97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02587 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02587  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  296  4e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0246  hypothetical protein  39.69 
 
 
176 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.643536  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3533  hypothetical protein  36.17 
 
 
175 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3352  protein YqkA  38.93 
 
 
176 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.584125  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1757  hypothetical protein  35.77 
 
 
178 aa  79.3  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.334844  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2797  hypothetical protein  34.35 
 
 
174 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3312  hypothetical protein  34.75 
 
 
175 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.488113  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3572  hypothetical protein  34.75 
 
 
175 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.770902  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3527  hypothetical protein  34.75 
 
 
175 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.283769  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1029  hypothetical protein  36.7 
 
 
174 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3512  hypothetical protein  32.37 
 
 
175 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1699  glutamate-rich protein  35.16 
 
 
187 aa  73.6  0.0000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.492225  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3527  hypothetical protein  34.06 
 
 
147 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00787639 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0069  hypothetical protein  36.43 
 
 
319 aa  73.6  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0490  hypothetical protein  35.16 
 
 
176 aa  73.2  0.000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000708419  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0096  protein of unknown function UPF0157  40 
 
 
157 aa  73.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4131  hypothetical protein  36.11 
 
 
166 aa  73.2  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0157  hypothetical protein  36.22 
 
 
176 aa  72  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3854  hypothetical protein  32.82 
 
 
174 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0669413  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4167  hypothetical protein  34.86 
 
 
174 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4231  hypothetical protein  34.86 
 
 
174 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4122  hypothetical protein  35.78 
 
 
174 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000502842 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4320  hypothetical protein  35.78 
 
 
174 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4007  hypothetical protein  35.78 
 
 
174 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.298552  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0204  protein of unknown function UPF0157  35.61 
 
 
178 aa  70.5  0.000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3840  hypothetical protein  35.78 
 
 
174 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2507  protein of unknown function UPF0157  32.28 
 
 
171 aa  70.1  0.000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.309459  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3929  hypothetical protein  33.94 
 
 
174 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.283485  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1409  hypothetical protein  37.17 
 
 
318 aa  68.6  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1584  hypothetical protein  37.17 
 
 
318 aa  68.2  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2758  hypothetical protein  36.54 
 
 
170 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.459788  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2349  protein of unknown function UPF0157  32.09 
 
 
220 aa  68.2  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4208  hypothetical protein  34.86 
 
 
174 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2831  hypothetical protein  34.07 
 
 
183 aa  67.8  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00971649  normal  0.206362 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2505  hypothetical protein  36.84 
 
 
169 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.491637 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2542  hypothetical protein  38.24 
 
 
169 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000082072  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2738  hypothetical protein  35.29 
 
 
176 aa  66.6  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0940497  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2583  hypothetical protein  33.83 
 
 
169 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.137167  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_184  hypothetical protein  34.65 
 
 
176 aa  65.1  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.682808  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2508  hypothetical protein  36.76 
 
 
169 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2784  glutamate-rich protein GrpB  37.5 
 
 
150 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0346281 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3224  hypothetical protein  29.71 
 
 
178 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2788  hypothetical protein  35.34 
 
 
169 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4412  protein of unknown function UPF0157  35.29 
 
 
166 aa  64.3  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2828  hypothetical protein  36.09 
 
 
169 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.117917  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3138  hypothetical protein  40.57 
 
 
171 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2591  hypothetical protein  34.59 
 
 
169 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.12292  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2779  hypothetical protein  34.59 
 
 
169 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0119576  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2809  protein of unknown function UPF0157  30.94 
 
 
406 aa  62.4  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2000  hypothetical protein  33.33 
 
 
193 aa  62  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02640  hypothetical protein  32.59 
 
 
158 aa  62  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.451354  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2807  hypothetical protein  34.59 
 
 
172 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.062321  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1708  hypothetical protein  29.8 
 
 
192 aa  61.2  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2849  hypothetical protein  32.09 
 
 
183 aa  60.8  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0276112  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2637  glutamate-rich protein GrpB  30.83 
 
 
167 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000727014 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0322  protein of unknown function UPF0157  30.71 
 
 
173 aa  58.5  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.169012  normal  0.0199822 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2671  glutamate-rich protein GrpB  30.83 
 
 
169 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.267173  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1290  protein of unknown function UPF0157  33.08 
 
 
375 aa  58.5  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2714  hypothetical protein  30.83 
 
 
170 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.590886  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3326  protein of unknown function UPF0157  33.1 
 
 
211 aa  57.8  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2673  hypothetical protein  30.08 
 
 
169 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00128043  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2494  hypothetical protein  31.58 
 
 
172 aa  55.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.021339  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2428  hypothetical protein  30.08 
 
 
170 aa  55.5  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000686386  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1089  hypothetical protein  29.86 
 
 
601 aa  55.1  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0552  hypothetical protein  30.77 
 
 
347 aa  55.1  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0906  hypothetical protein  30.71 
 
 
188 aa  54.7  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4207  protein of unknown function UPF0157  29.01 
 
 
198 aa  54.3  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.573704  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2751  protein of unknown function UPF0157  32.17 
 
 
221 aa  53.5  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2663  hypothetical protein  29.32 
 
 
170 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000853592 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2646  hypothetical protein  29.32 
 
 
170 aa  53.5  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2465  hypothetical protein  29.32 
 
 
170 aa  53.5  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.884514  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06714  hypothetical protein  34.31 
 
 
173 aa  53.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0920  hypothetical protein  30.88 
 
 
169 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63380  hypothetical protein  30.94 
 
 
242 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.903165  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3103  hypothetical protein  32.03 
 
 
171 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0343219  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2329  hypothetical protein  32.59 
 
 
173 aa  50.8  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.177131  normal  0.089639 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2389  hypothetical protein  28.57 
 
 
170 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00719854  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1655  protein of unknown function UPF0157  31.58 
 
 
191 aa  50.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4110  protein of unknown function UPF0157  31.06 
 
 
170 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12290  hypothetical protein  32.32 
 
 
188 aa  49.3  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1571  hypothetical protein  31.88 
 
 
365 aa  48.9  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.332111  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2072  protein of unknown function UPF0157  27.05 
 
 
194 aa  48.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1247  protein of unknown function UPF0157  32.06 
 
 
197 aa  48.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2985  hypothetical protein  29.77 
 
 
181 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0439608 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3226  hypothetical protein  38.1 
 
 
68 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2990  protein of unknown function UPF0157  30.77 
 
 
171 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.377938  normal  0.0790959 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3053  protein of unknown function UPF0157  28.46 
 
 
194 aa  46.2  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2708  hypothetical protein  29.01 
 
 
171 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.95734  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25790  hypothetical protein  30.15 
 
 
188 aa  45.1  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0605  protein of unknown function UPF0157  28.15 
 
 
185 aa  44.7  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2729  protein of unknown function UPF0157  28.47 
 
 
170 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.208995  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3227  hypothetical protein  36.84 
 
 
110 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12970  hypothetical protein  28.93 
 
 
201 aa  42.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0759  protein of unknown function UPF0157  29.29 
 
 
190 aa  41.6  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0641  protein of unknown function UPF0157  27.27 
 
 
347 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000199394  unclonable  0.000000000137407 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2195  hypothetical protein  28.74 
 
 
451 aa  40.8  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00243067  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1418  hypothetical protein  26.15 
 
 
173 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.803078  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>