 
 
196 aa  192  3e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000549408 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3185  DJ-1 family protein  51.02 
 
 
196 aa  192  3e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.447101  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0891  DJ-1 family protein  49.24 
 
 
197 aa  187  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.915837  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1895  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  48.68 
 
 
201 aa  177  8e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0535  DJ-1 family protein  50 
 
 
196 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.865123  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0472  DJ-1 family protein  50 
 
 
196 aa  171  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0474  DJ-1 family protein  50 
 
 
196 aa  171  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0493  DJ-1 family protein  50 
 
 
196 aa  171  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0480  DJ-1 family protein  49.49 
 
 
196 aa  170  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.757447  normal  0.338171 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32791  predicted protein  42.63 
 
 
191 aa  136  3.0000000000000003e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4036  DJ-1 family protein  38.92 
 
 
183 aa  129  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1845  putative protease  41.53 
 
 
181 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2034  DJ-1 family protein  37.85 
 
 
184 aa  117  9.999999999999999e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1208  DJ-1 family protein  39.11 
 
 
188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0509  DJ-1 family protein  40 
 
 
185 aa  115  3e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0908  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  35.75 
 
 
189 aa  114  8.999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2566  DJ-1 family protein  37.76 
 
 
192 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.290389  normal  0.0127226 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44270  predicted protein  37.2 
 
 
253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0563651 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0914  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  35.2 
 
 
189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0978  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  35.2 
 
 
189 aa  112  5e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11290  DJ-1 family protein  33.88 
 
 
181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000017657  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0833  DJ-1 family protein  39.78 
 
 
183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.620178  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1215  DJ-1  37.08 
 
 
185 aa  109  3e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1009  DJ-1 family protein  35.68 
 
 
183 aa  108  7.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047613  normal  0.605199 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2019  DJ-1 family protein  35.64 
 
 
184 aa  107  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.236764  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1238  4-methyl-5(beta-hydroxyethyl)-thiazol monophosphate biosynthesis protein-like  43.24 
 
 
189 aa  107  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1780  DJ-1  38.73 
 
 
185 aa  106  3e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1245  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  34.43 
 
 
179 aa  105  3e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0029  DJ-1  38.73 
 
 
184 aa  104  9e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0481  DJ-1 family protein  35.03 
 
 
183 aa  104  1e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.476054  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3290  DJ-1 family protein  38.04 
 
 
184 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0681  DJ-1 family protein  34.07 
 
 
203 aa  102  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.728078  normal  0.0428535 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0523  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  34.07 
 
 
203 aa  102  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.017348  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1101  DJ-1 family protein  33.33 
 
 
182 aa  102  4e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2119  metal dependent phosphohydrolase  33.72 
 
 
388 aa  100  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0158071  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0894  4-methyl-5(beta-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate synthesis protein  31.64 
 
 
188 aa  99  4e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.022908  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0803  DJ-1 family protein  36.21 
 
 
182 aa  97.1  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0966  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  34.97 
 
 
182 aa  95.5  4e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000883438  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1057  DJ-1 family protein  30.98 
 
 
183 aa  95.1  6e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000197778  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1118  DJ-1 family protein  30.48 
 
 
190 aa  95.1  6e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2324  DJ-1 family protein  32.61 
 
 
191 aa  94.7  7e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0174784  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0640  putative 4-methyl-5(b-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  31.18 
 
 
184 aa  94.7  8e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00127997  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0371  DJ-1 family protein  37.08 
 
 
181 aa  94.4  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00995133  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2038  DJ-1 family protein  34.05 
 
 
191 aa  93.6  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4895  DJ-1  34.95 
 
 
183 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0634  ThiJ/PfpI family protein  33.52 
 
 
181 aa  92.4  4e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.403728 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3874  DJ-1 family protein  34.64 
 
 
183 aa  91.7  6e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0623  DJ-1 family protein  37.5 
 
 
182 aa  90.9  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.226753  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1633  protein ThiJ  32.18 
 
 
182 aa  90.1  2e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2774  DJ-1 family protein  37.79 
 
 
202 aa  90.5  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1523  DJ-1 family protein  31.95 
 
 
190 aa  89.7  3e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2354  DJ-1 family protein  32.26 
 
 
184 aa  89  5e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0457203  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0510  DJ-1 family protein  32.61 
 
 
182 aa  88.6  6e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.000981591  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4150  ThiJ/PfpI domain protein  31.25 
 
 
191 aa  86.7  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0083  ThiJ/PfpI domain protein  31.82 
 
 
195 aa  85.5  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4431  ThiJ/PfpI domain protein  30.11 
 
 
191 aa  83.2  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0326  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  31.36 
 
 
194 aa  84  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000260198  hitchhiker  6.98835e-17 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0065  ThiJ/PfpI domain protein  28.98 
 
 
191 aa  80.9  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0946  DJ-1 family protein  33.71 
 
 
187 aa  80.9  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.892246  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1314  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.86 
 
 
185 aa  78.2  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  2.02067e-17 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2085  ThiJ/PfpI domain protein  30.86 
 
 
185 aa  78.2  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000308575 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2146  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.29 
 
 
185 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  6.21104e-22 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0292  DJ-1 family protein  27.27 
 
 
194 aa  77  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00553138  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1190  ThiJ/PfpI domain protein  30.86 
 
 
185 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00457983  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2477  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.06 
 
 
185 aa  73.2  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2091  ThiJ/PfpI domain protein  29.59 
 
 
180 aa  72.4  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.616699  hitchhiker  3.51942e-22 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl263  putative intracellular protease/amidase  26.34 
 
 
181 aa  70.1  0.00000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  1.04249e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0981  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.98 
 
 
192 aa  70.1  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3363  ThiJ/PfpI-family thiamine biogenesis protein  27.98 
 
 
192 aa  70.5  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0928  DJ-1/PfpI family protein  27.98 
 
 
192 aa  69.7  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2570  protease I  30.06 
 
 
189 aa  63.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0843  ThiJ/PfpI domain protein  29.14 
 
 
183 aa  63.5  0.000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0031  ThiJ/PfpI  29.71 
 
 
174 aa  62.4  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0832  DJ-1 family protein  28.74 
 
 
180 aa  62.8  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0233882 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5375  PfpI family intracellular peptidase  30.22 
 
 
192 aa  62  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.130352 
 
 
-
 
NC_002936  DET0118  DJ-1 family protein  27.71 
 
 
180 aa  61.6  0.000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0160  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.84 
 
 
175 aa  61.6  0.000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0251  DJ-1 family protein  27.71 
 
 
180 aa  60.8  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_127  DJ-1, 4-methyl-5(b-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  27.71 
 
 
180 aa  60.5  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1981  intracellular protease, PfpI family  29.27 
 
 
187 aa  59.7  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1228  PfpI family intracellular peptidase  28.73 
 
 
189 aa  58.9  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1815  intracellular protease, PfpI family  30.98 
 
 
190 aa  58.2  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>