More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02863 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_003018  SohB protein peptidase U7 family  94.05 
 
 
353 aa  644  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  9.39e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02863  putative periplasmic protease  100 
 
 
353 aa  704  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0578  putative periplasmic protease  80.74 
 
 
353 aa  545  1e-154  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  4.8636e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1161  putative periplasmic protease  70.82 
 
 
353 aa  521  1e-147  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.189873  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2903  putative periplasmic protease  59.31 
 
 
343 aa  419  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  1.80746e-07  normal  0.0386673 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2119  putative periplasmic protease  58.24 
 
 
337 aa  405  1e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  1.82338e-08  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2013  putative periplasmic protease  55.52 
 
 
348 aa  402  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0439516  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1651  putative periplasmic protease  61.03 
 
 
342 aa  402  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  3.59076e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1193  putative periplasmic protease  60.46 
 
 
349 aa  402  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1694  putative periplasmic protease  58.17 
 
 
343 aa  398  1e-110  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0077753  normal  0.738833 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2570  putative periplasmic protease  55.59 
 
 
336 aa  392  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2166  putative periplasmic protease  56.13 
 
 
348 aa  391  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0622193  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1530  putative periplasmic protease  57.67 
 
 
338 aa  391  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  2.34628e-08  unclonable  7.65641e-11 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2314  putative periplasmic protease  55.81 
 
 
348 aa  390  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1926  putative periplasmic protease  55.81 
 
 
348 aa  390  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2407  putative periplasmic protease  59.6 
 
 
343 aa  387  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  1.70796e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1972  putative periplasmic protease  57.27 
 
 
349 aa  385  1e-106  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114164  normal  0.766223 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2306  putative periplasmic protease  53.26 
 
 
348 aa  385  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2036  putative periplasmic protease  53.26 
 
 
348 aa  385  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.210716  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1925  putative periplasmic protease  53.26 
 
 
348 aa  385  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0571162  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2659  putative periplasmic protease  54.96 
 
 
348 aa  387  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0477819  unclonable  2.88065e-08 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2471  putative periplasmic protease  54.89 
 
 
337 aa  381  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  1.73214e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2394  putative periplasmic protease  57.67 
 
 
338 aa  378  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  2.16852e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1470  putative periplasmic protease  57.88 
 
 
338 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  1.01356e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2692  putative periplasmic protease  56.53 
 
 
338 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  2.60799e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1536  putative periplasmic protease  57.39 
 
 
338 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  2.29962e-06  unclonable  2.62337e-05 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2933  putative periplasmic protease  57.1 
 
 
338 aa  375  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01248  predicted inner membrane peptidase  54.96 
 
 
349 aa  373  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.57179  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1904  putative periplasmic protease  54.96 
 
 
349 aa  374  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  1.80069e-08 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2356  putative periplasmic protease  55.24 
 
 
349 aa  374  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.203735  hitchhiker  3.87336e-07 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1859  putative periplasmic protease  54.96 
 
 
349 aa  373  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  1.40347e-14 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2790  putative periplasmic protease  57.1 
 
 
338 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  2.1118e-07  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2377  Peptidase S49 domain protein  54.96 
 
 
349 aa  373  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00026529  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1381  putative periplasmic protease  55.24 
 
 
349 aa  374  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1471  putative periplasmic protease  54.67 
 
 
349 aa  371  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.251936  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2713  putative periplasmic protease  56.82 
 
 
338 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  8.22492e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1496  putative periplasmic protease  54.39 
 
 
349 aa  367  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1674  putative periplasmic protease  56.4 
 
 
330 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  6.78362e-06  hitchhiker  0.00314277 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0841  putative periplasmic protease  54.44 
 
 
347 aa  363  3e-99  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0227554  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1906  putative periplasmic protease  54.39 
 
 
348 aa  356  3e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.37079e-13 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1612  putative periplasmic protease  54.39 
 
 
348 aa  356  3e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  1.17623e-10 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1430  putative periplasmic protease  54.39 
 
 
348 aa  356  3e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.28088  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1848  putative periplasmic protease  54.39 
 
 
348 aa  356  3e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.805473  normal  0.10396 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1843  putative periplasmic protease  54.11 
 
 
348 aa  355  9e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  5.383e-07 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01896  putative periplasmic protease  54.23 
 
 
340 aa  353  2e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000105224  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2198  putative periplasmic protease  53.26 
 
 
347 aa  349  3e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  3.53353e-05 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2181  putative periplasmic protease  51.29 
 
 
344 aa  348  1e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119902  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1913  putative periplasmic protease  50.43 
 
