75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_03248 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1388  putative ion transporter  91.75 
 
 		 530 aa  924    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.158074  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0156  AbgT putative transporter  76.54 
 
 		 538 aa  771    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.632237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03248  hypothetical protein  100 
 
 		 522 aa  1040    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4057  AbgT putative transporter  77.59 
 
 		 539 aa  777    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.106368  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4058  AbgT putative transporter  77.06 
 
 		 539 aa  772    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000746135  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4381  AbgT putative transporter  75.44 
 
 		 540 aa  741    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4247  AbgT putative transporter  75.05 
 
 		 540 aa  740    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0134  AbgT putative transporter  76.91 
 
 		 538 aa  769    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.722786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2198  AbgT putative transporter  69.23 
 
 		 534 aa  682    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00653  putative p-aminobenzoyl-glutamate transport protein (AbgT family)  73.74 
 
 		 525 aa  730    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0404  hypothetical protein  88.12 
 
 		 534 aa  885    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000189157  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0094  AbgT putative transporter  76.32 
 
 		 511 aa  739    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3654  AbgT putative transporter  75.19 
 
 		 537 aa  783    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3559  putative efflux pump component MtrF  75.05 
 
 		 535 aa  774    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4042  AbgT putative transporter  74.52 
 
 		 535 aa  746    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4208  AbgT putative transporter  75.05 
 
 		 540 aa  741    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3988  AbgT putative transporter  72.85 
 
 		 532 aa  728    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.025023  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3926  AbgT putative transporter  75.1 
 
 		 535 aa  750    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002729  multidrug efflux pump component MtrF  95.4 
 
 		 528 aa  959    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.189489  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3833  AbgT putative transporter  74.33 
 
 		 535 aa  746    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0028  AbgT putative transporter  52.53 
 
 		 512 aa  496  1e-139  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.790153  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0064  AbgT putative transporter  48.05 
 
 		 518 aa  462  1e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000877421  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2328  efflux pump component MtrF  47.33 
 
 		 516 aa  454  1.0000000000000001e-126  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.25696  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0389  hypothetical protein  43.7 
 
 		 519 aa  426  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0739  putative ion transporter  43.02 
 
 		 519 aa  424  1e-117  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01141  hypothetical protein  42.72 
 
 		 519 aa  424  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004283  putative p-aminobenzoyl-glutamate transporter  43.68 
 
 		 519 aa  422  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3423  transporter  43.73 
 
 		 515 aa  419  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.898769 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1944  AbgT putative transporter  43.68 
 
 		 519 aa  416  9.999999999999999e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.432903  decreased coverage  0.00626673 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3673  AbgT putative transporter  43.05 
 
 		 518 aa  409  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3120  AbgT putative transporter  43.19 
 
 		 520 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3449  transporter  42.72 
 
 		 512 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0018  AbgT putative transporter  40.76 
 
 		 511 aa  401  9.999999999999999e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1352  AbgT putative transporter  42.88 
 
 		 519 aa  397  1e-109  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000127247  normal  0.0238452 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0160  transporter, putative  43.4 
 
 		 519 aa  391  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0146  AbgT putative transporter  43.7 
 
 		 519 aa  389  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0151  AbgT putative transporter  43.64 
 
 		 519 aa  387  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0146  AbgT putative transporter  43.64 
 
 		 519 aa  386  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0147  AbgT putative transporter  41.84 
 
 		 519 aa  384  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0537  AbgT putative transporter  44.42 
 
 		 529 aa  382  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.121882  normal  0.78057 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0029  AbgT putative transporter  41.78 
 
 		 506 aa  362  1e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13432  normal  0.390829 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5237  AbgT putative transporter  37.6 
 
 		 514 aa  352  1e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2550  AbgT putative transporter  36.42 
 
 		 512 aa  350  2e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2500  AbgT putative transporter  36.42 
 
 		 512 aa  350  2e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.393167  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0518  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  37.74 
 
 		 507 aa  340  4e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1548  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  38.88 
 
 		 508 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1452  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  38.88 
 
 		 508 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01313  predicted cryptic aminobenzoyl-glutamate transporter  38.88 
 
 		 508 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2308  AbgT transporter family  38.88 
 
 		 508 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950001  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01323  hypothetical protein  38.88 
 
 		 508 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2289  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  38.88 
 
 		 508 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1786  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  39.2 
 
 		 510 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1983  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  38.88 
 
 		 510 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.328307 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0167  AbgT putative transporter  34.75 
 
 		 520 aa  336  5e-91  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.583779  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4202  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  37.1 
 
 		 508 aa  333  5e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.609868  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0400  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  38.88 
 
 		 505 aa  326  7e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.703061  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21460  putative p-aminobenzoyl-glutamate transporter  38.76 
 
 		 585 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1508  AbgT putative transporter  37.43 
 
 		 523 aa  316  6e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.693891  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0748  AbgT putative transporter  36.12 
 
 		 518 aa  302  9e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.534677  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0678  AbgT family protein  36.12 
 
 		 518 aa  301  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0800  putative efflux pump component MtrF  33.98 
 
 		 509 aa  301  1e-80  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2611  AbgT putative transporter  34.73 
 
 		 552 aa  279  9e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1579  aminobenzoyl-glutamate transport protein  39.53 
 
 		 305 aa  202  8e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1577  putative efflux pump component MtrF  36.82 
 
 		 263 aa  140  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01760  hypothetical protein  22.22 
 
 		 500 aa  50.4  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1143  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  24.79 
 
 		 484 aa  49.7  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.171784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3467  hypothetical protein  45.76 
 
 		 240 aa  49.7  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0456304 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1145  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  23.55 
 
 		 464 aa  48.9  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.400945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0766  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  24.73 
 
 		 477 aa  48.5  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.607983  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2982  short chain fatty acid transporter  27.35 
 
 		 442 aa  47.8  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2886  short chain fatty acid transporter  27.35 
 
 		 442 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2803  short chain fatty acid transporter  27.35 
 
 		 442 aa  44.3  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1391  Short-chain fatty acid transporter  26.24 
 
 		 443 aa  44.3  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2668  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  38.46 
 
 		 460 aa  43.9  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3088  short chain fatty acid transporter  25.84 
 
 		 436 aa  43.5  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>