204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02436 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02436  hypothetical protein  100 
 
 		 395 aa  805    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003316  ABC-type multidrug transport system permease component  80.76 
 
 		 362 aa  622  1e-177  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1213  hypothetical protein  60.27 
 
 		 387 aa  451  1.0000000000000001e-126  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0148967  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1841  hypothetical protein  45.17 
 
 		 395 aa  324  1e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0619  membrane protein  38.12 
 
 		 378 aa  262  6.999999999999999e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0476  hypothetical protein  37.64 
 
 		 372 aa  242  1e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.985148  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0395  hypothetical protein  38.12 
 
 		 371 aa  237  3e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4088  hypothetical protein  35.79 
 
 		 435 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0528  ABC-2 type transporter  35.29 
 
 		 405 aa  205  9e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0489  ABC-2 type transporter  35.48 
 
 		 429 aa  205  1e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3812  ABC-2 type transporter  35.29 
 
 		 430 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188014  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3638  ABC-2 type transporter  35.01 
 
 		 431 aa  204  3e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3462  ABC-2 type transporter  35.48 
 
 		 429 aa  203  5e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3728  hypothetical protein  32.78 
 
 		 390 aa  195  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0507  ABC-2 type transporter  35.29 
 
 		 430 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0532  ABC-2 type transporter  35.37 
 
 		 405 aa  194  3e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0413  ABC-2 type transporter  33.69 
 
 		 390 aa  192  9e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.425702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0479  hypothetical protein  33.8 
 
 		 375 aa  192  1e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.168605 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3744  ABC-2 type transporter  34.2 
 
 		 387 aa  189  7e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0568  ABC-2 type transporter  33.6 
 
 		 387 aa  189  8e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.094665 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0584  ABC-2 type transporter  34.01 
 
 		 408 aa  188  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4392  ABC-2 type transporter  32.19 
 
 		 384 aa  176  4e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.140219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1025  ABC-2 type transporter  28.11 
 
 		 391 aa  153  4e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4807  putative permease component of ABC transporter  29.02 
 
 		 402 aa  149  6e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459012  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1038  hypothetical protein  27.18 
 
 		 434 aa  137  2e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2702  ABC-2 type transporter  27.35 
 
 		 780 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4570  ABC-2 type transporter  29.1 
 
 		 417 aa  128  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0597  hypothetical protein  25.81 
 
 		 383 aa  123  6e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0092  transporter, putative  25.94 
 
 		 379 aa  118  1.9999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0602598 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1172  ABC-2 type transporter  27.84 
 
 		 395 aa  117  3.9999999999999997e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20100  hypothetical protein  28.14 
 
 		 390 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.944312 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1729  hypothetical protein  27.87 
 
 		 390 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.285921  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0596  ABC-2 type transporter  30.77 
 
 		 395 aa  99.8  8e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0652  hypothetical protein  29.02 
 
 		 491 aa  95.5  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0992  ABC-2 type transporter  27.79 
 
 		 391 aa  92.8  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1037  hypothetical protein  26.58 
 
 		 397 aa  92  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3062  ABC-2 type transporter  23.65 
 
 		 376 aa  90.5  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.191967  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2330  hypothetical protein  23.77 
 
 		 379 aa  85.5  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0500  ABC-2 type transporter  24.92 
 
 		 384 aa  85.1  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1422  ABC-2 type transporter  24.47 
 
 		 373 aa  82  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  22.85 
 
 		 371 aa  82  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1551  ABC-2 type transporter  24.12 
 
 		 373 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2831  ABC-2 type transporter  23.82 
 
 		 373 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1524  ABC-2 type transporter  23.82 
 
 		 373 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1515  ABC-2 type transporter  23.82 
 
 		 373 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  25.22 
 
 		 378 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  25.3 
 
 		 365 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000431089  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4569  ABC-2 type transporter  26.8 
 
 		 377 aa  77.4  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  22.44 
 
 		 379 aa  76.6  0.0000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2640  ABC-2 type transporter  23.65 
 
 		 373 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  23.84 
 
 		 381 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1926  ABC-2 type transporter  23.88 
 
 		 389 aa  75.5  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0215511 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  23.16 
 
 		 367 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2748  ABC-2 type transporter  23.65 
 
 		 373 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0651  ABC-2 type transporter  24.64 
 
 		 496 aa  74.7  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1707  ABC transporter, permease protein, putative  23.14 
 
 		 373 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0181  ABC-type multidrug transport system permease component  20.71 
 
 		 382 aa  74.3  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0315878  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3454  hypothetical protein  22.45 
 
 		 374 aa  73.6  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  24.4 
 
 		 375 aa  73.2  0.000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1842  hypothetical protein  27.01 
 
 		 395 aa  72.4  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2573  ABC-2 type transporter  23.39 
 
 		 373 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0620  ABC-2 type transporter  24.7 
 
 		 378 aa  72  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4391  ABC-2 type transporter  28.74 
 
 		 384 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.567246  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  21.94 
 
 		 381 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  22.16 
 
 		 382 aa  68.9  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003315  ABC-type multidrug transport system permease component  25.16 
 
 		 383 aa  68.6  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0458  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 378 aa  67.4  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0334022  normal  0.108602 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0719  hypothetical protein  23.88 
 
 		 385 aa  67.4  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.348943  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1248  ABC transporter, permease protein  21.99 
 
 		 382 aa  67  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1214  hypothetical protein  24.16 
 
 		 382 aa  64.7  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0247305  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0091  transporter, putative  25.82 
 
 		 405 aa  64.3  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.060558 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0480  hypothetical protein  24.7 
 
 		 386 aa  63.9  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.292724 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4087  hypothetical protein  27.98 
 
 		 378 aa  63.5  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3461  ABC-2 type transporter  27.61 
 
 		 383 aa  63.5  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0490  hypothetical protein  27.61 
 
 		 383 aa  63.5  0.000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1082  ABC-2 type transport system permease protein  24.15 
 
 		 378 aa  63.2  0.000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3637  hypothetical protein  27.61 
 
 		 383 aa  63.2  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0585  ABC-2 type transporter  27.98 
 
 		 382 aa  63.2  0.000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2779  ABC-2 type transporter  24.59 
 
 		 405 aa  62.8  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  23.06 
 
 		 376 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  21.47 
 
 		 382 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1024  hypothetical protein  25.14 
 
 		 293 aa  62  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  23.17 
 
 		 384 aa  62  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02437  hypothetical protein  24.53 
 
 		 383 aa  61.6  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0475  ABC-2 type transporter  25.68 
 
 		 392 aa  62  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0873  ABC-2 type transporter  24.2 
 
 		 380 aa  61.6  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.344098 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0081  ABC transporter related  24.68 
 
 		 911 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111976  normal  0.167025 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  22.02 
 
 		 376 aa  60.8  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  23.72 
 
 		 366 aa  60.8  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0529  ABC-2 type transporter  27.54 
 
 		 381 aa  60.5  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  20.27 
 
 		 388 aa  60.5  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3811  ABC-2 type transporter  27.11 
 
 		 383 aa  60.5  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4310  ABC-2 type transporter  22.52 
 
 		 390 aa  60.1  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1794  hypothetical protein  22.99 
 
 		 390 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.0000152274  normal  0.41124 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  21.6 
 
 		 369 aa  59.3  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0533  ABC-2 type transporter  26.51 
 
 		 379 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001402  ABC-type multidrug transport system permease component  22.06 
 
 		 366 aa  58.9  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1171  hypothetical protein  27.22 
 
 		 375 aa  58.2  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  20.28 
 
 		 380 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  20.65 
 
 		 387 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>