More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02942 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_002968  acetate kinase  93.47 
 
 
398 aa  767    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0616  acetate kinase  85.68 
 
 
398 aa  711    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.781931  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02942  acetate kinase  100 
 
 
398 aa  816    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2112  acetate kinase  92.96 
 
 
398 aa  768    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0121493  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02221  acetate kinase  73.3 
 
 
400 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.177023  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1360  acetate kinase  73.3 
 
 
400 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000132776  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2590  acetate kinase  73.3 
 
 
400 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0300293  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3436  acetate kinase  73.3 
 
 
400 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.1925  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02181  hypothetical protein  73.3 
 
 
400 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.154164  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2446  acetate kinase  73.3 
 
 
400 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0138092  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1443  acetate kinase  71.79 
 
 
400 aa  605  9.999999999999999e-173  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3316  acetate kinase  72.8 
 
 
400 aa  607  9.999999999999999e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00011444  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1551  acetate kinase  71.79 
 
 
400 aa  605  9.999999999999999e-173  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.099889  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2672  acetate kinase  73.3 
 
 
400 aa  605  9.999999999999999e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.733134  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2452  acetate kinase  73.3 
 
 
400 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.691119  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1356  acetate kinase  73.3 
 
 
400 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.446941  normal  0.180313 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2478  acetate kinase  72.8 
 
 
400 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.679526  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2578  acetate kinase  72.8 
 
 
400 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2686  acetate kinase  72.8 
 
 
400 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.888015 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2523  acetate kinase  72.8 
 
 
400 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.340235 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1385  acetate kinase  73.55 
 
 
400 aa  603  1.0000000000000001e-171  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00164511  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1825  acetate kinase  71.54 
 
 
400 aa  603  1.0000000000000001e-171  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2566  acetate kinase  72.8 
 
 
400 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2840  acetate kinase  72.04 
 
 
400 aa  597  1e-169  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.546622 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2559  acetate kinase  71.79 
 
 
400 aa  589  1e-167  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.139439  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2780  acetate kinase  73.05 
 
 
400 aa  587  1e-167  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0653743  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1484  acetate kinase  72.54 
 
 
400 aa  586  1e-166  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.209908  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2760  acetate kinase  69.35 
 
 
402 aa  577  1.0000000000000001e-163  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.819841  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1552  acetate kinase  64.39 
 
 
399 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.357591  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2915  acetate kinase  64.14 
 
 
399 aa  535  1e-151  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2381  acetate kinase  64.65 
 
 
400 aa  536  1e-151  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.441751  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1491  acetate kinase  64.14 
 
 
399 aa  536  1e-151  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000140767  normal  0.637827 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1558  acetate kinase  64.14 
 
 
399 aa  536  1e-151  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.115014  normal  0.14682 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2772  acetate kinase  64.39 
 
 
399 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.170016  normal  0.900163 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2674  acetate kinase  64.39 
 
 
399 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00368662  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1691  acetate kinase  64.39 
 
 
399 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00532421  hitchhiker  0.00624387 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0803  acetate kinase  64.57 
 
 
398 aa  531  1e-150  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.102321  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2693  acetate kinase  64.39 
 
 
399 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000276936  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2409  acetate kinase  64.3 
 
 
413 aa  531  1e-149  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1495  acetate kinase  65.74 
 
 
399 aa  529  1e-149  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2393  acetate kinase  63.89 
 
 
398 aa  526  1e-148  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.451887  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2476  acetate kinase  64.3 
 
 
400 aa  525  1e-148  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2886  acetate kinase  63.64 
 
 
398 aa  525  1e-148  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00530496  decreased coverage  0.000000557586 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0382  acetate kinase  60.65 
 
 
400 aa  519  1e-146  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.627309  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1669  acetate kinase  63.04 
 
 
398 aa  509  1e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0184295  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1705  acetate kinase  62.12 
 
 
399 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0458561  hitchhiker  0.00694718 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3539  acetate kinase  60.86 
 
 
398 aa  502  1e-141  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3311  acetate kinase  59.09 
 