 
339 aa  340  3e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.786378  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3922  putative periplasmic protease  50.14 
 
 
339 aa  338  7e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113918  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3211  putative periplasmic protease  50.43 
 
 
339 aa  338  1e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.888582  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3556  putative periplasmic protease  50.14 
 
 
339 aa  338  1e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.132568  normal  0.518214 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3114  putative periplasmic protease  50.43 
 
 
340 aa  333  2e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0953569  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2460  putative periplasmic protease  51.14 
 
 
340 aa  332  6e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0165849  hitchhiker  0.0077968 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1530  putative periplasmic protease  49.44 
 
 
353 aa  330  2e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  2.85162e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2016  putative periplasmic protease  50.42 
 
 
365 aa  329  4e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  4.38973e-07  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2728  peptidase, U7 family  50.57 
 
 
340 aa  328  6e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27550  putative periplasmic protease  52.01 
 
 
342 aa  322  7e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1726  putative periplasmic protease  49.11 
 
 
338 aa  319  5e-86  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0461  putative periplasmic protease  48.81 
 
 
338 aa  318  8e-86  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40840  putative periplasmic protease  50.57 
 
 
341 aa  317  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1605  putative periplasmic protease  49.1 
 
 
334 aa  317  3e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.741471  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1759  peptidase S49  46.94 
 
 
356 aa  315  9e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.257491  normal  0.0518499 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3463  putative periplasmic protease  50.29 
 
 
341 aa  314  2e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145757  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2530  putative periplasmic protease  49.71 
 
 
339 aa  311  1e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.581434  normal  0.322286 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1707  putative periplasmic protease  51.52 
 
 
347 aa  307  2e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.122025 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1088  putative periplasmic protease  45.29 
 
 
334 aa  305  1e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0973  putative periplasmic protease  45.29 
 
 
334 aa  305  1e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0843  putative periplasmic protease  46.47 
 
 
325 aa  303  3e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1897  Peptidase S49 domain protein  51.43 
 
 
347 aa  300  3e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0992  putative periplasmic protease  60.35 
 
 
332 aa  296  5e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0462132  unclonable  6.96502e-10 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2629  putative periplasmic protease  44.84 
 
 
333 aa  293  2e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.751964  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1202  putative periplasmic protease  59.82 
 
 
324 aa  291  1e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.184937  normal  0.0260504 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1184  putative periplasmic protease  59.38 
 
 
326 aa  289  5e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.084263  normal  0.0267663 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0332  putative periplasmic protease  54.07 
 
 
332 aa  284  1e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1938  putative periplasmic protease  49.65 
 
 
349 aa  280  3e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0917  putative periplasmic protease  48.53 
 
 
312 aa  275  9e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0886  putative periplasmic protease  47.66 
 
 
312 aa  273  2e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0102  putative periplasmic protease  43.03 
 
 
335 aa  273  3e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_5654  predicted protein  53.4 
 
 
234 aa  204  1e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.221345  normal  0.32323 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_4014  predicted protein  51.98 
 
 
216 aa  202  5e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.545391  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_5396  predicted protein  43.64 
 
 
165 aa  127  3e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.751288  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3060  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.25 
 
 
625 aa  102  9e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1434  peptidase S49  31.53 
 
 
552 aa  98.2  2e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0725  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.1 
 
 
335 aa  98.6  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1376  peptidase S49  34.86 
 
 
295 aa  97.8  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13521  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  35.76 
 
 
269 aa  97.1  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3597  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.99 
 
 
640 aa  96.7  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2714  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.48 
 
 
336 aa  96.7  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0963  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.15 
 
 
547 aa  96.3  7e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2153  peptidase S49  41.67 
 
 
285 aa  96.3  8e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156713  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0974  peptidase S49  31.52 
 
 
364 aa  95.9  9e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0652949 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00860  ClpP class periplasmic serine protease  33.5 
 
 
300 aa  94.7  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0909  peptidase S49  31.13 
 
 
364 aa  94.7  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0531296 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1281  signal peptide peptidase A  35.76 
 
 
269 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13811  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  35.15 
 
 
269 aa  94  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.99906  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13731  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  35.76 
 
 
269 aa  94  4e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3105  peptidase S49  41.94 
 
 
286 aa  93.2  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.246798 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3297  peptidase S49  38.41 
 
 
286 aa  93.2  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623968  normal  0.49449 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2771  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.79 
 
 
584 aa  93.2  7e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0392  peptidase S49  29.91 
 
 
315 aa  93.2  7e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>