175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_03212 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_03212  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  524  1e-148  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002771  SAM-dependent methyltransferase  91.9 
 
 		 248 aa  485  1e-136  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.531144  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1827  hypothetical protein  76.35 
 
 		 245 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2400  hypothetical protein  62.66 
 
 		 247 aa  326  2.0000000000000001e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0910  methyltransferase type 11  43.7 
 
 		 239 aa  204  9e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2000  hypothetical protein  41.84 
 
 		 257 aa  201  9e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3137  Methyltransferase type 11  42.4 
 
 		 236 aa  199  5e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1008  Methyltransferase type 11  43.97 
 
 		 239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.30893  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1142  Methyltransferase type 11  42.8 
 
 		 236 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0306  putative methyltransferase  45.41 
 
 		 240 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0922381  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0287  putative methyltransferase  45.41 
 
 		 240 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.368037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0292  putative methyltransferase  45.41 
 
 		 240 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.607126 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0300  putative methyltransferase  45.41 
 
 		 240 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0285  putative methyltransferase  45.41 
 
 		 240 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2840  Methyltransferase type 11  43.1 
 
 		 239 aa  191  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1107  methyltransferase type 11  44.5 
 
 		 239 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1053  putative methyltransferase  44.5 
 
 		 239 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.600444  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2684  hypothetical protein  44.5 
 
 		 239 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0282263 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3395  Methyltransferase type 11  44.95 
 
 		 240 aa  188  7e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1896  hypothetical protein  41.87 
 
 		 249 aa  187  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00295537  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00206  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  44.5 
 
 		 240 aa  186  3e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00211  hypothetical protein  44.5 
 
 		 240 aa  186  3e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0228  putative methyltransferase  44.5 
 
 		 240 aa  186  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0178403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3452  methyltransferase type 11  44.5 
 
 		 240 aa  186  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.607443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0747  methyltransferase type 11  43.12 
 
 		 238 aa  186  3e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.955559  normal  0.418524 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0210  putative methyltransferase  44.5 
 
 		 240 aa  186  3e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0217  putative methyltransferase  44.5 
 
 		 240 aa  186  4e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00136304  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0220  putative methyltransferase  44.04 
 
 		 240 aa  184  9e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.960094  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0226  putative methyltransferase  44.04 
 
 		 240 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.306208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2160  methyltransferase type 11  40.62 
 
 		 244 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000564941  normal  0.0553209 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2237  methyltransferase type 11  40.62 
 
 		 240 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000104202  normal  0.497411 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2368  methyltransferase type 11  39.73 
 
 		 244 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000132187  normal  0.0100279 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2020  methyltransferase type 11  40.65 
 
 		 239 aa  177  1e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00106429  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1883  hypothetical protein  37.93 
 
 		 240 aa  177  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0021884  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2562  hypothetical protein  39.29 
 
 		 244 aa  176  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2326  Methyltransferase type 11  40.37 
 
 		 245 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000175678  decreased coverage  0.0000300845 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1997  methyltransferase type 11  40.37 
 
 		 245 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00149539  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2012  methyltransferase type 11  40.37 
 
 		 245 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000922882  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2060  methyltransferase type 11  40.37 
 
 		 245 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000118598  decreased coverage  0.0000900538 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01982  SAM-dependent methyltransferase  33.1 
 
 		 297 aa  168  6e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0899928  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2405  methyltransferase type 11  38.81 
 
 		 246 aa  167  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000054143  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1777  methyltransferase type 11  39.45 
 
 		 244 aa  165  8e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000020952  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2206  methyltransferase type 11  37 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0553658  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2113  hypothetical protein  39.81 
 
 		 240 aa  159  5e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00159353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0497  methyltransferase type 11  32.67 
 
 		 246 aa  157  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00659645  normal  0.142728 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1990  hypothetical protein  38.74 
 
 		 244 aa  157  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000251541  hitchhiker  0.00000167474 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2610  hypothetical protein  39.81 
 
 		 248 aa  154  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000632095  normal  0.867129 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0954  Methyltransferase type 11  36.2 
 
 		 260 aa  132  6e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2816  generic methyl-transferase  34.2 
 
 		 256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2290  hypothetical protein  32.34 
 
