More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_03032 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_03032  peptidase  100 
 
 		 331 aa  679    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0567  peptidase M48 Ste24p  31.89 
 
 		 333 aa  186  5e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0378  peptidase M48 Ste24p  30 
 
 		 345 aa  166  4e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0429  peptidase M48 Ste24p  29.62 
 
 		 345 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3622  peptidase M48 Ste24p  35.64 
 
 		 383 aa  145  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3535  M48 family peptidase  29.32 
 
 		 348 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3664  peptidase M48 Ste24p  29.32 
 
 		 348 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0872  M48 family peptidase  29.32 
 
 		 348 aa  137  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1120  peptidase M48 Ste24p  30.14 
 
 		 354 aa  137  4e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597091  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0537  peptidase M48 Ste24p  37.62 
 
 		 364 aa  133  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.426689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0581  peptidase M48 Ste24p  37.13 
 
 		 361 aa  132  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.380263 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2917  peptidase M48, Ste24p  30.07 
 
 		 335 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.154407  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3686  peptidase M48 Ste24p  35.64 
 
 		 383 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1147  peptidase M48 Ste24p  28.15 
 
 		 363 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0388  peptidase M48 Ste24p  30.72 
 
 		 349 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0132188  normal  0.117009 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1953  peptidase M48, Ste24p  27.96 
 
 		 367 aa  128  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0119619  normal  0.0677006 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3534  peptidase M48, Ste24p  34.26 
 
 		 383 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4143  peptidase M48, Ste24p  30.39 
 
 		 347 aa  125  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.724866  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0642  peptidase M48, Ste24p  33.46 
 
 		 347 aa  123  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2801  peptidase M48, Ste24p  31.56 
 
 		 341 aa  123  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.57827 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2660  peptidase M48 Ste24p  33.21 
 
 		 395 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.110854 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0644  putative transmembrane protein  37.44 
 
 		 358 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0514  peptidase M48 Ste24p  28.57 
 
 		 343 aa  117  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0802067  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0326  peptidase M48 Ste24p  29.97 
 
 		 353 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.988889  normal  0.269331 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0258  peptidase M48, Ste24p  26.25 
 
 		 352 aa  116  6e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00863149  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2077  putative Zn-dependent protease  32.86 
 
 		 336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0462  M48 family peptidase  31.2 
 
 		 357 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169095  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3721  peptidase M48, Ste24p  28.77 
 
 		 377 aa  109  7.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0533853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3004  peptidase M48 Ste24p  28.77 
 
 		 374 aa  109  8.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.558677  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0790  peptidase M48, Ste24p  29.46 
 
 		 444 aa  107  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.534887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0096  peptidase M48, Ste24p  28.49 
 
 		 348 aa  105  9e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.220235  normal  0.168407 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2182  peptidase M48, Ste24p  28.27 
 
 		 349 aa  102  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1893  peptidase M48, Ste24p  30.24 
 
 		 398 aa  95.5  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.118004 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2290  peptidase M48 Ste24p  30.3 
 
 		 378 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.323007 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2014  peptidase M48 Ste24p  29.87 
 
 		 378 aa  92.4  9e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.700955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6656  putative metalloendopeptidase  27.74 
 
 		 383 aa  91.3  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3237  peptidase M48 Ste24p  28.38 
 
 		 378 aa  89.4  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3470  peptidase M48 Ste24p  29.19 
 
 		 343 aa  88.6  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2155  peptidase M48, Ste24p  29.13 
 
 		 327 aa  86.3  6e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1042  peptidase M48 Ste24p  30.58 
 
 		 489 aa  86.3  7e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5225  peptidase M48 Ste24p  28.51 
 
 		 358 aa  85.5  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.32225 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1976  peptidase M48 Ste24p  29.35 
 
 		 373 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88766  normal  0.175052 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1046  peptidase M48 Ste24p  31.94 
 
 		 489 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.615139  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  29.95 
 
 		 424 aa  83.6  0.000000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0072  peptidase M48 Ste24p  28.39 
 
 		 260 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0070  peptidase M48 Ste24p  28.39 
 
 		 260 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.885024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1904  peptidase M48, Ste24p  32.28 
 
 		 493 aa  81.3  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3691  peptidase M48, Ste24p  23.73 
 
 		 359 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0985  peptidase M48, Ste24p  29.8 
 
 		 489 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.932429  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3510  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  24.41 
 
