More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02792 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02792  response regulator  100 
 
 		 225 aa  462  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003062  DNA-binding response regulator  91.11 
 
 		 225 aa  429  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3630  two component transcriptional regulator  55.86 
 
 		 233 aa  276  2e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0712  two component transcriptional regulator  56.76 
 
 		 228 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0234002 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4252  two component transcriptional regulator  56.31 
 
 		 228 aa  268  5e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.542635  unclonable  0.0000000142406 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3317  two component transcriptional regulator  53.85 
 
 		 227 aa  258  6e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2661  two component transcriptional regulator  55.25 
 
 		 226 aa  257  9e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.36546 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1865  DNA-binding response regulator  48.4 
 
 		 223 aa  239  2e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1047  two component transcriptional regulator  46.4 
 
 		 231 aa  216  2e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04659  two-component system regulatory protein  48.86 
 
 		 237 aa  211  7.999999999999999e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184239  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0652  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.86 
 
 		 237 aa  211  7.999999999999999e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.174117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1508  response regulator receiver protein  47.95 
 
 		 237 aa  206  2e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1452  two component transcriptional regulator  47.95 
 
 		 237 aa  206  2e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2129  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.74 
 
 		 231 aa  203  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1162  putative two component system regulatory protein  44.59 
 
 		 233 aa  202  3e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24350  putative two-component response regulator  46.58 
 
 		 223 aa  201  6e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00112391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2062  putative two-component response regulator  46.12 
 
 		 272 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.658393  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4498  two component transcriptional regulator  47.98 
 
 		 227 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000234919 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3181  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.65 
 
 		 225 aa  198  3.9999999999999996e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0901  winged helix family two component transcriptional regulator  47.53 
 
 		 227 aa  198  5e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2992  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.09 
 
 		 237 aa  198  5e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785285  normal  0.0463811 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0969  two component transcriptional regulator  47.53 
 
 		 227 aa  198  5e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0722332 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0940  two component transcriptional regulator  47.53 
 
 		 227 aa  198  5e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4486  two component transcriptional regulator  47.53 
 
 		 227 aa  198  5e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.643247  normal  0.864162 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1244  two component transcriptional regulator  43.69 
 
 		 228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.683231 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17800  response regulator, transcriptional regulatory protein (two-component), ColR  46.82 
 
 		 227 aa  195  6e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0435874  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02303  two-component system regulatory protein  47.3 
 
 		 225 aa  193  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0146  response regulator receiver protein  44.29 
 
 		 219 aa  193  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4374  DNA-binding response regulator ColR  45.74 
 
 		 227 aa  191  7e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4070  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  45.74 
 
 		 227 aa  191  7e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0290724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2026  two component transcriptional regulator  46.85 
 
 		 225 aa  191  1e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117597  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1189  response regulator  44.84 
 
 		 229 aa  189  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2296  response regulator receiver domain-containing protein  41.18 
 
 		 222 aa  189  2.9999999999999997e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000621544 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2476  two component transcriptional regulator  44.2 
 
 		 227 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.210757  normal  0.512741 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0620  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.4 
 
 		 229 aa  189  4e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.222182 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4952  putative two-component response regulator  45.91 
 
 		 227 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56950  putative two-component response regulator  45.45 
 
 		 227 aa  188  7e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1931  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.55 
 
 		 227 aa  187  9e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04469  two-component system regulatory protein (response regulator) required for AvrXa21 activity R (raxR)  43.18 
 
 		 238 aa  187  1e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2251  two component transcriptional regulator  42.67 
 
 		 240 aa  187  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1726  two component signal transduction response regulator  45.5 
 
 		 227 aa  186  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000605334  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2524  DNA-binding response regulator  45.21 
 
 		 240 aa  182  4.0000000000000006e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185339  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0730  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.81 
 
 		 259 aa  181  9.000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.762765  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2721  DNA-binding response regulator  44.55 
 
 		 233 aa  180  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0809288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3676  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  40.67 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2611  two component transcriptional regulator  39.73 
 
 		 233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.438592 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2446  response regulator receiver domain-containing protein  38.64 
 
