More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02838 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02838  hypothetical protein  100 
 
 		 378 aa  763    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003046  membrane-fusion protein  90.74 
 
 		 377 aa  693    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1169  membrane-fusion protein  66.93 
 
 		 377 aa  503  1e-141  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0146013  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1440  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.24 
 
 		 374 aa  207  3e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2283  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.77 
 
 		 361 aa  167  4e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00902179 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01120  membrane fusion efflux protein  30.81 
 
 		 373 aa  152  5.9999999999999996e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1670  RND family efflux transporter MFP subunit  29.28 
 
 		 371 aa  152  7e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3518  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.28 
 
 		 379 aa  134  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.224234  normal  0.212959 
 
 
-
 
NC_002950  PG1666  RND family efflux transporter MFP subunit  26.22 
 
 		 368 aa  128  1.0000000000000001e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  29.92 
 
 		 400 aa  120  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1617  secretion protein HlyD  25.52 
 
 		 408 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0160623  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1671  HlyD family secretion protein  25.52 
 
 		 408 aa  112  7.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0782  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.38 
 
 		 428 aa  107  4e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00204407  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3559  RND family efflux transporter MFP subunit  26.07 
 
 		 396 aa  103  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0492868  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1670  macrolide transporter subunit MacA  27.04 
 
 		 348 aa  102  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1597  macrolide transporter subunit MacA  25.59 
 
 		 370 aa  102  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2696  macrolide transporter subunit MacA  25.59 
 
 		 370 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.761507  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2611  macrolide transporter subunit MacA  25.59 
 
 		 370 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1259  RND family efflux transporter MFP subunit  23.65 
 
 		 415 aa  101  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3595  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.87 
 
 		 404 aa  100  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0852698  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.94 
 
 		 409 aa  98.2  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2452  RND family efflux transporter MFP subunit  24.93 
 
 		 428 aa  98.6  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.591296 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2314  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.78 
 
 		 466 aa  97.4  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2825  Fis family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 466 aa  97.4  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.506795  normal  0.45265 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.42 
 
 		 448 aa  97.1  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1637  RND family efflux transporter MFP subunit  27.3 
 
 		 465 aa  96.7  6e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1059  macrolide transporter subunit MacA  26.05 
 
 		 372 aa  95.9  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.75011  normal  0.992508 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1672  RND family efflux transporter MFP subunit  27.06 
 
 		 429 aa  95.5  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3548  RND family efflux transporter MFP subunit  28.19 
 
 		 442 aa  95.5  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3038  secretion protein HlyD  26.58 
 
 		 403 aa  94.4  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000167095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1129  RND family efflux transporter MFP subunit  27.19 
 
 		 407 aa  94.4  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0365  membrane-fusion protein  23.75 
 
 		 394 aa  93.6  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0725  HlyD family secretion protein  26.89 
 
 		 397 aa  93.2  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.897812  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3185  secretion protein HlyD  27.76 
 
 		 446 aa  93.2  7e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1039  macrolide transporter subunit MacA  25.96 
 
 		 372 aa  93.2  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.303516  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0820  HlyD family secretion protein  23.73 
 
 		 405 aa  93.2  8e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0942  macrolide transporter subunit MacA  25.96 
 
 		 372 aa  92.8  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0800  RND family efflux transporter MFP subunit  23.82 
 
 		 416 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000642362  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0976  macrolide transporter subunit MacA  25.96 
 
 		 372 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0635  macrolide-specific efflux protein macA  26.37 
 
 		 390 aa  92  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0167041  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1395  macrolide transporter subunit MacA  26.52 
 
 		 371 aa  90.9  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.458807  normal  0.0347786 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0709  macrolide-specific efflux protein macA  25.97 
 
 		 390 aa  90.5  4e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0663  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.33 
 
 		 453 aa  90.5  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2831  syringolide efflux protein SyfC  24.87 
 
 		 383 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.580145  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1892  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.9 
 
 		 430 aa  90.5  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2041  secretion protein HlyD  26.59 
 
 		 398 aa  90.5  5e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2865  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.73 
 
 		 478 aa  90.1  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0716848 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3415  secretion protein HlyD  24.61 
 
 		 397 aa  90.1  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.89814  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4953  RND family efflux transporter MFP subunit  24.61 
 
 		 397 aa  90.1  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.162755  normal  0.0662922 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5333  RND family efflux transporter MFP subunit  24.61 
 