 		 241 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.272643  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1594  generic methyl-transferase  33.33 
 
 		 238 aa  118  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1620  generic methyl-transferase  29.52 
 
 		 259 aa  112  8.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.152762  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1463  hypothetical protein  31.44 
 
 		 233 aa  105  9e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0975839  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1480  methyltransferase type 11  31.74 
 
 		 240 aa  104  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00449789  normal  0.133133 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1974  Methyltransferase type 11  31.9 
 
 		 252 aa  102  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1744  methyltransferase type 11  31.9 
 
 		 259 aa  102  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0973939 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2280  hypothetical protein  27.65 
 
 		 278 aa  101  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2022  generic methyl-transferase  29.41 
 
 		 294 aa  99  6e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0842  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 272 aa  99  7e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1664  methyl-transferase  28.89 
 
 		 245 aa  98.2  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.8813 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1023  methyltransferase type 11  31.22 
 
 		 272 aa  96.7  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.386932  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2040  Methyltransferase type 11  33.87 
 
 		 262 aa  96.3  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1679  methyltransferase type 11  29.03 
 
 		 273 aa  96.7  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.822935 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1732  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 262 aa  96.3  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0169099  normal  0.614838 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1535  methyltransferase type 11  30.17 
 
 		 269 aa  95.9  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11733  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2789  hypothetical protein  28.05 
 
 		 270 aa  94.7  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00141234  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1514  hypothetical protein  33.33 
 
 		 257 aa  94  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0764  hypothetical protein  28.05 
 
 		 270 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1601  hypothetical protein  28.05 
 
 		 270 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1163  methyltransferase type 11  29.39 
 
 		 270 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0143221  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1274  hypothetical protein  28.05 
 
 		 270 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.199636  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0595  hypothetical protein  28.05 
 
 		 270 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1467  hypothetical protein  28.05 
 
 		 270 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.406889  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1497  hypothetical protein  28.05 
 
 		 270 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0557  hypothetical protein  28.05 
 
 		 270 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1175  methyltransferase type 11  28.88 
 
 		 270 aa  93.2  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000783857  normal  0.143083 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4428  hypothetical protein  28.1 
 
 		 270 aa  93.2  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000816138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0808  SAM-dependent methyltransferase  27.91 
 
 		 241 aa  92.4  6e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0592  methyltransferase type 11  30.53 
 
 		 274 aa  92.4  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1257  methyltransferase type 11  27.73 
 
 		 270 aa  92.4  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00176824  normal  0.197818 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0805  methyltransferase type 11  27.73 
 
 		 270 aa  92  9e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.835113  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1286  methyltransferase type 11  27.73 
 
 		 270 aa  92  9e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00312409  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2652  methyltransferase type 11  33.12 
 
 		 251 aa  91.7  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714866 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2207  methyltransferase type 11  27.95 
 
 		 264 aa  90.9  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000439917  normal  0.236721 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2339  Methyltransferase type 11  28.44 
 
 		 251 aa  91.3  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.560895  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0869  methyltransferase type 11  29.2 
 
 		 271 aa  89.7  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292642  normal  0.353512 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2872  Methyltransferase type 11  29.13 
 
 		 287 aa  89  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00483361  normal  0.354275 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1703  SAM-dependent methyltransferase  25.53 
 
 		 246 aa  88.2  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.112357  normal  0.713631 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1252  hypothetical protein  28.24 
 
 		 289 aa  87.4  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2034  methyltransferase type 11  26.42 
 
 		 270 aa  87.8  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0620207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2185  hypothetical protein  29.03 
 
 		 252 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0927  hypothetical protein  28.57 
 
 		 261 aa  85.1  9e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29610  hypothetical protein  28.45 
 
 		 254 aa  83.6  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.47028  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4896  methyltransferase type 11  30.62 
 
 		 245 aa  83.2  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1943  methyltransferase type 11  28.64 
 
 		 266 aa  82.4  0.000000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3468  hypothetical protein  28.57 
 
 		 257 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3713  hypothetical protein  30.73 
 
 		 253 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.13678  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1762  hypothetical protein  29.41 
 
 		 253 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.479103  normal  0.934306 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1971  hypothetical protein  28.76 
 
 		 273 aa  81.6  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.536207 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1764  methyltransferase  28.16 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>