135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_03160 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_03160  flagellar assembly protein H  100 
 
 
266 aa  546  1e-154  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002817  flagellar assembly protein FliH  94.36 
 
 
266 aa  501  1e-141  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1715  flagellar assembly protein H  69.92 
 
 
270 aa  390  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2306  flagellar assembly protein H  49.25 
 
 
265 aa  278  9e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02887  flagellar assembly protein H  34.58 
 
 
260 aa  151  8.999999999999999e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1504  flagellar assembly protein H  34.84 
 
 
262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1344  flagellar assembly protein H  31.95 
 
 
320 aa  142  4e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.388859 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3045  flagellar assembly protein H  31.93 
 
 
266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1368  flagellar assembly protein FliH  32.58 
 
 
339 aa  139  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.981358 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2295  flagellar assembly protein H  30.28 
 
 
300 aa  139  7e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1620  flagellar assembly protein FliH  33.2 
 
 
324 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1351  flagellar assembly protein H  31.43 
 
 
316 aa  137  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.143361  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3064  flagellar assembly protein FliH  34.17 
 
 
334 aa  138  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1284  flagellar assembly protein H  31.43 
 
 
316 aa  137  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1363  flagellar assembly protein FliH  31.97 
 
 
316 aa  135  5e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2574  flagellar assembly protein H  30.36 
 
 
318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.412103  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3226  flagellar assembly protein H  30.77 
 
 
316 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1439  flagellar assembly protein H  28.96 
 
 
338 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2924  flagellar assembly protein H  28.96 
 
 
338 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2934  flagellar assembly protein H  28.96 
 
 
338 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3066  flagellar assembly protein H  28.96 
 
 
338 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.934094 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1184  flagellar assembly protein H  29.05 
 
 
403 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1326  flagellar assembly protein H  33.47 
 
 
375 aa  122  7e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0711  flagellar assembly protein FliH  29.84 
 
 
295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.487054 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1995  flagellar assembly protein FliH  27.27 
 
 
296 aa  92.4  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2357  flagellar assembly protein FliH  30.12 
 
 
243 aa  91.7  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0075  flagellar assembly protein H  29.02 
 
 
252 aa  90.5  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1967  flagellar assembly protein FliH  27.5 
 
 
242 aa  88.2  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.147072  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3474  flagellar assembly protein H  31.87 
 
 
235 aa  88.2  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0081  flagellar assembly protein H  29.73 
 
 
251 aa  87  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3657  flagellar assembly protein H  32.42 
 
 
235 aa  85.9  6e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5099  flagellar assembly protein H  28.95 
 
 
255 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.484808  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3977  flagellar assembly protein H  30.77 
 
 
236 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0496  flagellar assembly protein FliH  27.59 
 
 
307 aa  83.2  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24210  Flagellar assembly protein  29.31 
 
 
245 aa  82  0.000000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0165568  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0232  flagellar assembly protein H  24.47 
 
 
238 aa  80.5  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.310336 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0713  flagellar assembly protein H  24.47 
 
 
238 aa  80.9  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2902  flagellar assembly protein FliH  32.1 
 
 
201 aa  80.5  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5263  flagellar assembly protein H  30.73 
 
 
278 aa  79.7  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16543  normal  0.0759214 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1347  flagellar assembly protein FliH  28.36 
 
 
251 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0633  flagellar assembly protein H  24.88 
 
 
238 aa  78.2  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001188  flagellar assembly protein FliH  24.87 
 
 
251 aa  77.4  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1500  flagellar assembly protein H  25.87 
 
 
264 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1160  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  26.9 
 
 
233 aa  76.3  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00966123 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3928  flagellar assembly protein H  25.87 
 
 
260 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4268  flagellar assembly protein H  23.77 
 
 
267 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4367  flagellar assembly protein H  24.88 
 
 
263 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.631289 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2823  flagellar assembly protein H  25.69 
 
 
266 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.283065  normal  0.0158669 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1722  polar flagellar assembly protein FliH  25.77 
 
 
212 aa  73.6  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1957  flagellar assembly protein FliH  23.98 
 
