More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02650 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003772  Na+ driven multidrug efflux pump  85.31 
 
 		 458 aa  774    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02650  hypothetical protein  100 
 
 		 458 aa  916    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1237  hypothetical protein  71.99 
 
 		 458 aa  650    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0290804  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2022  multidrug efflux pump  63.38 
 
 		 459 aa  612  9.999999999999999e-175  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.54695  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05715  Na+-driven multidrug efflux pump  33.11 
 
 		 461 aa  269  8.999999999999999e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000109  adhesin  35.1 
 
 		 461 aa  268  1e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.466925  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0830  MATE efflux family protein  36.38 
 
 		 445 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000918772  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2766  MATE efflux family protein  32.23 
 
 		 453 aa  241  2e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0984562  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0279  MATE efflux family protein  33.56 
 
 		 445 aa  236  6e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2828  MATE efflux family protein  30.72 
 
 		 463 aa  229  1e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2514  MATE efflux family protein  30.72 
 
 		 463 aa  229  1e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0537  hypothetical protein  32.03 
 
 		 460 aa  227  4e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0621  MATE efflux family protein  32.07 
 
 		 460 aa  219  1e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.27098  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0330  MATE efflux family protein  31.3 
 
 		 479 aa  212  9e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3712  MATE efflux family protein  33.26 
 
 		 454 aa  209  9e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139203  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0857  MATE efflux family protein  29.36 
 
 		 458 aa  208  2e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0848  MATE efflux family protein  29.14 
 
 		 458 aa  208  2e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.720761  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1981  MATE efflux family protein  30.84 
 
 		 455 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0522  MATE efflux family protein  28.96 
 
 		 461 aa  196  1e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0897  MATE efflux family protein  29.82 
 
 		 453 aa  192  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000262958  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1138  MATE efflux family protein  27.48 
 
 		 450 aa  179  9e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000318212  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1116  MATE efflux family protein  25.96 
 
 		 456 aa  175  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0743  MATE efflux family protein  25.6 
 
 		 484 aa  140  4.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000192336  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0994  MATE efflux family protein  24.78 
 
 		 449 aa  140  6e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0691  MATE efflux family protein  26.42 
 
 		 450 aa  130  6e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0981  MATE efflux family protein  26.8 
 
 		 456 aa  126  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.730082  normal  0.0880752 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  27.31 
 
 		 450 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  23.8 
 
 		 464 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000923462  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4103  Na+ driven multidrug efflux pump  23.92 
 
 		 463 aa  110  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0660054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1506  MATE efflux family protein  24.45 
 
 		 450 aa  109  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1106  MATE efflux family protein  23.92 
 
 		 464 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1088  efflux protein  23.92 
 
 		 464 aa  108  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000024435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  23.92 
 
 		 464 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0764  MATE family efflux pump NorM  27.86 
 
 		 451 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1196  MATE efflux family protein  23.92 
 
 		 464 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000655029  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1305  MATE efflux family protein  23.92 
 
 		 464 aa  107  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.40401  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2423  MATE efflux family protein  27.86 
 
 		 451 aa  108  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0441886  normal  0.25868 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2425  MATE efflux family protein  23.25 
 
 		 461 aa  107  5e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.264518  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1266  MATE efflux family protein  23.92 
 
 		 464 aa  107  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1239  MATE efflux family protein  23.46 
 
 		 464 aa  107  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0650  MATE efflux family protein  28.54 
 
 		 458 aa  107  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  24.89 
 
 		 445 aa  107  6e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1343  MATE efflux family protein  23.92 
 
 		 464 aa  106  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000317655  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0596  hypothetical protein  27.55 
 
 		 449 aa  106  8e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.207285  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  27.25 
 
 		 438 aa  106  9e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0901  MATE efflux family protein  24.32 
 
 		 463 aa  106  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000627796  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2630  MATE efflux family protein  24.55 
 
 		 472 aa  105  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.850794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 458 aa  101  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1767  MATE efflux family protein  26.42 
 
