More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_03014 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_03014  superoxide dismutase  100 
 
 
199 aa  409  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002934  superoxide dismutase (Fe)  98.45 
 
 
194 aa  395  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  3.74974e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1632  superoxide dismutase, Fe  92.78 
 
 
194 aa  380  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  4.40787e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1858  superoxide dismutase [Fe]  90.72 
 
 
194 aa  355  3e-97  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.850296  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1920  superoxide dismutase  82.38 
 
 
194 aa  342  2e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00591973  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1819  superoxide dismutase  80.83 
 
 
194 aa  339  1e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  8.21956e-07  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2503  Superoxide dismutase  80.83 
 
 
194 aa  339  1e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  2.89489e-10  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1782  superoxide dismutase  80.83 
 
 
194 aa  339  1e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  4.39358e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1775  superoxide dismutase  80.83 
 
 
194 aa  339  1e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  4.80024e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1639  manganese and iron superoxide dismutase  81.35 
 
 
194 aa  339  2e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  9.20942e-09  normal  0.988511 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1647  superoxide dismutase  81.35 
 
 
194 aa  339  2e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  6.41638e-07  hitchhiker  0.000247019 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1572  superoxide dismutase  81.35 
 
 
194 aa  339  2e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  3.80978e-09  normal  0.113962 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1687  superoxide dismutase  81.35 
 
 
194 aa  337  6e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  4.04322e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2881  superoxide dismutase, Fe  80.83 
 
 
194 aa  337  7e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1747  superoxide dismutase  80.31 
 
 
194 aa  335  2e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  4.73936e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3476  superoxide dismutase  79.9 
 
 
194 aa  333  1e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1963  superoxide dismutase  80.31 
 
 
194 aa  332  2e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271229  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0885  SecE subunit of protein translocation complex  79.79 
 
 
193 aa  330  1e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  2.05445e-15  hitchhiker  6.30572e-06 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2448  superoxide dismutase  80.31 
 
 
193 aa  330  1e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0103073  normal  0.0475458 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1834  superoxide dismutase  80.83 
 
 
194 aa  323  1e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  1.10112e-08  normal  0.958041 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1912  superoxide dismutase  77.72 
 
 
193 aa  319  2e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.137482  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1601  superoxide dismutase  77.2 
 
 
193 aa  317  5e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1869  superoxide dismutase  77.2 
 
 
193 aa  315  2e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  4.39054e-07  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01626  superoxide dismutase, Fe  77.2 
 
 
193 aa  315  2e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01616  hypothetical protein  77.2 
 
 
193 aa  315  2e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1735  superoxide dismutase  77.2 
 
 
193 aa  315  2e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0141664  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1973  superoxide dismutase  77.2 
 
 
193 aa  315  2e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0009948 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1527  superoxide dismutase  76.68 
 
 
193 aa  316  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1984  Superoxide dismutase  77.2 
 
 
193 aa  315  2e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.621128  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1853  superoxide dismutase  77.2 
 
 
193 aa  315  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  5.11005e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2368  superoxide dismutase  77.2 
 
 
193 aa  315  2e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0034219  normal  0.192505 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1542  superoxide dismutase  77.2 
 
 
193 aa  315  2e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.695463  normal  0.165364 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1743  superoxide dismutase  76.68 
 
 
193 aa  316  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  4.40254e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1541  superoxide dismutase  76.17 
 
 
193 aa  314  6e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000210127  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1395  superoxide dismutase  75.65 
 
 
193 aa  312  2e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2180  superoxide dismutase  76.29 
 
 
194 aa  312  2e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.678123  normal  0.116868 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2571  superoxide dismutase  74.48 
 
 
192 aa  310  7e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.489375  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1756  superoxide dismutase  75 
 
 
192 aa  309  2e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  4.9091e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02750  iron superoxide dismutase  73.06 
 
 
193 aa  309  2e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1639  superoxide dismutase  78.76 
 
 
194 aa  308  3e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  1.40033e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1863  superoxide dismutase  74.48 
 
 
192 aa  308  4e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.410173  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2159  superoxide dismutase  77.72 
 
 
193 aa  308  4e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.18708  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4363  superoxide dismutase, Fe  75.13 
 
 
193 aa  307  5e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4937  superoxide dismutase  73.06 
 
 
193 aa  305  3e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4486  superoxide dismutase  73.96 
 
 
198 aa  305  3e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0534582 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2445  superoxide dismutase  76.68 
 
 
193 aa  305  4e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.103269 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3322  superoxide dismutase  72.54 
 
 
193 aa  305  4e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56780  superoxide dismutase  72.54 
 
 
193 aa  304  6e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4473  superoxide dismutase  73.44 
 
 
198 aa  304  7e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.125166 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4059  superoxide dismutase  73.58 
 
