157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02365 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02365  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  426  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003413  putative TEGT family carrier/transport protein  95 
 
 		 220 aa  412  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000444328  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2053  inner membrane protein  83.18 
 
 		 220 aa  362  2e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0952289  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2846  hypothetical protein  60.38 
 
 		 219 aa  248  4e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0018864  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2537  hypothetical protein  60.38 
 
 		 219 aa  247  9e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0345189  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2673  protein of unknown function UPF0005  57.48 
 
 		 219 aa  239  2e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000665712  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2148  hypothetical protein  57.48 
 
 		 219 aa  239  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0598762  normal  0.366892 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0330  integral membrane protein  59.24 
 
 		 220 aa  239  2e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000128049  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2626  hypothetical protein  57.48 
 
 		 219 aa  239  2e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0636098  hitchhiker  0.0000185004 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2345  hypothetical protein  57.01 
 
 		 219 aa  239  2e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0311475  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1078  hypothetical protein  57.48 
 
 		 219 aa  239  2e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000486786  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1084  hypothetical protein  57.48 
 
 		 219 aa  239  2e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000421704  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00974  inner membrane protein  57.01 
 
 		 219 aa  238  4e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0511489  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00981  hypothetical protein  57.01 
 
 		 219 aa  238  4e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0860489  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1135  hypothetical protein  57.48 
 
 		 219 aa  238  5e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.53324  normal  0.675558 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1043  hypothetical protein  59.11 
 
 		 219 aa  233  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.598631  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1126  hypothetical protein  59.11 
 
 		 219 aa  233  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.21152e-22 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1160  hypothetical protein  59.11 
 
 		 219 aa  233  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.572482  normal  0.332109 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1194  hypothetical protein  59.11 
 
 		 219 aa  233  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1482  hypothetical protein  56.07 
 
 		 245 aa  233  1.0000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00851236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1148  hypothetical protein  59.11 
 
 		 219 aa  233  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.466231  normal  0.361481 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2686  protein of unknown function UPF0005  55.19 
 
 		 219 aa  223  2e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1221  protein of unknown function UPF0005  53.27 
 
 		 219 aa  221  6e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3246  hypothetical protein  51.16 
 
 		 217 aa  209  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000289843  hitchhiker  0.0000576794 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1767  hypothetical protein  57.64 
 
 		 219 aa  209  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000691139  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2376  hypothetical protein  52.61 
 
 		 222 aa  209  3e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.128059  normal  0.023918 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0489  hypothetical protein  50.45 
 
 		 221 aa  207  8e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1630  hypothetical protein  50 
 
 		 223 aa  206  3e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.068558  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28110  hypothetical protein  50.45 
 
 		 223 aa  200  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30410  hypothetical protein  49.77 
 
 		 222 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3333  hypothetical protein  50 
 
 		 223 aa  198  7e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.722624  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3164  hypothetical protein  50 
 
 		 223 aa  198  7e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.30239 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3403  protein of unknown function UPF0005  51.18 
 
 		 221 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2604  hypothetical protein  49.32 
 
 		 222 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.50496  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1618  integral membrane protein  48.85 
 
 		 217 aa  194  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000000193362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2487  hypothetical protein  48.6 
 
 		 223 aa  193  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0234713  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3990  hypothetical protein  48.82 
 
 		 223 aa  191  9e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0132572 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1842  hypothetical protein  48.82 
 
 		 223 aa  191  9e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016223 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3596  hypothetical protein  48.82 
 
 		 223 aa  191  9e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.351056 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3395  hypothetical protein  48.13 
 
 		 223 aa  189  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.912483  normal  0.775889 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1011  hypothetical protein  54.55 
 
 		 224 aa  187  9e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0978  hypothetical protein  54.55 
 
 		 224 aa  187  9e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1927  hypothetical protein  49.29 
 
 		 222 aa  185  4e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.199344  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2350  hypothetical protein  48.2 
 
 		 222 aa  185  5e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0554095  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1308  hypothetical protein  51.22 
 
 		 225 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1726  hypothetical protein  45.97 
 
 		 238 aa  177  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.327418 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0971  hypothetical protein  46.4 
 
 		 223 aa  172  3.9999999999999995e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000502235  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1518  hypothetical protein  45.79 
 
 		 233 aa  169  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.884646  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1654  hypothetical protein  50.24 
 