 		 462 aa  100  7e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0411  MATE efflux family protein  26.82 
 
 		 453 aa  100  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  24.56 
 
 		 475 aa  99.4  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0299  MATE efflux family protein  23.95 
 
 		 456 aa  98.2  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  23.38 
 
 		 461 aa  96.7  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  24.35 
 
 		 446 aa  95.5  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3760  MATE efflux family protein  24.16 
 
 		 464 aa  95.1  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  25.31 
 
 		 452 aa  95.5  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  25.25 
 
 		 464 aa  94.4  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  25.25 
 
 		 464 aa  94.4  4e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1109  multidrug efflux protein  24.58 
 
 		 452 aa  94.4  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.654532  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1930  MATE efflux family protein  24.88 
 
 		 460 aa  94  6e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.135248  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1267  multidrug efflux protein  26.6 
 
 		 453 aa  93.2  8e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1269  multidrug efflux protein  26.37 
 
 		 453 aa  93.2  8e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.801506  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1501  multidrug efflux protein  26.02 
 
 		 454 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1295  multidrug efflux protein  26.06 
 
 		 453 aa  92.8  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0578421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1402  multidrug efflux protein  26.06 
 
 		 453 aa  92.8  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1472  multidrug efflux protein  25.83 
 
 		 453 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  25.23 
 
 		 459 aa  92.4  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3909  multidrug efflux protein  25.54 
 
 		 452 aa  92  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  22.76 
 
 		 462 aa  89.4  1e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1435  multidrug efflux protein  25.3 
 
 		 452 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.602082  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  24.89 
 
 		 468 aa  88.6  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000678206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09173  MATE efflux family protein  24.22 
 
 		 457 aa  89  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  24.24 
 
 		 461 aa  89  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  22.25 
 
 		 462 aa  88.6  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  25.9 
 
 		 468 aa  87.8  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1304  multidrug efflux protein  25.9 
 
 		 452 aa  87.4  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  21.83 
 
 		 453 aa  87  7e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0686  MATE efflux family protein  26.01 
 
 		 498 aa  85.9  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.221481  normal  0.278001 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1541  MATE efflux family protein  25.71 
 
 		 486 aa  85.9  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2122  multi anti extrusion protein MatE  24.22 
 
 		 450 aa  85.9  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000217461  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18490  MATE efflux family protein  21.72 
 
 		 442 aa  85.5  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000174233  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0850  MATE efflux family protein  32.35 
 
 		 439 aa  85.1  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.313022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  24.62 
 
 		 475 aa  84.3  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0645  DcuC protein  23.94 
 
 		 439 aa  84.3  0.000000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  23.68 
 
 		 477 aa  84  0.000000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  25.81 
 
 		 453 aa  83.6  0.000000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  20.99 
 
 		 448 aa  83.2  0.000000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  22.3 
 
 		 469 aa  83.2  0.000000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1415  MATE efflux family protein  26.5 
 
 		 466 aa  83.2  0.000000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.167041 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0723  multidrug resistance protein  22.65 
 
 		 454 aa  82.4  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000940  Na+ driven multidrug efflux pump  25.17 
 
 		 446 aa  81.6  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000926882  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1225  multidrug efflux pump, NorM, MATE family  25.17 
 
 		 455 aa  82  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000329619  normal  0.0233556 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1856  multidrug efflux protein  22.01 
 
 		 455 aa  82  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.30191  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06935  Na+-driven multidrug efflux pump  23.76 
 
 		 446 aa  82.4  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2475  MATE efflux family protein  20.22 
 
 		 463 aa  81.3  0.00000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.211957  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2355  MATE efflux family protein  27.71 
 
 		 449 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0530772  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0536  mate efflux family protein  24.84 
 
 		 440 aa  81.3  0.00000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3993  MATE efflux family protein  24.38 
 
 		 447 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2967  MATE efflux family protein  24.46 
 
 		 467 aa  80.5  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0284207 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1841  MATE efflux family protein  25.74 
 
 		 469 aa  80.5  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>