 
193 aa  303  9e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2023  superoxide dismutase  73.58 
 
 
192 aa  301  3e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.110295  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2196  superoxide dismutase  72.54 
 
 
192 aa  301  5e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.515732  hitchhiker  5.76689e-06 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0981  superoxide dismutase  71.88 
 
 
198 aa  300  7e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581007  hitchhiker  0.000228043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0954  superoxide dismutase  71.35 
 
 
198 aa  299  2e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.80559 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0915  superoxide dismutase  71.35 
 
 
198 aa  299  2e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37820  Fe-Superoxide dismutase  70.98 
 
 
193 aa  293  2e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41434  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0947  Superoxide dismutase  68.91 
 
 
193 aa  293  2e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.367199  normal  0.0414637 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2463  Superoxide dismutase  71.13 
 
 
193 aa  288  4e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1791  superoxide dismutase  72.54 
 
 
193 aa  286  2e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.027396 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2803  Superoxide dismutase  68.72 
 
 
233 aa  284  6e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.327122  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2397  Superoxide dismutase  68.72 
 
 
233 aa  284  7e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.717603  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2458  superoxide dismutase, Fe  69.59 
 
 
194 aa  281  4e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.688146  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2428  superoxide dismutase  67.36 
 
 
193 aa  281  5e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.785927  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0539  manganese and iron superoxide dismutase  66.32 
 
 
192 aa  280  8e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  2.429e-05  hitchhiker  1.11544e-06 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0744  superoxide dismutase  66.84 
 
 
221 aa  280  1e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0597  superoxide dismutase  67.36 
 
 
193 aa  280  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00195013  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3039  superoxide dismutase, iron  65.62 
 
 
192 aa  279  2e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2271  superoxide dismutase  67.36 
 
 
221 aa  279  2e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00171574  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1085  superoxide dismutase  66.84 
 
 
221 aa  278  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00846047  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0930  superoxide dismutase (Fe)  67.36 
 
 
192 aa  278  4e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132223  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0566  superoxide dismutase  67.36 
 
 
192 aa  278  4e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0641217  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2148  superoxide dismutase  67.36 
 
 
192 aa  278  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0933  superoxide dismutase (Fe)  67.36 
 
 
192 aa  278  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200244  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1043  superoxide dismutase  67.36 
 
 
192 aa  278  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00491913  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2897  superoxide dismutase, iron  65.62 
 
 
192 aa  277  7e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0753  superoxide dismutase  65.28 
 
 
192 aa  272  2e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174612  normal  0.215519 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5874  superoxide dismutase  65.8 
 
 
192 aa  271  4e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0166877  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1895  superoxide dismutase (Fe)  64.58 
 
 
193 aa  270  8e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0298  superoxide dismutase  64.58 
 
 
193 aa  270  8e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.775999  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2461  superoxide dismutase  65.28 
 
 
192 aa  270  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00028549 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2591  superoxide dismutase  65.28 
 
 
192 aa  270  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.194352  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1931  superoxide dismutase  64.77 
 
 
192 aa  268  3e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.678188  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2543  superoxide dismutase  64.77 
 
 
192 aa  268  3e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166129  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2567  superoxide dismutase  64.77 
 
 
192 aa  268  3e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000701248  normal  0.136578 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0540  superoxide dismutase  63.21 
 
 
192 aa  266  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.950904 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1385  superoxide dismutase  64.77 
 
 
192 aa  266  2e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2526  superoxide dismutase [Fe] protein  69.43 
 
 
192 aa  265  3e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0270769 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3574  superoxide dismutase  65.46 
 
 
193 aa  264  5e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0150898  hitchhiker  0.00946106 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3194  Superoxide dismutase  62.18 
 
 
192 aa  263  9e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0194093  normal  0.452704 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0769  superoxide dismutase  61.66 
 
 
192 aa  261  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1927  superoxide dismutase  64.43 
 
 
193 aa  261  7e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.630056  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1558  Superoxide dismutase  63.92 
 
 
193 aa  258  3e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.25329  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2568  superoxide dismutase  64.43 
 
 
194 aa  258  5e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.28771  decreased coverage  0.00195196 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2301  superoxide dismutase  63.92 
 
 
193 aa  257  8e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0685377 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4998  Superoxide dismutase  62.89 
 
 
193 aa  256  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6857  Superoxide dismutase  58.59 
 
 
197 aa  256  2e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0552512 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2645  Superoxide dismutase  62.37 
 
 
193 aa  255  3e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.22582  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2945  superoxide dismutase  62.89 
 
 
193 aa  255  3e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1895  superoxide dismutase  61.31 
 
 
201 aa  254  6e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.514974  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2481  superoxide dismutase  62.89 
 
 
193 aa  254  6e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.152277  normal  0.398942 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>