154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_03258 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002720  chitinase  84.91 
 
 		 848 aa  1504    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.548595  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0757  endochitinase ChiA  64.18 
 
 		 846 aa  1147    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1540  chitinase  72.16 
 
 		 846 aa  1266    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.987868  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03258  chitinase  100 
 
 		 846 aa  1717    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1704  glycosyl hydrolase family chitinase  69.81 
 
 		 543 aa  465  1e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.861913 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  34.63 
 
 		 1362 aa  232  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1919  Chitinase-like protein  37.44 
 
 		 680 aa  223  8e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3571  extracellular exochitinase Chi36  42.12 
 
 		 360 aa  219  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.297633  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3469  chitinase  42.12 
 
 		 360 aa  219  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3854  extracellular exochitinase Chi36  42.12 
 
 		 360 aa  219  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.063231  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3483  chitinase  41.82 
 
 		 360 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.219436  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3775  extracellular exochitinase Chi36  42.25 
 
 		 360 aa  209  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000559542  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3490  glycoside hydrolase family protein  41.52 
 
 		 360 aa  208  4e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.678093  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3753  extracellular exochitinase Chi36  42.12 
 
 		 360 aa  207  5e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.007807  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3824  extracellular exochitinase Chi36  41.52 
 
 		 360 aa  204  6e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0158065  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1478  extracellular exochitinase Chi36  41.52 
 
 		 360 aa  204  8e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.17366  hitchhiker  0.000283046 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  34.97 
 
 		 1152 aa  200  7.999999999999999e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1799  glycoside hydrolase family protein  35.26 
 
 		 551 aa  195  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000760023  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1220  Carbohydrate-binding CenC domain protein  35.4 
 
 		 510 aa  182  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  30.51 
 
 		 1578 aa  179  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4053  glycoside hydrolase family 18  36.31 
 
 		 376 aa  177  7e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0226392 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05945  chitinase  44.71 
 
 		 1053 aa  176  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0638  chitodextrinase  40.48 
 
 		 1051 aa  169  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05607  hypothetical protein  29.78 
 
 		 962 aa  169  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3770  glycoside hydrolase family 18  33.33 
 
 		 420 aa  167  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0735  glycoside hydrolase family 18  33.23 
 
 		 341 aa  162  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000210  chitodextrinase precursor  39.06 
 
 		 1054 aa  160  8e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0800752  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5990  Carbohydrate-binding CenC domain protein  28.49 
 
 		 648 aa  160  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.793128  normal  0.422272 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2965  cellulose-binding family II protein  33.33 
 
 		 468 aa  153  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1917  Chitinase-like protein  32.57 
 
 		 613 aa  150  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1860  glycoside hydrolase family 18  36.43 
 
 		 1127 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686097  hitchhiker  0.0000000988456 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2604  glycoside hydrolase family protein  36.06 
 
 		 1127 aa  145  4e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488265  hitchhiker  0.00483231 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2491  glycoside hydrolase family 18  34.94 
 
 		 1127 aa  144  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2484  glycoside hydrolase family protein  34.94 
 
 		 1127 aa  139  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1184  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3186  cellulose-binding family II protein  32.39 
 
 		 467 aa  134  6e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151543 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1458  glycosyl hydrolase family chitinase  33.2 
 
 		 460 aa  133  1.0000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0638  PKD domain-containing protein  29.7 
 
 		 1285 aa  128  4.0000000000000003e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2205  glycosyl hydrolase family chitinase  29.31 
 
 		 492 aa  123  9.999999999999999e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2719  glycoside hydrolase family protein  33.46 
 
 		 1129 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716218  hitchhiker  0.00441293 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0682  putative Ig  38.78 
 
 		 1123 aa  116  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.929764  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05656  chitinase  28.98 
 
 		 565 aa  113  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  32.71 
 
 		 703 aa  113  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7432  Chitinase-like protein  30.99 
 
 		 516 aa  110  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.894433 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1121  hypothetical protein  28.85 
 
 		 782 aa  110  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3736  chitinase D  45.12 
 
 		 174 aa  109  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.61469e-18 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00548  chitinase  29.6 
 
