66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02291 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02291  hypothetical protein  100 
 
 
278 aa  582  1.0000000000000001e-165  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003479  putative Bax protein  82.48 
 
 
237 aa  414  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000155833  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1041  putative bax protein  52.91 
 
 
267 aa  243  3e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000364921  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1578  putative lipoprotein  50.45 
 
 
245 aa  233  3e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.690527  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2119  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  45.38 
 
 
270 aa  205  6e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0221355 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2018  bax protein, putative  45.38 
 
 
270 aa  205  6e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000556975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1957  bax protein, putative  45.81 
 
 
270 aa  204  1e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00816539 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2158  bax protein, putative  42.07 
 
 
270 aa  202  7e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0789235  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2208  bax protein, putative  42.07 
 
 
270 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000122169  normal  0.255336 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4499  hypothetical protein  42.07 
 
 
270 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2213  bax protein, putative  42.07 
 
 
270 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0162368  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1947  bax protein, putative  46.64 
 
 
270 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2226  bax protein, putative  41.7 
 
 
270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000811011  normal  0.0812518 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1997  bax protein, putative  45.69 
 
 
290 aa  199  3e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.300884  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2352  bax protein, putative  45.13 
 
 
255 aa  199  5e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2691  hypothetical protein  43.82 
 
 
310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2413  Bax protein, putative  44.54 
 
 
275 aa  191  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000013158 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2223  Bax protein, putative  44.84 
 
 
275 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2226  Bax protein, putative  40.08 
 
 
275 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.120609  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2022  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  39.26 
 
 
272 aa  182  7e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.29202  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2975  putative bax protein  43.11 
 
 
293 aa  181  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0400  bax protein, putative  41.03 
 
 
259 aa  176  5e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.342974  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3496  lysozyme subfamily protein  42.98 
 
 
288 aa  174  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0239929  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1803  bax protein, putative  41.15 
 
 
290 aa  170  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.499418 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2128  hypothetical protein  44.34 
 
 
294 aa  170  3e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.419683  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2061  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  42.92 
 
 
286 aa  166  4e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3912  hypothetical protein  41.41 
 
 
304 aa  166  4e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1179  hypothetical protein  40 
 
 
330 aa  159  7e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03942  uncharacterized FlgJ-related protein  38.21 
 
 
250 aa  154  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0978  uncharacterized FlgJ-related protein-like protein  37.75 
 
 
354 aa  132  5e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00771467  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0684  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  39.6 
 
 
320 aa  130  4.0000000000000003e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0161528  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3159  uncharacterized FlgJ-related protein-like  37.86 
 
 
353 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3701  bax protein, putative  37.26 
 
 
301 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4482  Bax domain-containing protein  36.27 
 
 
297 aa  123  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0872  uncharacterized FlgJ-related protein-like protein  35.78 
 
 
342 aa  123  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2111  transcriptional regulator, Fis family protein  38.24 
 
 
309 aa  121  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.951323  normal  0.43033 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2496  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  34.67 
 
 
293 aa  120  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0073  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  35.06 
 
 
239 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4066  hypothetical protein  34.58 
 
 
274 aa  115  6e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0151  hypothetical protein  35.35 
 
 
278 aa  115  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4946  hypothetical protein  34.11 
 
 
274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.481244  normal  0.092226 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3773  hypothetical protein  34.11 
 
 
274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03422  hypothetical protein  34.11 
 
 
274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.789583  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0140  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  34.11 
 
 
274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03373  hypothetical protein  34.11 
 
 
274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.766873  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3952  hypothetical protein  34.11 
 
 
274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0144  hypothetical protein  34.11 
 
 
274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3893  hypothetical protein  34.11 
 
 
274 aa  113  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1703  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  33.94 
 
 
243 aa  113  4.0000000000000004e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00443549  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1338  hypothetical protein  31.3 
 
 
257 aa  112  5e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1885  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  33.03 
 
 
244 aa  108  1e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1517  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  33.03 
 
 
243 aa  108  1e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3877  hypothetical protein  33.64 
 
 
307 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4046  hypothetical protein  33.64 
 
 
307 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.440608 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3860  hypothetical protein  33.64 
 
 
307 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.708471  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3986  hypothetical protein  33.64 
 
 
307 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3941  hypothetical protein  33.64 
 
 
307 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.855495 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0055  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain protein  33.33 
 
 
235 aa  104  2e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000359095  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0417  BAX protein  32.44 
 
 
322 aa  102  8e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1243  putative exported amidase  32.58 
 
 
302 aa  99.8  4e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1770  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  38.76 
 
 
223 aa  95.1  1e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3268  BAX protein  33.79 
 
 
307 aa  90.1  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0422  BAX protein  37.78 
 
 
174 aa  89.4  7e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4894  hypothetical protein  33.86 
 
 
228 aa  75.5  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02068  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  44.74 
 
 
74 aa  65.5  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0379414  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1199  LysM repeat-containing muramidase  34.88 
 
 
390 aa  42  0.01  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00727449  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>