 
252 aa  72.4  0.000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.253082  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3692  flagellar assembly protein H  25.64 
 
 
254 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.438422  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1722  polar flagellar assembly protein FliH  25 
 
 
212 aa  71.6  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50110  flagellar assembly protein H  22.04 
 
 
268 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00973712 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4415  flagellar assembly protein H  21.55 
 
 
230 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.127482 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04975  flagellar assembly protein H  26.32 
 
 
224 aa  70.1  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0164  flagellar assembly protein H  27.46 
 
 
227 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2186  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like  24.58 
 
 
349 aa  69.3  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1542  flagellar assembly protein FliH  26.92 
 
 
231 aa  69.3  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1889  flagellar assembly protein H  24.78 
 
 
240 aa  68.2  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0252  flagellar assembly protein H  27.08 
 
 
236 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2577  flagellar assembly protein H  23.48 
 
 
241 aa  67  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11533  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1440  flagellar assembly protein FliH  27.27 
 
 
276 aa  67  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1976  flagellar assembly protein FliH  22.77 
 
 
226 aa  67  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0392  flagellar assembly protein H  27.91 
 
 
248 aa  66.2  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0225  flagellar assembly protein H  25.67 
 
 
242 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3380  flagellar assembly protein H  26.56 
 
 
236 aa  65.5  0.0000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.972464  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0771  flagellar assembly protein FliH  25.45 
 
 
231 aa  65.1  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.24197  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1602  flagellar assembly protein FliH  26.57 
 
 
209 aa  65.5  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1538  flagellar assembly protein H  26.18 
 
 
268 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3772  flagellar assembly protein H  26.63 
 
 
227 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.939362 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4729  flagellar assembly protein H  26.83 
 
 
245 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.249746  normal  0.0365414 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3652  flagellar assembly protein H  26.83 
 
 
245 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.526766 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0567  flagellar biosynthesis protein  25.79 
 
 
268 aa  62.4  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448203  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3446  flagellar assembly protein FliH  24.8 
 
 
268 aa  61.6  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2292  flagellar assembly protein H  22.02 
 
 
238 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0640  flagellar assembly protein FliH  24.07 
 
 
303 aa  61.2  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2012  flagellar assembly protein H  22.02 
 
 
238 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2393  flagellar assembly protein H  22.02 
 
 
238 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0211939  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1574  flagellar assembly protein H  25.7 
 
 
251 aa  60.1  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2040  flagellar assembly protein H  25.63 
 
 
228 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3111  flagellar assembly protein H  26.16 
 
 
227 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.33418  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2977  flagellar assembly protein H  27.17 
 
 
227 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.575281 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00979  flagellar assembly protein FliH  25.3 
 
 
206 aa  58.9  0.00000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.360201  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06187  flagellar assembly protein FliH  25.3 
 
 
206 aa  58.9  0.00000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00312706  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0173  flagellar assembly protein H  23.53 
 
 
241 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2531  flagellar assembly protein H  26.67 
 
 
236 aa  58.9  0.00000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0198  flagellar assembly protein H  25.62 
 
 
207 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2933  flagellar assembly protein H  24.61 
 
 
225 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1878  flagellar assembly protein FliH  24.85 
 
 
213 aa  58.5  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.479163  normal  0.528624 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1090  flagellar assembly protein FliH  25.31 
 
 
201 aa  57.8  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.486271 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0435  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  24.62 
 
 
260 aa  57.8  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00322204  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3279  flagellar assembly protein H  25.64 
 
 
226 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2944  flagellar assembly protein H  25.64 
 
 
226 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.122685  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2144  flagellar assembly protein H  25.64 
 
 
226 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0232  flagellar assembly protein H  25.64 
 
 
226 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0216224  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3402  flagellar assembly protein H  25.64 
 
 
226 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3455  flagellar assembly protein H  23.44 
 
 
272 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0415  flagellar assembly protein H  25.64 
 
 
226 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.359601  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6415  flagellar assembly protein H  26.59 
 
 
227 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.491071 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1702  flagellar assembly protein H  26.13 
 
 
228 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0145817 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>