 		 224 aa  172  2.9999999999999996e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.28656 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  44.04 
 
 		 223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3798  two component transcriptional regulator  41.74 
 
 		 225 aa  172  5e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4623  DNA-binding response regulator  40.83 
 
 		 225 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0706  two component transcriptional regulator  42.41 
 
 		 233 aa  170  1e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3440  response regulator receiver domain-containing protein  41.18 
 
 		 246 aa  169  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000281357 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4328  two component transcriptional regulator  40.83 
 
 		 225 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4196  two component transcriptional regulator  40.83 
 
 		 225 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001593  putative two-component response regulator  39.01 
 
 		 222 aa  168  5e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000660606  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4007  two component transcriptional regulator  40.83 
 
 		 225 aa  168  6e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1974  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  39.37 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.667108 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2809  two component transcriptional regulator  39.82 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.302841  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2643  DNA-binding response regulator  40.99 
 
 		 233 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0105126  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3011  two component transcriptional regulator  40.36 
 
 		 222 aa  167  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.239282  normal  0.458357 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0335  two component transcriptional regulator  38.57 
 
 		 222 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000018466  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0418  two-component system response regulator  36.65 
 
 		 221 aa  166  4e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.815166  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05570  hypothetical protein  39.01 
 
 		 242 aa  165  5e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3577  two component transcriptional regulator  40.83 
 
 		 224 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0102  response regulator receiver protein  39.29 
 
 		 222 aa  164  8e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.294663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1842  two component transcriptional regulator  38.39 
 
 		 240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4527  two component transcriptional regulator  38.22 
 
 		 226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2375  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  40.27 
 
 		 235 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277723  normal  0.133946 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3674  two component transcriptional regulator  40.91 
 
 		 263 aa  162  4.0000000000000004e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.400914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0943  two component transcriptional regulator  38.74 
 
 		 223 aa  162  5.0000000000000005e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0172896  normal  0.994999 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4637  DNA-binding response regulator  39.37 
 
 		 222 aa  161  9e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5468  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.01 
 
 		 223 aa  159  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3078  two component transcriptional regulator  38.12 
 
 		 234 aa  159  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1442  two component transcriptional regulator  38.12 
 
 		 230 aa  158  6e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3442  two component transcriptional regulator  37.67 
 
 		 241 aa  157  9e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.297648  normal  0.0871248 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1233  two component transcriptional regulator  37.56 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0535  two component transcriptional regulator  44.04 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.660155  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2141  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.67 
 
 		 241 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.316028  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3423  response regulator receiver protein  38.81 
 
 		 224 aa  156  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.699539  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2012  winged helix family two component transcriptional regulator  37.22 
 
 		 241 aa  155  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal  0.606644 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2104  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.82 
 
 		 225 aa  155  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0450  two component transcriptional regulator  39.37 
 
 		 227 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0998  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.84 
 
 		 223 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4261  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.54 
 
 		 224 aa  154  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.906422  normal  0.0109867 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0944  two component transcriptional regulator  37.22 
 
 		 225 aa  154  8e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.091613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4222  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.54 
 
 		 224 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5481  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.17 
 
 		 228 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537932  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  37.5 
 
 		 224 aa  152  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1370  two component response regulator  37.9 
 
 		 252 aa  152  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0275  two component transcriptional regulator  36.73 
 
 		 228 aa  152  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0264375 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1196  two-component transcriptional regulator  37.22 
 
 		 238 aa  152  5e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2409  two component transcriptional regulator  36.49 
 
 		 226 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.615174  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2907  winged helix family two component transcriptional regulator  36.49 
 
 		 226 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00514074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9846  two component response regulator  35.29 
 
 		 225 aa  151  5.9999999999999996e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2666  two component transcriptional regulator  38.12 
 
 		 255 aa  151  5.9999999999999996e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.128945  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2784  two component transcriptional regulator  36.49 
 
 		 226 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 224 aa  151  7e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3517  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 238 aa  151  8.999999999999999e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423488  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3888  two component transcriptional regulator  36.2 
 
 		 223 aa  151  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.130623  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2876  two component transcriptional regulator  36.49 
 
 		 226 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.5251  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>