91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02939 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02939  hypothetical protein  100 
 
 		 317 aa  620  1e-177  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002971  ABC-type uncharacterized transport system permease component  94.86 
 
 		 311 aa  541  1e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0620  putative ABC transporter, permease protein  85.94 
 
 		 327 aa  491  9.999999999999999e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.375886  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0822  ABC transporter inner-membrane translocator  58.92 
 
 		 299 aa  333  2e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0113178 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4045  inner-membrane translocator  61.32 
 
 		 292 aa  318  7e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3066  inner-membrane translocator  59.72 
 
 		 292 aa  315  7e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1088  inner-membrane translocator  55.44 
 
 		 300 aa  310  2e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0866  inner-membrane translocator  58.48 
 
 		 294 aa  310  2e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3722  inner-membrane translocator  61.32 
 
 		 292 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2868  inner-membrane translocator  59.52 
 
 		 294 aa  309  4e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2055  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  57.79 
 
 		 294 aa  308  6.999999999999999e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1975  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  57.79 
 
 		 294 aa  307  2.0000000000000002e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237569  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1436  ABC transporter, inner membrane subunit  53.72 
 
 		 299 aa  300  3e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.641737 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1600  inner-membrane translocator  53.04 
 
 		 299 aa  298  6e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.852679 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2105  inner-membrane translocator  55.41 
 
 		 312 aa  293  3e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1314  inner-membrane translocator  51.36 
 
 		 298 aa  291  7e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.506841  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2217  inner-membrane translocator  51.02 
 
 		 298 aa  288  6e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.224996  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2841  inner-membrane translocator  51.02 
 
 		 298 aa  288  6e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2830  inner-membrane translocator  51.02 
 
 		 298 aa  288  6e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1713  inner-membrane translocator  51.18 
 
 		 299 aa  287  1e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.376915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6160  ABC transporter, inner membrane subunit  51.02 
 
 		 298 aa  287  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0473  inner-membrane translocator  51.36 
 
 		 298 aa  285  8e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.994417 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0441  ABC transporter, permease protein  50.84 
 
 		 339 aa  280  3e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0285978  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1749  inner-membrane translocator  51.86 
 
 		 295 aa  279  4e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2039  inner-membrane translocator  54.95 
 
 		 313 aa  278  1e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0264556 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1462  inner-membrane translocator  52.32 
 
 		 302 aa  277  2e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.263338  hitchhiker  0.000000733363 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1948  inner-membrane translocator  51.86 
 
 		 295 aa  276  3e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418082  normal  0.372623 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0688  branched chain amino acid ABC transporter permease  51.19 
 
 		 336 aa  276  5e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.489758  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1503  inner-membrane translocator  51.62 
 
 		 302 aa  276  5e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.26589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1210  inner-membrane translocator  51.86 
 
 		 298 aa  275  6e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0487778 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0506  ABC transporter, permease protein  51.36 
 
 		 298 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.973872  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0523  ABC transporter, permease protein  51.36 
 
 		 298 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2906  ABC transporter, permease protein  51.36 
 
 		 298 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957713  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3141  ABC transporter, permease protein  51.36 
 
 		 298 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1478  ABC transporter, permease protein  51.36 
 
 		 298 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0110  ABC transporter, permease protein  51.36 
 
 		 298 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0631  inner-membrane translocator  52.03 
 
 		 315 aa  272  5.000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0289508  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4312  inner-membrane translocator  50 
 
 		 294 aa  271  1e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.953267  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1739  putative transmembrane ABC transporter protein  50.17 
 
 		 303 aa  269  4e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.210687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1276  ABC transporter permease  51.7 
 
 		 296 aa  269  4e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2162  inner-membrane translocator  51.19 
 
 		 295 aa  269  4e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.596984 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1950  inner-membrane translocator  55.07 
 
 		 296 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.202411  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14380  ABC transporter permease  51.7 
 
