154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02923 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002984  AsmA protein  86.31 
 
 		 695 aa  1217    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0557  asmA protein  61.51 
 
 		 703 aa  870    Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00432882  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02923  hypothetical protein  100 
 
 		 695 aa  1389    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2229  putative outer membrane assembly protein  47.34 
 
 		 719 aa  629  1e-179  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87964  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2409  AsmA family protein  32.92 
 
 		 612 aa  336  7e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.278474  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1773  AsmA family protein  32.2 
 
 		 608 aa  330  6e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000090206  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2116  AsmA family protein  33.68 
 
 		 614 aa  327  5e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.738267  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2566  asmA protein  31.59 
 
 		 606 aa  319  1e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1887  AsmA protein  30.94 
 
 		 604 aa  295  1e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2209  AsmA family protein  29.53 
 
 		 606 aa  287  5.999999999999999e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2024  AsmA  29.91 
 
 		 614 aa  270  8e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000524921  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2694  AsmA family protein  29.08 
 
 		 699 aa  257  5e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.264  normal  0.390099 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2483  AsmA family protein  28.02 
 
 		 742 aa  254  3e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2331  AsmA family protein  34.68 
 
 		 607 aa  249  1e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00854787  hitchhiker  0.00634925 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2056  AsmA family protein  34.99 
 
 		 607 aa  247  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.399142  hitchhiker  0.00088344 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1993  AsmA family protein  34.44 
 
 		 607 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2008  AsmA family protein  34.2 
 
 		 607 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0960641  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2372  AsmA protein  34.53 
 
 		 606 aa  234  3e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00905663  normal  0.0519979 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2164  AsmA family protein  34.38 
 
 		 606 aa  233  1e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0565997  normal  0.411123 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1985  AsmA family protein  34.2 
 
 		 611 aa  233  1e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0885974  normal  0.0733894 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2241  AsmA family protein  34.14 
 
 		 606 aa  231  4e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104222  normal  0.355768 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2948  AsmA family protein  26.67 
 
 		 712 aa  229  9e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50394  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2614  AsmA family protein  34.18 
 
 		 606 aa  229  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.745873  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1140  AsmA family protein  25.27 
 
 		 732 aa  205  2e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.999799  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2265  hypothetical protein  32.3 
 
 		 812 aa  196  2e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2526  AsmA  32.09 
 
 		 893 aa  182  2.9999999999999997e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1953  AsmA family protein  25.85 
 
 		 682 aa  172  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.279291  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2303  putative assembly protein  24.04 
 
 		 618 aa  170  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2354  putative assembly protein  24.04 
 
 		 618 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.827623  normal  0.53573 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2247  putative assembly protein  24.04 
 
 		 618 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2347  putative assembly protein  24.04 
 
 		 618 aa  168  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2461  putative assembly protein  24.04 
 
 		 618 aa  165  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.45795 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1019  outer membrane protein assembly protein AsmA  29.75 
 
 		 640 aa  164  4.0000000000000004e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3175  AsmA family protein  24.48 
 
 		 741 aa  157  8e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1578  putative assembly protein  22.06 
 
 		 611 aa  155  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.976931  normal  0.530891 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  31.69 
 
 		 797 aa  154  8e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2550  putative assembly protein  22.54 
 
 		 618 aa  146  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.208031  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3193  putative assembly protein  22.54 
 
 		 618 aa  146  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.182103  normal  0.0103225 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2451  putative assembly protein  22.54 
 
 		 618 aa  146  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0118  AsmA  24.54 
 
 		 762 aa  145  3e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.413911  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1199  putative assembly protein  21.72 
 
 		 599 aa  141  3.9999999999999997e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1028  hypothetical protein  23.26 
 
 		 725 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.632611  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3040  putative assembly protein  22.59 
 
 		 611 aa  138  4e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1332  AsmA family protein  28.74 
 
 		 696 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.176392  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1291  putative assembly protein  22.89 
 
 		 611 aa  134  6e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1168  putative assembly protein  25.13 
 
 		 617 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3001  putative assembly protein  25.38 
 
 		 617 aa  131  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.352254 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1593  AsmA family protein  25.13 
 