 		 222 aa  167  8e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000000000318402  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2200  hypothetical protein  42.99 
 
 		 219 aa  166  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.581022  normal  0.150789 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2451  hypothetical protein  44.81 
 
 		 222 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000005036  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2166  hypothetical protein  41.98 
 
 		 219 aa  152  5e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000169017  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0466  protein of unknown function UPF0005  41.67 
 
 		 221 aa  151  7e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1391  hypothetical protein  49.28 
 
 		 226 aa  151  7e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2201  protein of unknown function UPF0005  41.98 
 
 		 219 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000806989  normal  0.147893 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2205  hypothetical protein  41.98 
 
 		 219 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000321186  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2136  hypothetical protein  41.98 
 
 		 219 aa  150  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0452556  normal  0.017863 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2313  hypothetical protein  41.98 
 
 		 219 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000688522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2473  hypothetical protein  42.92 
 
 		 219 aa  149  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000529364  hitchhiker  0.00138122 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2111  hypothetical protein  40.18 
 
 		 220 aa  149  4e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000565103  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2375  hypothetical protein  40.57 
 
 		 219 aa  148  5e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2001  hypothetical protein  41.04 
 
 		 219 aa  148  6e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000304908  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1973  hypothetical protein  40.09 
 
 		 219 aa  148  7e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000288339  normal  0.569668 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2060  hypothetical protein  40.09 
 
 		 219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00317153  hitchhiker  0.0000338815 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1809  hypothetical protein  42.23 
 
 		 219 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000169879  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2014  hypothetical protein  44.44 
 
 		 219 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000147608  hitchhiker  0.00304334 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2003  hypothetical protein  39.62 
 
 		 219 aa  145  5e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.026814  hitchhiker  0.000326951 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1804  hypothetical protein  42.79 
 
 		 219 aa  144  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.372462  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1782  hypothetical protein  39.81 
 
 		 218 aa  143  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.104064  normal  0.0481152 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0896  protein of unknown function UPF0005  39.35 
 
 		 229 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.723604 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1202  carrier/transport protein  41.95 
 
 		 222 aa  135  5e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3056  hypothetical protein  37.33 
 
 		 229 aa  126  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1054  protein of unknown function UPF0005  35.68 
 
 		 233 aa  124  9e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.698213  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1146  protein of unknown function UPF0005  35.68 
 
 		 233 aa  123  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39216  normal  0.517284 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1784  hypothetical protein  35.94 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4627  hypothetical protein  38.03 
 
 		 230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000408248 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2411  hypothetical protein  37.5 
 
 		 230 aa  119  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.411936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1437  protein of unknown function UPF0005  37.5 
 
 		 230 aa  119  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3316  hypothetical protein  37.04 
 
 		 230 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.2042  normal  0.782956 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1210  hypothetical protein  34.8 
 
 		 233 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1424  hypothetical protein  34.53 
 
 		 232 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.170635  normal  0.0981664 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2825  hypothetical protein  35.22 
 
 		 231 aa  117  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2776  hypothetical protein  36.62 
 
 		 231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2573  hypothetical protein  34.07 
 
 		 230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0057629  decreased coverage  0.000137367 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2359  hypothetical protein  34.53 
 
 		 232 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.372177  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2230  hypothetical protein  34.53 
 
 		 232 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2194  hypothetical protein  34.53 
 
 		 232 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.259485  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2232  hypothetical protein  34.53 
 
 		 232 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0363  hypothetical protein  37.85 
 
 		 234 aa  115  6e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000375584  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1349  hypothetical protein  34.53 
 
 		 232 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1839  hypothetical protein  34.53 
 
 		 232 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0058  hypothetical protein  34.53 
 
 		 232 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143946  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1111  hypothetical protein  34.53 
 
 		 232 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1257  hypothetical protein  35.98 
 
 		 231 aa  113  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0923659 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1802  protein of unknown function UPF0005  35.71 
 
 		 233 aa  112  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5117  hypothetical protein  33.18 
 
 		 232 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0409876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3069  hypothetical protein  33.64 
 
 		 231 aa  111  9e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0838324  normal  0.177428 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1294  hypothetical protein  33.91 
 
 		 233 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000365925  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1727  hypothetical protein  32.74 
 
 		 232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.593403  normal  0.215205 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1754  hypothetical protein  32.74 
 
 		 232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>