 		 397 aa  90.1  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.037024 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1706  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.42 
 
 		 430 aa  89.7  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.353178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3781  RND family efflux transporter MFP subunit  26.46 
 
 		 407 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1178  RND family efflux transporter MFP subunit  22.68 
 
 		 390 aa  88.6  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0161  RND family efflux transporter MFP subunit  24.23 
 
 		 380 aa  89.4  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00883  macrolide transporter subunit, membrane fusion protein (MFP) component  26.09 
 
 		 371 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2718  macrolide transporter subunit MacA  26.09 
 
 		 371 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0463  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.76 
 
 		 414 aa  88.2  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2451  macrolide transporter subunit MacA  26.09 
 
 		 371 aa  88.6  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00913289  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2282  macrolide transporter subunit MacA  26.09 
 
 		 371 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000339116  normal  0.0134871 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0951  macrolide transporter subunit MacA  26.09 
 
 		 371 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557503  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1080  MacA  23.14 
 
 		 394 aa  88.2  2e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1101  RND family efflux transporter MFP subunit  25.66 
 
 		 414 aa  88.6  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1008  macrolide transporter subunit MacA  25.41 
 
 		 372 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.622007  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00889  hypothetical protein  26.09 
 
 		 371 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2954  RND family efflux transporter MFP subunit  24.73 
 
 		 364 aa  88.2  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000249187  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  22.93 
 
 		 409 aa  88.2  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000285815  normal  0.0164702 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0982  macrolide transporter subunit MacA  26.09 
 
 		 371 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.44834  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2764  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.09 
 
 		 371 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.161658  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0607  RND family efflux transporter MFP subunit  24.74 
 
 		 406 aa  87.4  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2203  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.44 
 
 		 419 aa  87.8  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0635  RND family efflux transporter MFP subunit  24.74 
 
 		 406 aa  87.4  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.320707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1685  RND family efflux transporter MFP subunit  25.19 
 
 		 387 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1833  RND family efflux transporter MFP subunit  22.8 
 
 		 464 aa  87  4e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.36059  unclonable  0.000000000906287 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0832  RND family efflux transporter MFP subunit  23.82 
 
 		 416 aa  87.4  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000487508  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3233  RND family efflux transporter MFP subunit  25.14 
 
 		 405 aa  87.4  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000196171  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1970  secretion protein HlyD  26.94 
 
 		 390 aa  87  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0699832  normal  0.38447 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0307  RND family efflux transporter MFP subunit  25.89 
 
 		 413 aa  87  5e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0899354  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0067  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.08 
 
 		 453 aa  87  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2871  hypothetical protein  23.76 
 
 		 391 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.518674  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1039  macrolide transporter subunit MacA  26.09 
 
 		 371 aa  86.7  6e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.184306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33770  hypothetical protein  23.5 
 
 		 391 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.127582  hitchhiker  0.00383681 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2220  RND family efflux transporter MFP subunit  25.56 
 
 		 399 aa  86.3  8e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1064  macrolide-specific efflux protein macA  25.53 
 
 		 390 aa  86.3  8e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0267322  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1204  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.32 
 
 		 471 aa  86.3  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0563  secretion protein HlyD  22.55 
 
 		 456 aa  86.3  9e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1298  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.54 
 
 		 410 aa  85.9  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.61066  normal  0.83964 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2024  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.13 
 
 		 419 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000305818 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2617  secretion protein HlyD  23.58 
 
 		 385 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000106145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0573  macrolide secretion protein MacA  21.21 
 
 		 455 aa  85.1  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.00000000000123833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0825  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.82 
 
 		 410 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000019827  hitchhiker  0.00000000236896 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3168  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.84 
 
 		 430 aa  84.7  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.479459  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1857  secretion protein HlyD  24.86 
 
 		 390 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1339  RND family efflux transporter MFP subunit  23.3 
 
 		 384 aa  83.6  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4850  RND family efflux transporter MFP subunit  26.24 
 
 		 385 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3536  RND family efflux transporter MFP subunit  23.56 
 
 		 416 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000721535  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1532  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.07 
 
 		 415 aa  82.8  0.000000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2214  secretion protein HlyD  25.94 
 
 		 382 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3707  RND family efflux transporter MFP subunit  26.95 
 
 		 437 aa  82  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00914113 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1414  secretion protein HlyD  25.41 
 
 		 430 aa  82  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2236  secretion protein HlyD  22.28 
 
 		 404 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>