 
404 aa  472  1e-132  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02238  acetate/propionate kinase  52.51 
 
 
393 aa  411  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3176  acetate kinase  51.13 
 
 
412 aa  408  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2590  acetate kinase  50.75 
 
 
398 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.871913  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0923  acetate kinase  51.51 
 
 
421 aa  379  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0994  acetate kinase  50.13 
 
 
397 aa  372  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  9.48202e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001527  acetate kinase  48.63 
 
 
397 aa  373  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  47.73 
 
 
398 aa  371  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1977  acetate kinase  47.24 
 
 
398 aa  360  2e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34560  acetate kinase  48.98 
 
 
395 aa  359  5e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.576649  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1695  acetate kinase  47.46 
 
 
398 aa  358  7e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0395303  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0650  acetate kinase  45.23 
 
 
403 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.276735  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0674  acetate kinase  45.23 
 
 
403 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4098  propionate/acetate kinase  48.62 
 
 
403 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2953  acetate kinase  48.62 
 
 
402 aa  354  2e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.845819  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0642  acetate kinase  49.11 
 
 
449 aa  353  4e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1767  acetate kinase  45.75 
 
 
400 aa  351  2e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1802  acetate kinase  45.75 
 
 
400 aa  351  2e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3562  propionate/acetate kinase  46.82 
 
 
402 aa  351  2e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1493  acetate kinase  44.56 
 
 
399 aa  350  3e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0874579  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  45.23 
 
 
398 aa  347  1e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53470  acetate kinase  47.85 
 
 
394 aa  348  1e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00330068  hitchhiker  0.00786734 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4684  acetate kinase  47.59 
 
 
394 aa  347  2e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1271  acetate kinase  45.36 
 
 
406 aa  347  2e-94  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3826  acetate kinase  45.69 
 
 
399 aa  347  2e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259685  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1028  acetate kinase  44.33 
 
 
399 aa  347  2e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000413101  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4773  acetate kinase  45.05 
 
 
397 aa  346  3e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4381  acetate kinase  45.05 
 
 
397 aa  346  3e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4746  acetate kinase  44.8 
 
 
397 aa  347  3e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4772  acetate kinase  45.05 
 
 
397 aa  346  3e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3310  acetate kinase  45.3 
 
 
397 aa  346  4e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.865638  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2656  acetate kinase  47.58 
 
 
422 aa  345  6e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0489  acetate kinase  44.8 
 
 
397 aa  345  6e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1133  acetate kinase  47.74 
 
 
401 aa  345  6e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4755  acetate kinase  44.8 
 
 
397 aa  345  8e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  46.35 
 
 
404 aa  345  8.999999999999999e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4371  acetate kinase  44.8 
 
 
397 aa  344  1e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0655  acetate kinase  46.21 
 
 
397 aa  344  2e-93  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000414678  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4535  acetate kinase  44.8 
 
 
397 aa  344  2e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4888  acetate kinase  44.8 
 
 
397 aa  344  2e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0760  acetate kinase  45.36 
 
 
406 aa  344  2e-93  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0933  acetate kinase  45.2 
 
 
397 aa  343  2.9999999999999997e-93  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.666104  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0647  acetate kinase  44 
 
 
401 aa  343  2.9999999999999997e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3099  acetate kinase  45.66 
 
 
398 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.492017  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0731  acetate kinase  45 
 
 
396 aa  343  4e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2708  acetate kinase  44.39 
 
 
397 aa  342  9e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0186296  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3644  acetate kinase  48.2 
 
 
394 aa  341  1e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.922288  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0712  acetate kinase  47.37 
 
 
396 aa  341  1e-92  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2897  acetate kinase  45.18 
 
 
415 aa  341  1e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3088  acetate kinase  45.18 
 
 
425 aa  341  2e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273293  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1318  acetate kinase  47.36 
 
 
396 aa  340  2e-92  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02982  propionate kinase/acetate kinase C, anaerobic  45.06 
 
 
406 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3411  propionate/acetate kinase  45.06 
 
 
402 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>