 		 729 aa  109  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05899  chitinase  29.6 
 
 		 729 aa  109  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0693  glycoside hydrolase family protein  28.25 
 
 		 471 aa  109  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1117  hypothetical protein  27.32 
 
 		 782 aa  109  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2399  hypothetical protein  28.97 
 
 		 1406 aa  108  4e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3655  glycoside hydrolase family protein  28.21 
 
 		 727 aa  108  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3982  glycosyl hydrolase family chitinase  25.91 
 
 		 1146 aa  107  6e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4085  chitinase A  27.97 
 
 		 699 aa  107  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  28.37 
 
 		 1096 aa  105  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  28.95 
 
 		 1219 aa  105  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0611  glycosy hydrolase family protein  27.62 
 
 		 471 aa  105  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4225  Carbohydrate-binding CenC domain protein  30.24 
 
 		 551 aa  103  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0637754 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3735  extracellular exochitinase Chi36  44.44 
 
 		 189 aa  103  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.72466e-18 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34870  chitinase  27.96 
 
 		 483 aa  98.6  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0143949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2949  chitinase  28 
 
 		 483 aa  98.6  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0400  chitinase  27.95 
 
 		 598 aa  95.9  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000106126  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4407  hypothetical protein  40.43 
 
 		 245 aa  95.5  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1223  glycoside hydrolase family protein  25.73 
 
 		 484 aa  94  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0824686  normal  0.0476273 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2328  fibronectin, type III domain-containing protein  30.84 
 
 		 675 aa  93.2  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000140812  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  31 
 
 		 1059 aa  92  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3568  glycosyl hydrolase family chitinase  25.07 
 
 		 353 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  38.14 
 
 		 1047 aa  85.9  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4777  glycoside hydrolase family 18 protein  25.65 
 
 		 803 aa  85.9  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.202282  normal  0.127676 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0591  putative chitinase  32.48 
 
 		 306 aa  83.6  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  27.03 
 
 		 816 aa  83.2  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  29.63 
 
 		 1224 aa  81.6  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2327  fibronectin, type III domain-containing protein  38.42 
 
 		 482 aa  79.7  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00610541  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  28.44 
 
 		 1057 aa  79.3  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  35.81 
 
 		 792 aa  77  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2445  fibronectin, type III domain-containing protein  37.57 
 
 		 499 aa  73.6  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.628775  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1569  helix-turn-helix, AraC type  49.09 
 
 		 1113 aa  71.6  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  27.98 
 
 		 1141 aa  71.6  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2223  peptidase-like protein  36.09 
 
 		 343 aa  70.5  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05170  hypothetical protein  28 
 
 		 1204 aa  70.9  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  41.49 
 
 		 984 aa  69.7  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3892  hypothetical protein  47.62 
 
 		 550 aa  69.7  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0718789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  39.25 
 
 		 915 aa  69.7  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  40.91 
 
 		 1132 aa  68.2  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2327  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  26.03 
 
 		 12684 aa  66.6  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  31.89 
 
 		 14944 aa  66.6  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1472  Chitinase  45.45 
 
 		 540 aa  65.5  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  46.51 
 
 		 1444 aa  65.5  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3802  protease  43.68 
 
 		 778 aa  64.7  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.239343 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2167  glycoside hydrolase family 48  44.32 
 
 		 974 aa  64.7  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0241  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.94 
 
 		 1143 aa  64.7  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000382571  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl347  chitinase  27.06 
 
 		 1113 aa  63.5  0.00000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135445  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  40.43 
 
 		 979 aa  61.2  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  40.5 
 
 		 767 aa  60.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.3 
 
 		 699 aa  60.5  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0749  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.44 
 
 		 587 aa  58.2  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0201  chitinase like protein  39.47 
 
 		 1204 aa  57.8  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.137759 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  29.84 
 
 		 972 aa  57.4  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5511  hypothetical protein  38.3 
 
 		 1452 aa  57.4  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0791  hypothetical protein  41.56 
 
 		 692 aa  56.2  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.195904  normal  0.0459938 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  37.74 
 
 		 991 aa  56.6  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>