 		 296 aa  266  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.515362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3142  inner-membrane translocator  51.54 
 
 		 293 aa  265  5e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.407597  normal  0.74462 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0048  ABC transporter, permease protein  50.69 
 
 		 297 aa  251  1e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19980  inner-membrane translocator  45.51 
 
 		 306 aa  229  3e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000156701  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0658  inner-membrane translocator  42.55 
 
 		 325 aa  229  4e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.812733  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2829  inner-membrane translocator  44.56 
 
 		 309 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.127019  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03820  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  47.42 
 
 		 329 aa  216  4e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4552  inner-membrane translocator  41.61 
 
 		 305 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.131035  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1570  inner-membrane translocator  42.53 
 
 		 307 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0324  hypothetical protein  40.19 
 
 		 304 aa  202  6e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2585  inner-membrane translocator  42.76 
 
 		 302 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000114262  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1474  inner-membrane translocator  45.45 
 
 		 330 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2855  inner-membrane translocator  43.9 
 
 		 330 aa  195  8.000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0268  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  35.82 
 
 		 297 aa  189  5.999999999999999e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.603653  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1818  inner-membrane translocator  39.78 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000219565  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2861  inner-membrane translocator  40.07 
 
 		 313 aa  187  3e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2077  ABC transporter, permease protein  36.12 
 
 		 298 aa  186  4e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.251592  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1505  hypothetical protein  40.68 
 
 		 640 aa  185  8e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2363  inner-membrane translocator  33.9 
 
 		 365 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000240422  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2226  inner-membrane translocator  38.87 
 
 		 293 aa  177  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0342549  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0078  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  36.75 
 
 		 299 aa  177  2e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0259  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  38.66 
 
 		 308 aa  176  4e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0510641  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0211  ABC transporter, permease protein, putative  37.85 
 
 		 303 aa  170  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.193865  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0076  inner-membrane translocator  35.47 
 
 		 306 aa  168  9e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1119  ABC transporter, inner membrane subunit  36.55 
 
 		 305 aa  168  9e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1110  ABC transporter, inner membrane subunit  35.96 
 
 		 305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1946  inner-membrane translocator  35.57 
 
 		 299 aa  162  9e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.463281  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0724  inner-membrane translocator  38.49 
 
 		 299 aa  160  4e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0261015  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1154  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  37.69 
 
 		 289 aa  159  8e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000049546  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1188  ABC transporter, permease protein  33.94 
 
 		 287 aa  155  1e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0206  inner-membrane translocator  32.15 
 
 		 363 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0043  inner-membrane translocator  33.79 
 
 		 289 aa  152  5e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.963469  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1099  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 329 aa  151  1e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0737  inner-membrane translocator  39.47 
 
 		 300 aa  142  7e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000122382 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  38.53 
 
 		 584 aa  139  4.999999999999999e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2839  ABC transporter permease  52.38 
 
 		 120 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000198537  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4372  inner-membrane translocator  33.09 
 
 		 299 aa  92.8  7e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3415  inner-membrane translocator  29.58 
 
 		 295 aa  47.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  25.12 
 
 		 314 aa  46.2  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1189  inner-membrane translocator  25.96 
 
 		 331 aa  45.4  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.227031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2603  inner-membrane translocator  25 
 
 		 312 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0883  inner-membrane translocator  30.71 
 
 		 316 aa  44.3  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0459819 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3520  inner-membrane translocator  25.24 
 
 		 291 aa  43.9  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4444  inner-membrane translocator  29.33 
 
 		 298 aa  44.3  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4423  inner-membrane translocator  26.21 
 
 		 277 aa  43.9  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3692  inner-membrane translocator  24.4 
 
 		 310 aa  43.5  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.24708  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  27.18 
 
 		 317 aa  43.1  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1549  sugar ABC transporter  27.72 
 
 		 317 aa  42.4  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.221473  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1829  ABC transporter, permease protein  27.72 
 
 		 317 aa  42.4  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>