 		 617 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00514431  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1577  putative assembly protein  25.13 
 
 		 617 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.190719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2357  putative assembly protein  25.13 
 
 		 617 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0996  putative assembly protein  24.87 
 
 		 617 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01970  predicted assembly protein  25.13 
 
 		 617 aa  128  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01959  hypothetical protein  25.13 
 
 		 617 aa  128  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2204  putative assembly protein  25.13 
 
 		 617 aa  127  5e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0716  AsmA family protein  22.52 
 
 		 660 aa  127  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.194292 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3103  AsmA family protein  22.37 
 
 		 675 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.596916  normal  0.117573 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2006  hypothetical protein  22.67 
 
 		 660 aa  125  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0368531  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0159  AsmA family protein  24.49 
 
 		 794 aa  124  4e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2678  putative assembly protein  26.87 
 
 		 615 aa  122  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.462778  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0754  AsmA family protein  23.64 
 
 		 745 aa  120  6e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1851  AsmA family protein  26.59 
 
 		 709 aa  118  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.997541 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0560  putative AsmA-like protein  22.58 
 
 		 705 aa  118  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.748944 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4900  AsmA  22.03 
 
 		 741 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5009  AsmA family protein  32.16 
 
 		 1013 aa  114  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0536968 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5341  hypothetical protein  22.55 
 
 		 741 aa  111  6e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2863  AsmA family protein  22.82 
 
 		 711 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  27.43 
 
 		 677 aa  110  7.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0321  AsmA  22.93 
 
 		 740 aa  110  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.188121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67975  hypothetical protein  21.8 
 
 		 750 aa  109  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.302933  normal  0.0556453 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4258  AsmA family protein  21.46 
 
 		 741 aa  108  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000475178 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3609  AsmA  27.71 
 
 		 640 aa  106  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5883  hypothetical protein  22.11 
 
 		 750 aa  106  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0521  AsmA  25.52 
 
 		 789 aa  106  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04540  hypothetical protein  21.86 
 
 		 748 aa  103  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0590  uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis  30 
 
 		 826 aa  103  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3033  hypothetical protein  26.9 
 
 		 649 aa  101  5e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0689945  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0287  AsmA family protein  23.06 
 
 		 748 aa  99  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233767 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0312  AsmA family protein  21.97 
 
 		 748 aa  99  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1004  AsmA family protein  28.69 
 
 		 502 aa  98.6  4e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000644102  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1134  ASMA  28.69 
 
 		 508 aa  98.6  4e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.038364  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0307  AsmA family protein  22.58 
 
 		 748 aa  97.4  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304017 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4921  AsmA family protein  21.07 
 
 		 747 aa  97.1  9e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1457  AsmA  21.85 
 
 		 654 aa  93.2  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0892  AsmA  25.09 
 
 		 655 aa  89.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6831  putative asmA protein, assembly of outer membrane proteins  24.4 
 
 		 645 aa  87  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0946528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0651  AsmA  21.07 
 
 		 646 aa  86.3  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5162  AsmA family protein  24.73 
 
 		 602 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.63495  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1245  AsmA  23.21 
 
 		 643 aa  83.2  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.350704  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1009  hypothetical protein  25 
 
 		 656 aa  82.8  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1016  AsmA  19.34 
 
 		 656 aa  81.3  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.620407  normal  0.697565 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1004  AsmA  23.9 
 
 		 649 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.478001  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4636  AsmA family protein  22.6 
 
 		 648 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.86579  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1433  AsmA  22.6 
 
 		 655 aa  77.8  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2869  putative assembly protein  33.91 
 
 		 604 aa  77  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0711  AsmA family protein  29.75 
 
 		 609 aa  75.5  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2162  AsmA family protein  20.75 
 
 		 701 aa  74.3  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.152966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1137  AsmA family protein  33.86 
 
 		 265 aa  70.1  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0909358 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3951  AsmA  19.73 
 
 		 649 aa  67.4  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.552842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0110  AsmA family protein  26.38 
 
 		 704 aa  65.1  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0874  hypothetical protein  25.09 
 
 		 1080 aa  64.3  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>