 		 370 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2967  peptidase M48, Ste24p  28.03 
 
 		 453 aa  75.5  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.913599 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03478  peptidase M48, Ste24p  31.33 
 
 		 268 aa  75.9  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0617  peptidase M48, Ste24p  30.13 
 
 		 479 aa  75.1  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3171  peptidase M48 Ste24p  30.46 
 
 		 445 aa  75.1  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1755  peptidase M48 Ste24p  26.13 
 
 		 493 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2381  peptidase M48, Ste24p  29.68 
 
 		 307 aa  74.7  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3078  peptidase M48 Ste24p  31.46 
 
 		 266 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000470092  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4877  peptidase M48 Ste24p  32.28 
 
 		 492 aa  73.9  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0844  peptidase M48 Ste24p  28.23 
 
 		 470 aa  73.6  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000290245  normal  0.0785618 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0508  peptidase M48, Ste24p  28.99 
 
 		 279 aa  73.6  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2861  peptidase M48, Ste24p  29.8 
 
 		 271 aa  73.2  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0821  peptidase M48, Ste24p  27.27 
 
 		 432 aa  71.2  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3647  peptidase M48, Ste24p  28.44 
 
 		 480 aa  71.6  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00143596  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2732  peptidase M48 Ste24p  36.36 
 
 		 268 aa  70.9  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000181  Zn-dependent protease with chaperone function  32.29 
 
 		 262 aa  70.5  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.787256  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0539  peptidase M48, Ste24p  29.11 
 
 		 478 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66690  putative protease  27.85 
 
 		 479 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2749  peptidase M48 Ste24p  34.93 
 
 		 494 aa  69.7  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114888  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1800  peptidase M48, Ste24p  31.65 
 
 		 263 aa  69.3  0.00000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0722089  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0410  M48 family peptidase  30.41 
 
 		 288 aa  69.3  0.00000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000410475  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5784  putative lipoprotein  27.33 
 
 		 479 aa  69.3  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0007  peptidase M48 Ste24p  32.24 
 
 		 271 aa  68.6  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0006  peptidase M48 Ste24p  30.87 
 
 		 268 aa  68.9  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00889597 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0007  hypothetical protein  32.24 
 
 		 271 aa  68.6  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2756  peptidase M48, Ste24p  33.08 
 
 		 354 aa  68.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.114844  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2828  peptidase M48 Ste24p  30 
 
 		 284 aa  68.6  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05815  peptidase  31.93 
 
 		 265 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1212  Zn-dependent protease, putative  26.48 
 
 		 436 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776404  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03289  Zn-dependent protease with chaperone function  32.1 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2842  peptidase M48, Ste24p  30.57 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000706614  normal  0.0604809 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3581  peptidase M48 Ste24p  31.29 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000704965  normal  0.319279 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0107  putative lipoprotein  31.08 
 
 		 262 aa  67.4  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1795  peptidase M48, Ste24p  27.54 
 
 		 513 aa  67.4  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3407  peptidase M48, Ste24p  30.49 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029445  hitchhiker  0.000231655 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  29.09 
 
 		 268 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0813  peptidase M48 Ste24p  29.71 
 
 		 365 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2250  peptidase M48, Ste24p  33.54 
 
 		 284 aa  66.6  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.581419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0393  peptidase M48 Ste24p  30.22 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000617052  hitchhiker  0.0000065256 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2301  peptidase M48 Ste24p  30 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.114592  normal  0.277953 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2978  putative lipoprotein  29.88 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4160  peptidase M48 Ste24p  29.11 
 
 		 489 aa  65.9  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0504491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1307  hypothetical protein  26.28 
 
 		 490 aa  65.5  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.31128  normal  0.470451 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3399  peptidase M48 Ste24p  26.95 
 
 		 362 aa  65.5  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0456  peptidase M48 Ste24p  28.41 
 
 		 395 aa  65.5  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1052  M48 family peptidase  29.68 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1212  peptidase M48  29.26 
 
 		 285 aa  64.7  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0402  peptidase M48, Ste24p  31.32 
 
 		 529 aa  64.3  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0370  peptidase M48 Ste24p  27.7 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000609738  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2537  peptidase M48, Ste24p  27.31 
 
 		 502 aa  63.9  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.606815  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2576  molybdopterin converting factor, subunit 1  27.92 
 
 		 503 aa  64.3  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>